RNA id: TCONS_00070552



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00070552
length 637
RNA type processed_transcript
GC content 0.38
exon number 2
gene id XLOC_036035
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007119.7
NCBI id CM002892.2
chromosome length 54304671
location 50966806 ~ 50967999 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


tgtaatctgtatgcaATGTACAGTATAAGTCCTGCAAATCTCAATGACGGAGATTTTTGTAACTTGTAAACAAGGAGGCCGCTgtcatttttggagatttgccaTCAATAATAAGCTgggaattacttcagaagaccaaaACAATCAGACAAGACATTATTTTGAGGATGATATtgcttaagatgTAAACAGAAACTGACATTAAAGgaggttggtgtcatgatctTGTTTCCTTTGAGTGCGCATTAGATAAAAACAAGCAGACTTTGTGTGTTTTGAACACTATTTgagacagttgtttaattttattcatgATTCCAAATATGaacgtaagcttggcaaacagctttggagaatttgatgtttccccagtCAAACAGAACTGCTCAAcaagcgtttcaaagatggccgccgagtgaaattacttgccttaaaggaatTTTAGTACGGTTAAGGTTAGGGTTGGGGGGAGGCCACTCTTCAATAATGTTACTTTCTTTATACTAATAAATTCATACAAACTAGTCCCTCGGCAAACAGCTTTGGAGAATTTGAAGTTTCCTCATTCAAACAGACTTGCCCaggaggcgtttcaaagatggccgccgagtaaaattacttgccttagatgaatttt

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000149043

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00072291 lncRNA upstream 434618 50531703 ~ 50532188 (+) False XLOC_036030
TCONS_00072290 lncRNA upstream 452773 50508918 ~ 50514033 (+) True XLOC_036029
TCONS_00072289 lncRNA upstream 693328 50256786 ~ 50273478 (+) True XLOC_036027
TCONS_00072288 lncRNA upstream 924991 50038691 ~ 50041815 (+) True XLOC_036024
TCONS_00072287 lncRNA upstream 1343092 49616496 ~ 49623714 (+) True XLOC_036019
TCONS_00070553 lncRNA downstream 11019 50979018 ~ 50986475 (+) False XLOC_036036
TCONS_00072292 lncRNA downstream 192607 51160606 ~ 51165849 (+) True XLOC_036038
TCONS_00072294 lncRNA downstream 613730 51581729 ~ 51586703 (+) False XLOC_036039
TCONS_00072293 lncRNA downstream 613730 51581729 ~ 51586703 (+) True XLOC_036039
TCONS_00072295 lncRNA downstream 757647 51725646 ~ 51726902 (+) True XLOC_036040
TCONS_00070551 mRNA upstream 3917 50953776 ~ 50962889 (+) True XLOC_036034
TCONS_00070550 mRNA upstream 16257 50946379 ~ 50950549 (+) True XLOC_036033
TCONS_00070549 mRNA upstream 16260 50942240 ~ 50950546 (+) False XLOC_036033
TCONS_00070548 mRNA upstream 127242 50743037 ~ 50839564 (+) True XLOC_036032
TCONS_00070547 mRNA upstream 189056 50742975 ~ 50777750 (+) False XLOC_036032
TCONS_00070554 mRNA downstream 15552 50983551 ~ 51027541 (+) False XLOC_036036
TCONS_00070555 mRNA downstream 17799 50985798 ~ 51027041 (+) True XLOC_036036
TCONS_00070556 mRNA downstream 82555 51050554 ~ 51126840 (+) False XLOC_036037
TCONS_00070558 mRNA downstream 116994 51084993 ~ 51147594 (+) False XLOC_036037
TCONS_00070557 mRNA downstream 116994 51084993 ~ 51147594 (+) True XLOC_036037
TCONS_00070536 other upstream 1147935 49801662 ~ 49818871 (+) True XLOC_036021
TCONS_00070526 other upstream 1586503 49378890 ~ 49380303 (+) True XLOC_036016
TCONS_00070520 other upstream 1861755 49092039 ~ 49105051 (+) False XLOC_036010
TCONS_00070506 other upstream 2233948 48732153 ~ 48732858 (+) True XLOC_036001
TCONS_00070498 other upstream 2439260 48514551 ~ 48527546 (+) False XLOC_035995
TCONS_00070562 other downstream 1193862 52161861 ~ 52162964 (+) True XLOC_036043
TCONS_00070576 other downstream 1562938 52530937 ~ 52543392 (+) False XLOC_036052
TCONS_00070587 other downstream 2055540 53023539 ~ 53023617 (+) True XLOC_036064
TCONS_00070588 other downstream 2055680 53023679 ~ 53023764 (+) True XLOC_036065
TCONS_00070598 other downstream 2277643 53245642 ~ 53255762 (+) True XLOC_036071

Expression Profile


//