G207186


Basic Information

Item Value
gene id G207186
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000049
NCBI id null
chromosome length 9665442
location 1483827 ~ 1511946 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU235107
AACACTATGCCCATCATGCTAATCACTAATCCTGTGCTCATCACTCCAACCTAAGTATCAGAGCCATTATGTTGTGTAGTTCAACCTTGATTTGTCTAAATACTTTGAGCAAAAGAGTACAAAAGCTGTCACTGGTGACCTTTGTACCTTACCCCTAAAGGCTGCATTTTAGTACCATTAAGGTGCATATTAGTATCTTTTGAAAAGGTACCAATGATAACTTTTGTACCTTTTCTTCTAAAAGAGTGCACCTTCTGTTCAGGTATCTGCTTTTTTTGTTTATTTGTGTCTTCATATTTCATCAGTGACTACATGTTGTCAAACTTCACAGCTTCTTTACCTGTCAGTTTTCCGCAACACCATCTATCCAGATTCACAGCTGACAAAACCCTTAAAACACTGTACTGTTTTTGCCAAGTTTAACTCAAAAATTTGCACCTCTTATGTCAATTTTAAGACCAGCAAAAATGTTTATTTGGAAAATGAAAACTAATCTCTAATAATCAATTTCATTACTTCAGTGTCAATTTTGTGTGAGCTAATACATTTTTAAGTGGCTAAAATTTAAACAATACAACTGTCCAATTCAACGTCACTTTACAAAAAAACAGAATTAATACTTTCCATTATTTGAGCATTTGCTTTGCCAACAGATGCTGATTTTAAAAATAAAAGCAACTTCACATTTATACAAAGATAATTTTAAATGACCTTCAAAAGGTAATCCTTTAAAAGCTGATCTGATAATGGATTGTAGCAGTCAACTGATATTATATCAAACATCTGATTATAACAAAGTAGTTCCTAATAAAATCTGTCCCAGTTGTAGTAGTTGAAGTACAGTGAAAACCTGCCTATGAAAATGAAATATGTACCTGACTGGTTTTAACAATTAAGCAACAAATAGAAAAAAAAAAAAACATTCCAAAGACACAAATATTTACATTCATCCAGGCAGCTGGATATCAAAAAGTTCTGGCCCACACAAGCCATTCATAAAACAAAAATCTTTGGCCTTTGTACAACAGAAACATCTGTTGAGAATAAATACATAAAATGTATATACATTGTTGAAGTGAATTTAAAATATGATATTGAAATGGGGTAGAACACGAAAGCAAATTTCAATATAAAACAAAACCTATTTTTTTCTATCCTTGTTCACTATAGTCTTCCAGACACTATTTTGTAATACAATCTTTAAAAATCCCTATCCCGAGAATTAAATCTCAAATGTTTCCTTTCATGTTTTGATGGAATATTAACAACAAGAAAATATCAGTGTGTGCAAAAGTAAGCATTAAAGGCCTTAGGAAGGGAGTCTTTGGTTTCAATCAGTTTAGCATTTAGCTATGAGTAGCTCTCATTCTCATTCCAAGAAGTCATCCATTGTTTCTTCTCCGGAGGATCCATTTCCTCTTTCCCCGGCATATAGTCCCTCTCTTCCCTCTTTATCCGCACAGCGTTATAACTGGGTACGCTGTCATCATACTTGGAACGTTTGAAAAATCCACACTGTTCAGAAAAACAGGCAATTAGCATAGCGTCATGCTAACAATGCTCAACAGCATTTTTTATACAGGAAAATGAGCACAAAGACATAGTGATGTTTGCAGTGTGTGCAGCATGCCTAGCATGAGGTCAGAACAAAACATTCAATGTTTTAAAGAAGACATAAGCAAGAACCATATGTGCTGAAAGCGAGAGAGATGCTCCGGTAAATAACCCAAGCAGGCCAGAGAAATGTGCAAGTTTCACCTGAAGATGAGTAAGAGTGAACGCAAACATGTATAAACCCTTTTCCAACAACAACGACTTCATACATGATTAGTTTGCATTCCTCATAGCATTTTGCTTATGTCTGAGCAATGAAAGCCATGGAAACTGCCACCATTATCCCACATTTGGCATTGACATTCAGCATGTGCATCAGACTACAATAGATTAGCATGGGCTAAACCAGCACTTCATGCTAGCTCTGAGCACACAGGTCAACTTGATCTGCGAGTTCTTTTACCCTAAGAAAGAGGTTCTCGTTCTCTGTCAGTTTCTCTTTACGCATCTGAAGTCAGCCTCTCTTTTTCAGGTTCGTTACCGTCTTTGCCGCTTTTGCCGAAAAAACCACACTAAAAGGGGTAAAGGTTTGTGTTTTAAATACTTGATGTCATATGAATGAAAATTGTTTTACACCTTGTCAATGTTGAAAAAAGTGATGGTTAGTCCTAAATGGGTCAGGTTGTGAGTAGTCATGTGACCTTACCTTCCAAAGCAGGAAGACCAGTAGTCCCAACAAGAGGAGTCCTAGTAAAATGGCCACCAGAATGACCCACCAGGGCATACCACCATACTGTGCTACTTTGTGTTCGGGAAACACAGTAACGCGCACCTGTAACAAGACAAATTGTATTTCAGAGTGCGTTATTTTTTTAAGCCCTGCATAGCAAGTCAAACTGATAGAACATGGAACAAAATATGGAAGAAGAATGAATAAATGCTGTAAATGTCCTCACCTGTGCTGGCTCATTCTTCAGCCGTATATTTGAAGCTGAGGTCTTGAAATCGAGTGATGCCTTGACAATAATATCAATGTAGTTCATTTTTTCATAGTCCTGTAAGACATAGTTGAAATTAGCTAAAGTATACTTACAAATGATAAGGGTCAATGACATATAGTGTCCACTGTCCATGATGAAGAAAAGGAAAAATATTTAAAAAGGAAGGATAAATCTAGTTTATAACACATGTGCCAAGTTATTAGAAAGGTTCTCTTTGTATTCATGTTGGTTTCATGTTTTTTTTAAAGTTTTGTCATTGTCAAGAAATAAAATAATAATGATTTGTGTGATGTAACCATCAAGAAAAAAAAGACACCTTGAATACATGAGTGAACACATCTCATATGATGATGATTATTTTCAAAAAAGGTTTTGTAAACAGTTTGCAATGTAAAGGTATTTTTACAGACTTCATGAATTATTAATCCCACCACATAATTTTACCTTGACCCAAACTCACTTTTTTCTATTATTAATAAGCAACGAAGCAGTTTTGTTAAAATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAACATGAACATTTTTATGAACTAACATTAACAAAGGTTAATAAAACCTGACAGCAACATAGTGTCGGCCCAGATCCGGCCCACATCTGGTCCGCGTGTAATCCACATGTACCAGATGTGGGCCAGATCTGGGCCACACTATGTCGCTGTCTGGGAATGCTGTAAAAATATATTCTTCAATGTTAATTCATGTTAGTTAATGCATTGACTGTTAACAAATGACCTTATTGTAAAGTGTTATTAAATAAAGTTTCTTTTCAAGAATCACTATTTTAATGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTATCACCCTGACATTTTTTATTCAATATATATTCTGCAAATTTCTGAATGGATTGCATTGTCCATGAGTTTTTGAATAAATGTATACATTTAAAAATGAGGGCCACACCTCTAATGAAAGATCACACTCACCTCCAATAAGGTAGAGTTCCAAAGGTAAGCTCTCAGGCTAATGACAGCATTGCTGTCCATTCCTATTAGAGGGCATTTAAATTTTATACACTCCGCACCATCCTCACAGGACTAAAAACACAACAACAAGCCAGTGATTAGAAACAAGAGGCTGATTATCAATGATAAATGTTCACCAAGGAAATACATACAATGCATTTTGAAAAGAAAAAAAAAAATTCAGACCCCTTAATTTTTGCAGCCTTATGCTTAAATGTGTTTAATTATTGTTTTGAGGGTCTGAATACTTTTTAATACATGTGCAAAGTTATCACAAATTTCTGAGTAATTTAGTGTAGACCGTTGTGAACAGCATGCTGCAACATAAAATATGATTAAAAAAAAATTAAGGGGTCTGAATACTTTCTGAATGTTTGAGTGACTTTACCAAAACTGTGTATTTCCTCTTGTCAGTTAAAAGGGAGGCTGTTCCCTCCTTTGCCGGAGTTTCCACAATTTCACGTTTAGTTCGTGACACTGAAAGCTCCTAGATAACCGTGAAGTAGAACACACAATCAGTTAATTCCTTTATAGAGACAACTAATGTATTTATGAAATATGAGGGAAAACTAAAGATAAGTTAAGATATTAGGACTACCTTCAAATCGAGTTTGTTGACCTCTTCTGGATTGGAGCAGCTGAAGCTGTCTAAACCAGTTGAGGTAATCTTCATGAGGTACAGCAGCCACTTGCCTTGGGAGTTATGCTTAGGCCATTGAACAATCATAGATAGTGTGCCGAACGACTTAAGGGGTTTGCCCAAGTTTGTAACCTGTCAGTCAGTATCATTAACAAGATACATAGTTTAACAGGCTATTAAATAGAATCACATGTTTAACAGTTAGAATGCACTTAAAGAAATACTCATACAATCAAAGGAAGTATTGTAAATGTACAAAGTTCATTAAATGATGTTAGGATATCTAATATTTACCCTGAATTCATAGTCAATTGGACTGCCAACATCAGTTGCCAGTTTCATGGCACTCTCTCCTTTAACTTTTCCAGTAAAGTAGACCTGAGATGGCTTAGCTACCCTGAAGATGATACATGATGGCAGTATATCATGTTACAAAGTCAGGACATTGATAATATCATCATCAGAAGTGTAACTGAGAAATGATAGAGTAATCTGCAAACCTACCCTGTGAGGGACAAAAGCAGTTGAATCTTAACAATGACTTTGGCTTTGACTGCTTGTGTCTTGTTCAGTTCACTTGTCCTGCAAAAACAAAATGGATACATCAATATATAAATACTGACATTGTAAAGATGGAAGAAATTATTGAATTAGCTTTGATAATGTGCTTGTATCAAGAGTCGTGGTTACTCACGTTTTGAGATTGAGGTCAATTTCAATTTCAGTGGTATCCAAAGAAATTCCTCCCGTATTTAGAATGATGTAAAAACGTGTCTGAAAAAGTGTTT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>TU235106
AACACTATGCCCATCATGCTAATCACTAATCCTGTGCTCATCACTCCAACCTAAGTATCAGAGCCATTATGTTGTGTAGTTCAACCTTGATTTGTCTAAATACTTTGAGCAAAAGAGTACAAAAGCTGTCACTGGTGACCTTTGTACCTTACCCCTAAAGGCTGCATTTTAGTACCATTAAGGTGCATATTAGTATCTTTTGAAAAGGTACCAATGATAACTTTTGTACCTTTTCTTCTAAAAGAGTGCACCTTCTGTTCAGGTATCTGCTTTTTTTGTTTATTTGTGTCTTCATATTTCATCAGTGACTACATGTTGTCAAACTTCACAGCTTCTTTACCTGTCAGTTTTCCGCAACACCATCTATCCAGATTCACAGCTGACAAAACCCTTAAAACACTGTACTGTTTTTGCCAAGTTTAACTCAAAAATTTGCACCTCTTATGTCAATTTTAAGACCAGCAAAAATGTTTATTTGGAAAATGAAAACTAATCTCTAATAATCAATTTCATTACTTCAGTGTCAATTTTGTGTGAGCTAATACATTTTTAAGTGGCTAAAATTTAAACAATACAACTGTCCAATTCAACGTCACTTTACAAAAAAACAGAATTAATACTTTCCATTATTTGAGCATTTGCTTTGCCAACAGATGCTGATTTTAAAAATAAAAGCAACTTCACATTTATACAAAGATAATTTTAAATGACCTTCAAAAGGTAATCCTTTAAAAGCTGATCTGATAATGGATTGTAGCAGTCAACTGATATTATATCAAACATCTGATTATAACAAAGTAGTTCCTAATAAAATCTGTCCCAGTTGTAGTAGTTGAAGTACAGTGAAAACCTGCCTATGAAAATGAAATATGTACCTGACTGGTTTTAACAATTAAGCAACAAATAGAAAAAAAAAAAAACATTCCAAAGACACAAATATTTACATTCATCCAGGCAGCTGGATATCAAAAAGTTCTGGCCCACACAAGCCATTCATAAAACAAAAATCTTTGGCCTTTGTACAACAGAAACATCTGTTGAGAATAAATACATAAAATGTATATACATTGTTGAAGTGAATTTAAAATATGATATTGAAATGGGGTAGAACACGAAAGCAAATTTCAATATAAAACAAAACCTATTTTTTTCTATCCTTGTTCACTATAGTCTTCCAGACACTATTTTGTAATACAATCTTTAAAAATCCCTATCCCGAGAATTAAATCTCAAATGTTTCCTTTCATGTTTTGATGGAATATTAACAACAAGAAAATATCAGTGTGTGCAAAAGTAAGCATTAAAGGCCTTAGGAAGGGAGTCTTTGGTTTCAATCAGTTTAGCATTTAGCTATGAGTAGCTCTCATTCTCATTCCAAGAAGTCATCCATTGTTTCTTCTCCGGAGGATCCATTTCCTCTTTCCCCGGCATATAGTCCCTCTCTTCCCTCTTTATCCGCACAGCGTTATAACTGGGTACGCTGTCATCATACTTGGAACGTTTGAAAAATCCACACCTAAGAAAGAGGTTCTCGTTCTCTGTCAGTTTCTCTTTACGCATCTGAAGTCAGCCTCTCTTTTTCAGGTTCGTTACCGTCTTTGCCGCTTTTGCCGAAAAAACCACACTTCCAAAGCAGGAAGACCAGTAGTCCCAACAAGAGGAGTCCTAGTAAAATGGCCACCAGAATGACCCACCAGGGCATACCACCATACTGTGCTACTTTGTGTTCGGGAAACACAGTAACGCGCACCTGTGCTGGCTCATTCTTCAGCCGTATATTTGAAGCTGAGGTCTTGAAATCGAGTGATGCCTTGACAATAATATCAATGTAGTTCATTTTTTCATAGTCCTCCAATAAGGTAGAGTTCCAAAGGTAAGCTCTCAGGCTAATGACAGCATTGCTGTCCATTCCTATTAGAGGGCATTTAAATTTTATACACTCCGCACCATCCTCACAGGACAAAACTGTGTATTTCCTCTTGTCAGTTAAAAGGGAGGCTGTTCCCTCCTTTGCCGGAGTTTCCACAATTTCACGTTTAGTTCGTGACACTGAAAGCTCCTTCAAATCGAGTTTGTTGACCTCTTCTGGATTGGAGCAGCTGAAGCTGTCTAAACCAGTTGAGGTAATCTTCATGAGGTACAGCAGCCACTTGCCTTGGGAGTTATGCTTAGGCCATTGAACAATCATAGATAGTGTGCCGAACGACTTAAGGGGTTTGCCCAAGTTTGTAACCCTGAATTCATAGTCAATTGGACTGCCAACATCAGTTGCCAGTTTCATGGCACTCTCTCCTTTAACTTTTCCAGTAAAGTAGACCTGAGATGGCTTAGCTACCCCTGTGAGGGACAAAAGCAGTTGAATCTTAACAATGACTTTGGCTTTGACTGCTTGTGTCTTGTTCAGTTCACTTGTCGTTTTGAGATTGAGGTCAATTTCAATTTCAGTGGTATCCAAAGAAATTCCTCCCGTATTTAGAATGATGTAAAAACGTGTCTCAGCATTTCTTTTGAATGGATTTCCAAGTTCACAATCAGCTTGTGACCCATTTGTATTGGCTAAACAGTTGATCGGTTTACCACTAGATATAGTGCGAACGGCAGAATAAGAGAGGGATTTGGGGAACGAGGCAGTCAGCTGTGCTTCATAAGCATCTTCACCCAGGTTGGTCACATTGAGCTCCAGGGCAATGTCCTTCTGATCGCTAAAAGCAAGCATCGGAACTCCCTTTTCTTCAGGTAATGGACTAAATTTGTCTCTGTTCCCTGGATCCCTGGTGTGGAATTTATACTTTAGTTGCAGGTCACTCTGACATACATGGTCAGAACCACATCCTTCCTTGATGAATTGAACCTTGGTGACAGTGTTGGCTTCTTCGTTGGAGTCGAGTATGGGAAGCAGGTTAGGGAGTGCAGTCTGTCTTTTCCTGCGTGAGGATTGGCCCTGGATCTCCACAGAGACTTCAATGGGAATACCTCTCAGTTTGTCTTTTATATTTTCCTGCAGTTTGAGGGTTCTCTTAACACAGTTTTTTGTTCCCTGACCCTTGAGCTCTACGATCCCTTTGCTTTCATCCTCATTGATTGAGCCCGGGGTGAAGAGGACTCTAGAAGGAAGATTAAGTGTCTTCCTTTCAGATTCAACCCTGATGGTGTATGCCACCTTCAAGGTAGGATTGTAGGTTTTGGGGTTGGCTGAAAATTTGAAACAGGCTTCCACTTCAAGGCATATAGTGTTCCCACAGTTTTTCTGAGTGAGGTCTAGCTCCTTTGGTGTGGTGGTGACAGTCTTTTCAATGCTGATAACTGACCGTGCCCTGTACACAAACACTGAATCAGAGAGAGATCCAATAGCCAGATCAGGGTAAGAATTTCTGTCCAAATCCATATTCCCAGCAAGAGAGTATCCAAAGAGTTTCACATTGTGATCTTTTCCTTCAAGAACCTGGGCTCTGTTTAGGCCTTTAGGTGAACCGTGGAAGATATATACGTTTCCAGCTCCATTGTTGTCATATGGGGCACCAACAGCAACATCACCATATTTATCCAGGTTCACATCTCCCATGCTTTCCACAGCCAAACCGAACATGGAATAGGCGGCTCCCTCAATTCTCTTGGGGGTGATCTTGTCCCAAGCCCCTTCCTCATTTAGGTAAACATAGATGGCCCCACCGATATCACCGTCTTTAATAAAGTACTGAGGTGCTCCGACTACAATGTCATCCCACCCATCTTTATTGATGTCAAGCACTGCAAGGTCATAACCAAAGGAAGAGGCAAGTCCAGTACCCTCTAGTATGTACTCAGCCGTCAACATGGAAGGTTTATCTTCTTCCTTCTTTAAAAGCACAACTGCCCCGCTGTGATTGGCTCTTGGAGCCCCAGCAACTATAGTCAACTGACCTCTCTTGGTCAGCATTTTTCCAGAGTCCAGAGAGAAACCTAAATAACTGTTAGCAGGTACTGGCACCAAGTCTGGATCAAGTCGGTTTTCATCTCCAACCTCAAATGGGCCGTCATCAAAAATATTTTGGTCCCACAGAGAGTTGTTGTTCTGTTCCATCCGCACCACTCCTTTCCAGTTGTAAGCACCCGGTGCTCCAAACACCATATAGTGATAGTCCTTTGTGAATGTGGCAGACAGACCCTGCTGGCATGAACCAAACCGCTCATGTCCTCTGTTTCTCCCATTACAGAACATCCAGTTTCCTCCATCTTCACCTGAGACTTCATTAATCGTCAGATCCTGGCTTAGTACATAGCAACGACCTGTCAAGTCACGCAGCTCCTGAGGTGCGCCCACAAATAAGCGCCGCTGGTAGCGATGCGCACAGACCAATATCTTTCCTCCAGGTCCCTGGCTCTGTATAGTAACTCCCATCCACTGGTTTTGCTTATTTTCGTCCGACAGGTTTTCTTCATTGTCAAACATTACTCGTTGGCATGACTGACTGGTAGAAGTTATGTCACAGTTGTACATGCCTCCCGTAATTTGTGACTTCTGATTGGACAATGCTTTAGCTCTTGGGGCACCAACCAGCAACATTCTTTTATCAGATGGTTGGAGTTGTCGGTGCATGGCCAGGGAAAAACCGAACAAGCTGTTTTTATCTCCCGTTTTCTTGATAACATTATCTTTGTCCAGGTTGAAGGCAGAGATCAGCGTCCATCCCAAAAAACTGAGAAGCGGTAATGTTAAAGTCCTGTAAGGTCCCATTGTGATGTTGAGTTCCGTTCGTGTCAGGTTCTTGCTTTGGAGTTGAGACTTGCAGCCTGCTTCTGC

Function

NR:

description
PREDICTED: V-type proton ATPase subunit E 1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU235107 False 7336 lncRNA 0.34 2 1483827 1511946
TU235106 True 4780 lncRNA 0.41 26 1487630 1511946

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000049_01464880_01465976 DLX2B coding downstream 16567 1464555 ~ 1467260 (-)
CI01000049_01430548_01446088 DIS3 coding downstream 37635 1429996 ~ 1446192 (-)
CI01000049_01340906_01399870 DACH1, DACHC coding downstream 83957 1340906 ~ 1399870 (-)
CI01000049_01302622_01311542 UBAC2 coding downstream 172127 1302611 ~ 1311700 (-)
CI01000049_01247902_01262425 IGF2BP2, IGF2BP2B coding downstream 221402 1247460 ~ 1262425 (-)
CI01000049_01515304_01535924 NA coding upstream 2862 1514808 ~ 1536149 (-)
CI01000049_01549129_01580150 KCNQ5B coding upstream 36494 1548440 ~ 1580150 (-)
CI01000049_01678202_01768140 NA coding upstream 166256 1678202 ~ 1768140 (-)
CI01000049_01773383_01778313 CENPK coding upstream 260822 1772768 ~ 1778809 (-)
CI01000049_01782181_01783289 LBX1B coding upstream 269790 1781736 ~ 1784055 (-)
G207181 NA non-coding downstream 637 1482958 ~ 1483190 (-)
G206907 NA non-coding downstream 60888 1421212 ~ 1422939 (-)
G207162 NA non-coding downstream 73680 1409777 ~ 1410147 (-)
G207159 NA non-coding downstream 81065 1402498 ~ 1402762 (-)
G207158 NA non-coding downstream 82165 1401427 ~ 1401662 (-)
G207188 NA non-coding upstream 99040 1610986 ~ 1624316 (-)
G207187 NA non-coding upstream 126713 1638659 ~ 1657288 (-)
G207228 NA non-coding upstream 280062 1792008 ~ 1792326 (-)
G207235 NA non-coding upstream 305390 1817336 ~ 1817748 (-)
G207208 NA non-coding upstream 389147 1901093 ~ 1902140 (-)
G206938 NA other downstream 656182 825859 ~ 827645 (-)
G206850 NA other downstream 850632 632680 ~ 633195 (-)
G206849 NA other downstream 852251 631143 ~ 631576 (-)
G207278 NA other upstream 475065 1987011 ~ 1988767 (-)
G209491 NA other upstream 4516143 6028089 ~ 6028469 (-)
CI01000049_08056071_08059039 TIMM10.S, TIMM10, TIMM10.L other upstream 6543687 8055633 ~ 8059179 (-)
CI01000049_08452153_08453389 CISD2 other upstream 6939196 8451142 ~ 8454233 (-)
G211175 NA other upstream 6953347 8465293 ~ 8476265 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location