CI01000016_07421716_07426983 (FHOD3B)


Basic Information

Item Value
gene id CI01000016_07421716_07426983
gene name FHOD3B
gene type coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000016
NCBI id null
chromosome length 12175457
location 7421590 ~ 7442256 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>CI01000016_07421716_07426983.mRNA
ACCTCTAGGTGTCGCCAAAACTCCGGCTCTTTCACTCATACCTTCAGTGTTGTGACTGGAGGGAGTCCCCCAGTCCCGCTCACGTACTGCATCGCTGTAGACATCAGACAGGCTGTAGATGTCCCGTCCCGTCTGCAGCAGTCTGCCTCAGCACCTTGCCTGCCCGACATGCCCTTGGATATTACCGGCCCTTCTCTTGCTATAAACTACTGCAGAAATATAGAGACCACTAAACATTAACAGAGGACATCGGAGTAGGACGGAGCGTACCTGGATTTTTGACACTTTTACACTGCGACTGATCTAAAGGAGTTTTAGTCGGTATACTTTTTTGTTGTTGTACCGACTTTTCCCAAATCGACGTGTATGGATGTATCATGGCTACGTTTGCATGCAGGGTGCAGTTCTTAGATGATACTGATCCATTTAATAGCACAAATTTTCCGGAGCCGACCAGACCCCCACATTTCACATTCAGAGAGGATATTCCGCTCATCAATCAGATCGCTGGAGTTCACAGACTTCTGAAAGCACCACACAAGGTATGACACCCCTAAAGCAAACATAGTTTTATTCACTATCTTTACATGACTGTTTATTAGATGTGTTTACACCTATTTCTGATGCACTGCAATAATGTTATTGCAGTAGTTCTGTAGGGCATCATGCAGTTATATGGCAAGCCTTTTTAACATTCATTTCCTAAAACTTATAACCAGCAGCATCTATATTTATGGTACTAGTTCTTTTTTAATTAAAAGTAAATACTCTAATGGTGACTAGAATGTCAATTTTTCATTAGATACTAGTACTTATTCATTAGTTACTTGCAACTATTCAAATATTTATTAGTATCTATTTATTAGACAGTACACTATACCAATTAGCATTCTAGTACGCTGGTATAATATAACTATTAAGTGGCTATTCTTAGTATTCATTTGTAAACAACAACTGTAACTAGTTAGATAAGAAATGTTACTAGTAGCAATTTAAGTAGATACAAGTTTTAATAAATAGATACTAATTTATTAGTGTTAATAAATCTGTACAAGTCTATTCAATGAGTACTTGGAATAGACACTTAAATATTTAAATAATTACATGTAACTAAAAATGCTAGTACTTAATAAATAGTTACTAGTAAAACTGCTTTTTGAAGTCTGAATTGCCTAGTTGATATTTAAACTTAAATATCAATATTCAATTCAGACTTCAAATACCAGTTTAAATTTCAAAATCATTGACAAAAATAGCAAATAGTTATCAAAACTAAAGGATAGTTACTTGTCACTACTGTAATAGTGACTAAAAGTATAAGTACTAATGACTAATTTAAATAGATACTAGTCACTGTTGGGTTAACTAGTACACTGTAAAAAGTGGTAACCTGCAATTGTTACTTTAAAGAGCTCTTTTTTGTTGGTAGAAATCTATGTATTTTTGTTGATTCTGTAATGTTAAATACTAATTTTGACTTAAATAAATATTAATTTAGTTAATTTAGATGTTTTCATTTTTCTTCAGTGTAATTGAAAATATACAAAAAAATAGATACAAGTTAATGTAAAACATTTAATGTTAAAATGACTTGCCATAGCATTTATGCAGTGCAAAGGCACTGTTAGGGAGAAGTGATATGATGTCAGGATACTTCAGTGCGTCTTACTCCGCACTGCACCAAGGTGGTGTCCTGTGCACCCAGGGGGTTGTTTGTTAATGTCAGTGCTTCTAAAACACATCTTTTCAGGCTGGAATAGTTAGTTATGCCGGTCTATTTAGAGACAGTCAATAGCAAAACTATATAACTGCATTGTTTATAAGCATTCATAAGTAATCAATTTCCAATGTCATAATAGGAATGACAGGTAGCTGGCGTTGATGTTGTGGATATTCACATCCTGTCTCTTCTCACAGCCTGTAATAAACCTCACCTCGAAATTACCCAGCTCTCCTTCATTACAGGCATGACCCAAAACAATCAAAGTTCTTCTCCAACTGTATAAGATATAATTGTTGTCTTAAACTTGCTTCATTTCCACCACATAAACAGTGTTATCCCTTAAGCAGGTTTTAGAAGCGCTGTTATTGTGGTCTTAGAGGAATGCACAGCAGCTGAGGGCCATACTTGGGTGGACTAAATGCTTGAGCATGCCATGTCTATATACTCAGGAATCTTCAGCTGTCATTGGCACTGTCAGTGATGAACGTTCAGATAAAAAGGGTCCTCCAAGGGGCTGGAACTTCCTGTTTGGTGTAGCTTATCCTATTGTTGTTTGCATAGGAACATTATTGTTCTCTTGTGTACTCAGAGTTAGACTGTAGATTCCAAACAGGTGAGCGTCAACTCTGTGTTGCCATTTGTTGGTTTGCGAATGTTCACCAGATAAGTCAATGTGACTCACCCACTACCAGTCATCAGTGAAACTTTTAGAGCACATCTGCTTCATTATGAGTGGACCATTTCTGTGATTTGAAGTACTAACCTTTCCAAAACAAACATGCATGGAAGTATTTCTGCGACTCACACTCAATCCCCATCATTAAGATGGGTCCTTAAGCCACTTTTTATAAATGACGAAACATTTTCAACAGATGGATAAACAAGTCCAGGTGCTCATTAGTTTTTTGACTTTTGTTTTAGAATTAGAATTTTGTACTGCTTCATACAAATGACCCTAATGACCGAATGTCTTCATAGACATATTTTCAGTGAAACATCTTGAACTGTTGATTTTGTAGTCCAAAAATGGGACAAAATTCATAAAGTATTATATCATTTGATCTTTCTAAGCTCTATTAGGGGATGAATACTGAACAAAACATCACAACATAATATATTATAACTTGAACAAAACATCAAGTTATAATATAGTATGTTTATAATTCAAATACACTCTTAAAAATAAAGGTTATTTATTAGTATTTATGGTTCCATGAAGAATCTTTAACATCCATGGAAACTTTCCATTGCACAGAAGGTTAAAAGAAGTTTCTTTAGATTATTAAAGTGTTCTTCACACTAAGAAAAGATGGTTGGTTCTTTCAAGAACTGTTTACTGAAAGCTTTTTTGGGGAACCCAATATGGTTCTTTCAATGCATCTCAATTACAGATTTGCGAAAAATTTTTGCGATATTTTTTAAATATCGATAAAAAACTATTGCGAAATGACAGCGTTTCTATTAACCGATGTTATGTGATTAAAATGTCTTTTTTCCTCTCGCGATAAGTCATTTAAAAAATCATGGCAACAGATGTTGGTAGGTTTACGTATATCCCAGCCACTGCACTAGCCAATATTTTTAATCAAAGGAGACGTAGGCATGTTATCCAAGCATTTATGGCAAGGAAAGCCCCTTATTCCTGGCCACAAATGAGCCACATATGAGGTGTTTCTCCCTCCTATCTGCTTCGAGGTCTTGATAAATTTAAATTGTGGCATTTCTTTGTTGTTTAGAATCCAGTAGTCCCGTAATACTTTTGTCTTTTATGAGTTTAATGAAGAACTCTCATCTTCTGTCCAAACACACTGCGCCCTCTTTAAAGAATGATCGACTTTTACATACGGCAGGTTACCTGTAAATGCGGAAAAATTCGGTTTCCATTGCAGTTTTGCAAAATATTCCTCTTTCGAATTGCCTGAAAAGCCACCTCATGCGAGGGTAAAAAATTTTTTTTTGCGATATATGGGAGTTTTTGCGAAATTGACGTGTTTCCAATTTCAATTTGCGCAATTTAAAGGGTAATGGATACGCGGCTACTGTGAAAAACCTTTTTTTGGAACGTTTATTTTTAAGAATGTATATATTCCAAGCATCAGTGTCCCAGAGAGAAATAAGCAGTCTTCAGGTGCTGCCATATTATTTACCGAATTTTCATGAGAAAAATTAAGTAATTTCAATAAGAAATCCACGCGATCTGGAACATTGCATGTGAGTGAAAGATTTCCCCAGGCAGATTTTGCAACACGTTCCATTTAGTCATGTGGATTTGCTGTGTTGACCAAACAGAAAGTTCTTTGATTTGAAAGTGAATTCTGTTTGAACTGTGCTTCTTATATCGCTACACTTTTAACAATTGGATTTTGCCCTCAAGTGACCGCGCCTTCAATGCAGAACACATACTGTGTGCAATTCAGAAACTAAAGTCGATAAAGTTTTAACAATCATATTTTCATAATTTGTGTCAGAAGTACAGATCTAAACATGTATATTTAATATTATAGTTCATACCTGTATTTTGAAAGGAAACATGTTCAATCGTGTAAGATTCGGTTCACTTCTGAAGGCAGCAGATCTGAAGGACTCTTTTTCCAGTAAACAGCATCCATTGGAACTTTGAATCCAAAAGTCAGCACCATTTTTTCTGGAGCCCAGTGCAGAGGGTAGTCTACTGTTATGTTTGTTTCAGTCATTTGCCATATATTTTAAATAGGATATGAATGACAAATATATTTCAGTACAGTAGGCTGTTGGGATTGCCAGTGCACCACAATGCACTAATCCAATCTAAGACAGCAACAGTATTGTAATTAAAATGCAGACTATGGGCCAAATTTGTTCACAACCTTTTTTCCAAAGGAAGATCAATGTAGTTATGATTCATACAAGTAAATCTGAGTATTTCCATTATGATATCTAAGTTGCTTCTATCCAGCAAGAGATGAATCCTCAGGAGTTTTCTCTGGTGCATCAGAAGGTCCCAGACAAGCAAATTTTTCTACTTTACTCCACACAATTTTCAGTTTAAAATTGTTGGCAGCTTAACAACATGAGATATGATTTAAACTCTTATTGAATAAACCGTTTGTTTTCCCAGATTTACTGCAATTAAGCAGCCAGTATAAGGAACCACAGCGATAAAATAAAGCATCATTGAAGTAAAGAGCTGCATGGTGACCAGTGAGACCGAGAAAGTCAGAAACGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACGGAGGAAAGGGGATGAGCTG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Function

symbol description
fhod3b Predicted to enable actin filament binding activity. Predicted to be involved in actin cytoskeleton organization. Predicted to act upstream of or within regulation of stress fiber assembly. Predicted to be active in cytoplasm and cytoskeleton. Human ortholog(s) of this gene implicated in hypertrophic cardiomyopathy. Orthologous to human FHOD3 (formin homology 2 domain containing 3).

NR:

description
Zgc:103746

GO:

id name namespace
GO:0007015 actin filament organization biological_process

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
CI01000016_07421716_07426983.mRNA True 16062 mRNA 0.37 4 7421590 7442256

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000016_07318179_07319855 NA coding downstream 101735 7318128 ~ 7319855 (-)
CI01000016_07242123_07296094 FHOD3 coding downstream 124888 7240773 ~ 7296702 (-)
CI01000016_07204062_07211287 NA coding downstream 209144 7203992 ~ 7212446 (-)
CI01000016_07191021_07191531 NA coding downstream 229799 7191008 ~ 7191791 (-)
CI01000016_07127481_07148708 NA coding downstream 272695 7127465 ~ 7148895 (-)
CI01000016_07474484_07477222 NA coding upstream 31002 7473258 ~ 7477222 (-)
CI01000016_07556411_07633132 DNAH11 coding upstream 114068 7556324 ~ 7633132 (-)
CI01000016_07718096_07737432 ABCB5 coding upstream 275796 7718052 ~ 7737432 (-)
CI01000016_07845474_07849395 HDAC9B coding upstream 403218 7845474 ~ 7849426 (-)
CI01000016_07871029_07871481 NA coding upstream 428645 7870901 ~ 7873013 (-)
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G97601 NA non-coding downstream 260964 7159973 ~ 7160626 (-)
G97594 NA non-coding downstream 298274 7122924 ~ 7123316 (-)
G97590 NA non-coding downstream 305764 7115592 ~ 7115826 (-)
G97589 NA non-coding downstream 306545 7114828 ~ 7115045 (-)
G97640 NA non-coding upstream 18935 7461191 ~ 7461463 (-)
G97646 NA non-coding upstream 38955 7481211 ~ 7534573 (-)
G97656 NA non-coding upstream 108696 7550952 ~ 7552253 (-)
G97970 NA non-coding upstream 261362 7703618 ~ 7703843 (-)
G97947 NA non-coding upstream 267723 7709979 ~ 7717050 (-)
G97341 NA other downstream 1261869 6158986 ~ 6159721 (-)
CI01000016_05412782_05415867 NA other downstream 2003373 5412248 ~ 5415906 (-)
CI01000016_05325805_05330265 COX6B2 other downstream 2090744 5325519 ~ 5332874 (-)
CI01000016_04921091_04922518 NA other downstream 2498186 4918975 ~ 4922518 (-)
CI01000016_03921124_03930996 NA other downstream 3490539 3920055 ~ 3931162 (-)
CI01000016_08893013_08893496 NPPCL, ANFC1 other upstream 1446577 8888833 ~ 8894737 (-)
CI01000016_08926089_08945071 NA other upstream 1494533 8925960 ~ 8945229 (-)
G98679 NA other upstream 1792740 9234996 ~ 9239929 (-)
G98691 NA other upstream 1813846 9256102 ~ 9257611 (-)
CI01000016_09510177_09512196 ID4 other upstream 2067366 9509622 ~ 9512428 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
zebrafish (Danio rerio) XLOC_010601 fhod3b coding NC_007127.7 CM002900.2 18689930 ~ 18960613 (-)