RNA id: TCONS_00049594



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00049594
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.57
exon number 1
gene id XLOC_025061
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 8389555 ~ 8389671 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


caccacagccatgtcaccctgcagcccaagaccggttactcactgaagctaagcagggctgagcctggtcagtacctggatgggagaccactagggaacgctagcttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000179280

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00049590 lncRNA upstream 286864 8094011 ~ 8102691 (+) True XLOC_025058
TCONS_00049587 lncRNA upstream 594695 7782563 ~ 7794860 (+) False XLOC_025056
TCONS_00052320 lncRNA upstream 636381 7714364 ~ 7753174 (+) True XLOC_025055
TCONS_00052592 lncRNA upstream 831028 7510588 ~ 7558527 (+) True XLOC_025053
TCONS_00052591 lncRNA upstream 877945 7493581 ~ 7511610 (+) True XLOC_025052
TCONS_00052321 lncRNA downstream 416647 8806318 ~ 8806749 (+) True XLOC_025062
TCONS_00052322 lncRNA downstream 424384 8814055 ~ 8814377 (+) True XLOC_025063
TCONS_00052593 lncRNA downstream 458096 8847767 ~ 8849729 (+) True XLOC_025065
TCONS_00052323 lncRNA downstream 485285 8874956 ~ 8875830 (+) True XLOC_025066
TCONS_00052324 lncRNA downstream 588561 8978232 ~ 8978689 (+) True XLOC_025067
TCONS_00049592 mRNA upstream 92305 8290595 ~ 8297250 (+) False XLOC_025060
TCONS_00049593 mRNA upstream 92742 8295335 ~ 8296813 (+) True XLOC_025060
TCONS_00049591 mRNA upstream 162346 8224622 ~ 8227209 (+) True XLOC_025059
TCONS_00049589 mRNA upstream 555049 7822948 ~ 7834506 (+) True XLOC_025057
TCONS_00049588 mRNA upstream 569715 7808459 ~ 7819840 (+) True XLOC_025056
TCONS_00049595 mRNA downstream 435711 8825382 ~ 8836344 (+) False XLOC_025064
TCONS_00049596 mRNA downstream 437234 8826905 ~ 8831282 (+) False XLOC_025064
TCONS_00049597 mRNA downstream 437342 8827013 ~ 8836722 (+) True XLOC_025064
TCONS_00049610 mRNA downstream 682135 9071806 ~ 9091825 (+) False XLOC_025082
TCONS_00049611 mRNA downstream 688236 9077907 ~ 9088394 (+) False XLOC_025082
TCONS_00049575 other upstream 2018753 6360881 ~ 6370802 (+) True XLOC_025032
TCONS_00049569 other upstream 2351217 6038203 ~ 6038338 (+) True XLOC_025028
TCONS_00049552 other upstream 4119009 4269354 ~ 4270546 (+) True XLOC_025004
TCONS_00049514 other upstream 6585073 1782815 ~ 1804482 (+) False XLOC_024964
TCONS_00049598 other downstream 638823 9028494 ~ 9028642 (+) True XLOC_025069
TCONS_00049599 other downstream 641699 9031370 ~ 9031520 (+) True XLOC_025070
TCONS_00049600 other downstream 646005 9035676 ~ 9035776 (+) True XLOC_025072
TCONS_00049601 other downstream 646519 9036190 ~ 9036296 (+) True XLOC_025073
TCONS_00049602 other downstream 647046 9036717 ~ 9036823 (+) True XLOC_025074

Expression Profile


//