RNA id: TCONS_00038929


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00038929
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_019777
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007132.7
NCBI id CM002905.2
chromosome length 45934066
location 38063197 ~ 38063314 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TatcagggtgatatggctgtggcagcCCAAGACCGATTACTCACTGTAggtaagcagggctgagcctggttagtacctggatgggagaccactagggaacactaggttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000115716

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00038925 lncRNA downstream 92042 37968040 ~ 37971155 (-) False XLOC_019775
TCONS_00038913 lncRNA downstream 412881 37644896 ~ 37650316 (-) True XLOC_019770
TCONS_00039682 lncRNA downstream 430489 37594351 ~ 37632708 (-) False XLOC_019769
TCONS_00039683 lncRNA downstream 430564 37621675 ~ 37632633 (-) True XLOC_019769
TCONS_00039255 lncRNA downstream 440677 37621343 ~ 37622520 (-) False XLOC_019769
TCONS_00039256 lncRNA upstream 393969 38457283 ~ 38458134 (-) False XLOC_019779
TCONS_00038931 lncRNA upstream 393969 38457283 ~ 38463146 (-) True XLOC_019779
TCONS_00038937 lncRNA upstream 542079 38605393 ~ 38618668 (-) True XLOC_019781
TCONS_00039684 lncRNA upstream 565994 38629308 ~ 38632907 (-) True XLOC_019782
TCONS_00038942 lncRNA upstream 662888 38726202 ~ 38730597 (-) False XLOC_019784
TCONS_00038928 mRNA downstream 32059 38013077 ~ 38031138 (-) True XLOC_019776
TCONS_00038927 mRNA downstream 32159 37996822 ~ 38031038 (-) False XLOC_019776
TCONS_00038924 mRNA downstream 89378 37967457 ~ 37973819 (-) False XLOC_019775
TCONS_00038926 mRNA downstream 90116 37970344 ~ 37973081 (-) True XLOC_019775
TCONS_00038923 mRNA downstream 90785 37966933 ~ 37972412 (-) False XLOC_019775
TCONS_00038930 mRNA upstream 65563 38128877 ~ 38153824 (-) True XLOC_019778
TCONS_00038932 mRNA upstream 446151 38509465 ~ 38582061 (-) False XLOC_019780
TCONS_00038933 mRNA upstream 447771 38511085 ~ 38581903 (-) False XLOC_019780
TCONS_00038934 mRNA upstream 455460 38518774 ~ 38582061 (-) True XLOC_019780
TCONS_00038935 mRNA upstream 522372 38585686 ~ 38619305 (-) False XLOC_019781
TCONS_00038902 other downstream 990117 37072951 ~ 37073080 (-) True XLOC_019765
TCONS_00038875 other downstream 3526823 34430460 ~ 34536374 (-) True XLOC_019748
TCONS_00038861 other downstream 4926114 33136948 ~ 33137083 (-) True XLOC_019739
TCONS_00038828 other downstream 5981048 32076707 ~ 32082149 (-) True XLOC_019725
TCONS_00038827 other downstream 5981819 32073529 ~ 32081378 (-) False XLOC_019725
TCONS_00038943 other upstream 663785 38727099 ~ 38730018 (-) False XLOC_019784
TCONS_00038955 other upstream 1203911 39267225 ~ 39267306 (-) True XLOC_019791
TCONS_00038972 other upstream 2014637 40077951 ~ 40081929 (-) True XLOC_019807
TCONS_00038990 other upstream 2339946 40403260 ~ 40411647 (-) True XLOC_019813
TCONS_00039012 other upstream 3188117 41251431 ~ 41251548 (-) True XLOC_019825