RNA id: TU362279


Basic Information

Item Value
RNA id TU362279
length 25056
lncRNA type intronic
GC content 0.37
exon number 4
gene id G318538
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000106
NCBI id null
chromosome length 3151683
location 132837 ~ 191144 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome
species grasscarp
(Ctenopharyngodon idella)

Sequence

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TGTTGGTGTTTGTTGCCGTTTGTCGGTGTGGTGTGAATTGGCCTTAATAAGGAGGA

Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
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TU362285 lncRNA downstream 26070 106084 ~ 111460 (-) True G318542
TU362277 lncRNA upstream 1156 164012 ~ 191144 (-) True G318538
TU362300 lncRNA upstream 76143 238999 ~ 239586 (-) True G318557
TU362336 lncRNA upstream 215171 378027 ~ 381236 (-) True G318589
TU362369 lncRNA upstream 383748 546604 ~ 546892 (-) True G318610
TU362370 lncRNA upstream 384426 547282 ~ 547548 (-) True G318611
CI01000106_00249711_00261211.mRNA mRNA upstream 86675 249531 ~ 261607 (-) True CI01000106_00249711_00261211
CI01000106_00301563_00318741.mRNA mRNA upstream 138608 301464 ~ 319267 (-) True CI01000106_00301563_00318741
CI01000106_00404235_00474818.mRNA mRNA upstream 241379 404235 ~ 474818 (-) False CI01000106_00404235_00474818
CI01000106_00512101_00521608.mRNA mRNA upstream 349035 511891 ~ 521834 (-) True CI01000106_00512101_00521608
CI01000106_00524817_00538057.mRNA mRNA upstream 361380 524236 ~ 538094 (-) False CI01000106_00524817_00538057
TU362275 other downstream 31846 103901 ~ 105684 (-) True G318537
TU362282 other upstream 311732 535495 ~ 535553 (-) True G318540
TU362269 other upstream 374246 537102 ~ 537431 (-) False G318535
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TU362271 other upstream 374310 537166 ~ 537431 (-) False G318535
TU362272 other upstream 374310 537166 ~ 537431 (-) True G318535

Expression Profile