G46089


Basic Information

Item Value
gene id G46089
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000006
NCBI id null
chromosome length 13024002
location 8481249 ~ 8498802 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU52429
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU52429 True 10297 lncRNA 0.33 3 8481249 8498802

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000006_08474273_08474602 RIMBP3B coding downstream 6647 8473987 ~ 8474602 (-)
CI01000006_08458656_08461261 NA coding downstream 19797 8458552 ~ 8461452 (-)
CI01000006_08437493_08455451 NA coding downstream 25508 8436893 ~ 8455741 (-)
CI01000006_08229755_08241410 SMPD4 coding downstream 239839 8228996 ~ 8241410 (-)
CI01000006_08225810_08227168 NA coding downstream 254081 8225691 ~ 8227168 (-)
CI01000006_08512030_08512578 NA coding upstream 12512 8511314 ~ 8512578 (-)
CI01000006_08557710_08600107 VAV2 coding upstream 58049 8556851 ~ 8600107 (-)
CI01000006_08675642_08697114 NA coding upstream 176653 8675455 ~ 8697869 (-)
CI01000006_08736720_08740065 NA coding upstream 237858 8736660 ~ 8740065 (-)
CI01000006_08749304_08751622 BRD3A coding upstream 249935 8748737 ~ 8753683 (-)
G46018 NA non-coding downstream 204920 8198232 ~ 8276329 (-)
G45986 NA non-coding downstream 400993 8080018 ~ 8080256 (-)
G45985 NA non-coding downstream 401553 8079468 ~ 8079696 (-)
G45970 NA non-coding downstream 441300 8039680 ~ 8039949 (-)
G45960 NA non-coding downstream 550555 7930402 ~ 7930694 (-)
G46199 NA non-coding upstream 477869 8976671 ~ 8976871 (-)
G46102 NA non-coding upstream 500291 8999093 ~ 9008209 (-)
G46076 NA non-coding upstream 515329 9014131 ~ 9016971 (-)
G46208 NA non-coding upstream 525337 9024139 ~ 9026251 (-)
G46257 NA non-coding upstream 597657 9096459 ~ 9096705 (-)
CI01000006_07500281_07507754 NA other downstream 970293 7500246 ~ 7507976 (-)
CI01000006_06974359_06976736 NA other downstream 1504377 6973224 ~ 6976872 (-)
CI01000006_04560607_04560993 NA other downstream 3919181 4559509 ~ 4562068 (-)
G43549 NA other downstream 4125821 4352510 ~ 4355428 (-)
G43102 NA other downstream 5547265 2908451 ~ 2933984 (-)
CI01000006_10453630_10483241 NA other upstream 1984054 10453613 ~ 10484006 (-)
G47658 NA other upstream 2532109 11030911 ~ 11033127 (-)
CI01000006_11651067_11653761 SMD3, SNRPD3, SNRPD3L, MGC52856 other upstream 3151561 11650363 ~ 11654424 (-)
CI01000006_12348300_12348961 GLRX other upstream 3835607 12347180 ~ 12349383 (-)
CI01000006_12569291_12581457 CELL, CEL.2, CEL.1 other upstream 3851957 12569205 ~ 12582487 (-)

Expression


Co-expression Network