RNA id: TCONS_00016665



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00016665
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_008292
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 5855111 ~ 5855225 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TCTGGCAACTAGCTTTTCCCacctctcacatggttgcccactgaagctaagcaaggctgtgCCTGGTTGGCACCTGGTTGGGAGATCACATGAGAAAGATAGGTTGCTGCCAGAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000181607

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00018886 lncRNA upstream 1769 5841557 ~ 5853342 (+) True XLOC_008291
TCONS_00018885 lncRNA upstream 383603 5468360 ~ 5471508 (+) True XLOC_008289
TCONS_00018884 lncRNA upstream 384260 5468098 ~ 5470851 (+) False XLOC_008289
TCONS_00018883 lncRNA upstream 576208 5277903 ~ 5278903 (+) True XLOC_008279
TCONS_00018755 lncRNA upstream 598329 5256501 ~ 5256782 (+) True XLOC_008278
TCONS_00018887 lncRNA downstream 303784 6159009 ~ 6160503 (+) True XLOC_008297
TCONS_00018756 lncRNA downstream 930424 6785649 ~ 6786055 (+) True XLOC_008304
TCONS_00018888 lncRNA downstream 1012051 6867276 ~ 6875548 (+) True XLOC_008306
TCONS_00018757 lncRNA downstream 1285185 7140410 ~ 7140882 (+) True XLOC_008308
TCONS_00018758 lncRNA downstream 1879264 7734489 ~ 7737531 (+) True XLOC_008311
TCONS_00016664 mRNA upstream 224659 5628363 ~ 5630452 (+) True XLOC_008290
TCONS_00016663 mRNA upstream 490603 5360407 ~ 5364508 (+) True XLOC_008288
TCONS_00016662 mRNA upstream 510607 5343186 ~ 5344504 (+) True XLOC_008287
TCONS_00016661 mRNA upstream 513732 5339056 ~ 5341379 (+) True XLOC_008286
TCONS_00016660 mRNA upstream 520855 5332900 ~ 5334256 (+) True XLOC_008285
TCONS_00016666 mRNA downstream 46745 5901970 ~ 5916820 (+) True XLOC_008293
TCONS_00016667 mRNA downstream 68626 5923851 ~ 5943845 (+) False XLOC_008294
TCONS_00016668 mRNA downstream 68626 5923851 ~ 5946785 (+) False XLOC_008294
TCONS_00016669 mRNA downstream 68767 5923992 ~ 5958803 (+) True XLOC_008294
TCONS_00016670 mRNA downstream 118684 5973909 ~ 6017920 (+) False XLOC_008295
TCONS_00016634 other upstream 2348688 3506309 ~ 3506423 (+) True XLOC_008259
TCONS_00016623 other upstream 3169405 2685055 ~ 2685706 (+) True XLOC_008246
TCONS_00016622 other upstream 3180521 2673935 ~ 2674590 (+) True XLOC_008245
TCONS_00016611 other upstream 3496486 2358511 ~ 2358625 (+) True XLOC_008239
TCONS_00016606 other upstream 3981333 1873658 ~ 1873778 (+) True XLOC_008236
TCONS_00016677 other downstream 703825 6559050 ~ 6559185 (+) True XLOC_008299
TCONS_00016680 other downstream 823296 6678521 ~ 6727082 (+) True XLOC_008301
TCONS_00016681 other downstream 915361 6770586 ~ 6772120 (+) True XLOC_008302
TCONS_00016699 other downstream 2827597 8682822 ~ 8682937 (+) True XLOC_008317
TCONS_00016700 other downstream 2876527 8731752 ~ 8731866 (+) True XLOC_008318