G227053


Basic Information

Item Value
gene id G227053
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000053
NCBI id null
chromosome length 7014373
location 3734124 ~ 3745623 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU257645
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU257645 True 11346 lncRNA 0.39 2 3734124 3745623

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000053_03696522_03699590 NA coding downstream 34425 3696458 ~ 3699699 (-)
CI01000053_03665103_03666630 NA coding downstream 66424 3664590 ~ 3667700 (-)
CI01000053_03625343_03653163 NA coding downstream 80790 3624970 ~ 3653334 (-)
CI01000053_03620673_03622682 NA coding downstream 111439 3620240 ~ 3622685 (-)
CI01000053_03592810_03602102 NA coding downstream 131687 3592655 ~ 3602437 (-)
CI01000053_03823296_03825234 NA coding upstream 77471 3823094 ~ 3825328 (-)
CI01000053_04276080_04288879 FAM101A coding upstream 530417 4276040 ~ 4288879 (-)
CI01000053_04415119_04415646 NA coding upstream 669438 4415061 ~ 4415646 (-)
CI01000053_04423076_04430502 RASSF2A coding upstream 677453 4423076 ~ 4430502 (-)
CI01000053_04450920_04470110 SLC23A2 coding upstream 705221 4450844 ~ 4470110 (-)
G227071 NA non-coding downstream 4413 3729478 ~ 3729711 (-)
G227051 NA non-coding downstream 26514 3706539 ~ 3707610 (-)
G227236 NA non-coding downstream 97841 3635717 ~ 3636283 (-)
G227046 NA non-coding downstream 113947 3617608 ~ 3620177 (-)
G227069 NA non-coding downstream 127635 3603898 ~ 3606489 (-)
G227563 NA non-coding upstream 218107 3963730 ~ 3965498 (-)
G227573 NA non-coding upstream 240369 3985992 ~ 3990212 (-)
G227578 NA non-coding upstream 252816 3998439 ~ 4004359 (-)
G227581 NA non-coding upstream 260701 4006324 ~ 4039233 (-)
G227605 NA non-coding upstream 339424 4085047 ~ 4085957 (-)
CI01000053_03551506_03551965 NA other downstream 181153 3550333 ~ 3552847 (-)
G226963 NA other downstream 736856 2996717 ~ 2997268 (-)
G226826 NA other downstream 1167052 2565892 ~ 2567072 (-)
CI01000053_02225226_02226481 YPELD, YPEL2B, YPEL1, YPELC, YPEL2 other downstream 1496728 2225210 ~ 2226481 (-)
G225812 NA other downstream 2267392 1459595 ~ 1466732 (-)
G227604 NA other upstream 341614 4087237 ~ 4087740 (-)
G228651 NA other upstream 2038860 5784483 ~ 5787690 (-)
G228750 NA other upstream 2185969 5931592 ~ 5932241 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
zebrafish (Danio rerio) XLOC_035925 NA non-coding NC_007119.7 CM002892.2 44275846 ~ 44308036 (+)
rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) G488697 NA non-coding NC_048570.1 CM023224.2 24921185 ~ 24921431 (-)