RNA id: XM_026929698.2


Basic Information

Item Value
RNA id XM_026929698.2
length 12609
RNA type mRNA
GC content 0.42
exon number 9
gene id znf704
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047617.1
NCBI id CM018563.1
chromosome length 20335669
location 8551057 ~ 8611452 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome
species striped catfish
(Pangasianodon hypophthalmus)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG: NA

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU403151 lncRNA upstream 59143 8489679 ~ 8491914 (+) True G340248
TU403089 lncRNA upstream 139699 8399218 ~ 8411358 (+) True G340197
TU403071 lncRNA upstream 292353 8257791 ~ 8258704 (+) False LOC113536074
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TU403162 lncRNA downstream 2034 8613486 ~ 8617041 (+) True G340257
TU403206 lncRNA downstream 57127 8668579 ~ 8668782 (+) True G340297
TU403267 lncRNA downstream 232822 8844274 ~ 8845684 (+) True G340336
TU403270 lncRNA downstream 239516 8850968 ~ 8859663 (+) True G340339
XR_004577075.1 lncRNA downstream 264505 8875957 ~ 8891060 (+) False LOC117595890
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XM_026929700.2 mRNA upstream 4688 8511632 ~ 8546369 (+) False pag1
XM_026929703.2 mRNA upstream 4688 8511684 ~ 8546369 (+) False pag1
XM_026930237.2 mRNA downstream 34068 8645520 ~ 8660591 (+) True zbtb10
XM_026930092.2 mRNA downstream 103041 8714493 ~ 8718570 (+) True hey1
XM_034298594.1 mRNA downstream 125707 8737159 ~ 8750226 (+) False si:dkeyp-120h9.1
XM_026929738.2 mRNA downstream 125708 8737160 ~ 8750226 (+) True si:dkeyp-120h9.1
XM_026929740.2 mRNA downstream 125708 8737160 ~ 8750226 (+) False si:dkeyp-120h9.1
TU403100 other upstream 265853 8282960 ~ 8285204 (+) True G340208
TU401977 other upstream 1833911 6711015 ~ 6717146 (+) True G339324
TU401948 other upstream 1935185 6604657 ~ 6615872 (+) False mturn
TU401842 other upstream 2207186 6339507 ~ 6343871 (+) False LOC113535938
TU400576 other upstream 4196028 4352522 ~ 4355029 (+) True G338163
TU403493 other downstream 301476 8912928 ~ 8915844 (+) True sem1
TU403492 other downstream 301521 8912973 ~ 8915844 (+) False sem1
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TU405030 other downstream 2680872 11292324 ~ 11294030 (+) False smim12

Expression Profile