XLOC_009835 (macc1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_009835
gene name macc1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 19637384 ~ 19677375 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

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Function

symbol description
macc1 Acts upstream of or within embryonic cranial skeleton morphogenesis. Predicted to be active in cytoplasm. Is expressed in eye; midbrain hindbrain boundary; otic vesicle; stomodeum; and telencephalon. Orthologous to human MACC1 (MET transcriptional regulator MACC1).

GO:

id name namespace
GO:0048701 embryonic cranial skeleton morphogenesis biological_process
GO:0005737 cytoplasm cellular_component

KEGG:

id description
ko04990 Domain-containing proteins not elsewhere classified

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-091006-3 Acts upstream of or within embryonic cranial skeleton morphogenesis. Predicted to be active in cytoplasm. Is expressed in eye; midbrain hindbrain boundary; otic vesicle; stomodeum; and telencephalon. Orthologous to human MACC1 (MET transcriptional regulator MACC1).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000040717

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_009834 sp8b coding upstream 98608 19536614 ~ 19538776 (+)
XLOC_009833 NA coding upstream 123393 19508738 ~ 19513991 (+)
XLOC_009831 NA coding upstream 224963 19375634 ~ 19412421 (+)
XLOC_009832 NA coding upstream 256092 19380866 ~ 19381292 (+)
XLOC_009830 rapgef5b coding upstream 485584 19029297 ~ 19151800 (+)
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XLOC_009826 NA non-coding upstream 1125185 18502566 ~ 18512199 (+)
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XLOC_009848 NA non-coding downstream 1007565 20684940 ~ 20695517 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000016_07743396_07746536 MACC1 coding CI01000016 null 7743088 ~ 7747383 (+)