RNA id: TCONS_00038861


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00038861
length 136
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_019739
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007132.7
NCBI id CM002905.2
chromosome length 45934066
location 33136948 ~ 33137083 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

acttatggcacttccgttcccctcctcggggaacgaagggttacttctgtaacctcgaacgttactcactgaagctaagcagggctgtcagtacctggatgggagaccacacaggaaaactaggttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000167277

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00038858 lncRNA downstream 46744 33058625 ~ 33090204 (-) False XLOC_019737
TCONS_00039675 lncRNA downstream 46991 33058753 ~ 33089957 (-) False XLOC_019737
TCONS_00039674 lncRNA downstream 47246 33058753 ~ 33089702 (-) False XLOC_019737
TCONS_00039253 lncRNA downstream 47275 33058754 ~ 33089673 (-) True XLOC_019737
TCONS_00039673 lncRNA downstream 53261 33058753 ~ 33083687 (-) False XLOC_019737
TCONS_00039676 lncRNA upstream 8169 33145252 ~ 33146525 (-) True XLOC_019740
TCONS_00038863 lncRNA upstream 328192 33465275 ~ 33477963 (-) True XLOC_019742
TCONS_00039677 lncRNA upstream 500079 33637162 ~ 33638641 (-) False XLOC_019743
TCONS_00039678 lncRNA upstream 500079 33637162 ~ 33646880 (-) True XLOC_019743
TCONS_00039679 lncRNA upstream 2508455 35645538 ~ 35650096 (-) True XLOC_019755
TCONS_00038860 mRNA downstream 10251 33093331 ~ 33126697 (-) False XLOC_019738
TCONS_00038859 mRNA downstream 10251 33093331 ~ 33126697 (-) True XLOC_019738
TCONS_00038856 mRNA downstream 104232 33006949 ~ 33032716 (-) True XLOC_019736
TCONS_00038854 mRNA downstream 104233 33006650 ~ 33032715 (-) False XLOC_019736
TCONS_00038853 mRNA downstream 104233 33006650 ~ 33032715 (-) False XLOC_019736
TCONS_00038862 mRNA upstream 74223 33211306 ~ 33229950 (-) True XLOC_019741
TCONS_00038864 mRNA upstream 587896 33724979 ~ 33851877 (-) False XLOC_019744
TCONS_00038865 mRNA upstream 588283 33725366 ~ 33995710 (-) False XLOC_019744
TCONS_00038866 mRNA upstream 597026 33734109 ~ 33995710 (-) False XLOC_019744
TCONS_00038867 mRNA upstream 836012 33973095 ~ 33995213 (-) True XLOC_019744
TCONS_00038828 other downstream 1054799 32076707 ~ 32082149 (-) True XLOC_019725
TCONS_00038827 other downstream 1055570 32073529 ~ 32081378 (-) False XLOC_019725
TCONS_00038821 other downstream 1799163 31337670 ~ 31337785 (-) True XLOC_019722
TCONS_00038809 other downstream 2142399 30974165 ~ 30994549 (-) True XLOC_019715
TCONS_00038807 other downstream 2248574 30886127 ~ 30888374 (-) True XLOC_019714
TCONS_00038875 other upstream 1293377 34430460 ~ 34536374 (-) True XLOC_019748
TCONS_00038902 other upstream 3935868 37072951 ~ 37073080 (-) True XLOC_019765
TCONS_00038929 other upstream 4926114 38063197 ~ 38063314 (-) True XLOC_019777
TCONS_00038943 other upstream 5590016 38727099 ~ 38730018 (-) False XLOC_019784
TCONS_00038955 other upstream 6130142 39267225 ~ 39267306 (-) True XLOC_019791