RNA id: TCONS_00009353



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00009353
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.47
exon number 1
gene id XLOC_004721
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007123.7
NCBI id CM002896.2
chromosome length 49182954
location 24214401 ~ 24214517 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TTCACCAGCCAAATCACCTTGCATCCCAAGAcaggttactcactaaagctaagcagtgctaagcctggtcagtacctggatgtgaGACCACAagagaaaactaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000177681

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00010737 lncRNA upstream 354969 23812530 ~ 23859432 (+) False XLOC_004717
TCONS_00010736 lncRNA upstream 435224 23778952 ~ 23779177 (+) True XLOC_004716
TCONS_00010935 lncRNA upstream 563345 23649892 ~ 23651056 (+) True XLOC_004713
TCONS_00010933 lncRNA upstream 608679 23589024 ~ 23605722 (+) False XLOC_004711
TCONS_00010738 lncRNA downstream 729655 24944172 ~ 24944504 (+) True XLOC_004726
TCONS_00009368 lncRNA downstream 858788 25073305 ~ 25075120 (+) False XLOC_004728
TCONS_00010739 lncRNA downstream 859001 25073518 ~ 25075120 (+) True XLOC_004728
TCONS_00009371 lncRNA downstream 987026 25201543 ~ 25214727 (+) False XLOC_004731
TCONS_00010936 lncRNA downstream 991014 25205531 ~ 25214727 (+) False XLOC_004731
TCONS_00009352 mRNA upstream 137260 24060894 ~ 24077141 (+) True XLOC_004720
TCONS_00009350 mRNA upstream 161322 23991276 ~ 24053079 (+) False XLOC_004719
TCONS_00009351 mRNA upstream 161322 23991639 ~ 24053079 (+) True XLOC_004719
TCONS_00009344 mRNA upstream 279068 23866368 ~ 23935333 (+) False XLOC_004717
TCONS_00009343 mRNA upstream 279068 23866368 ~ 23935333 (+) False XLOC_004717
TCONS_00009354 mRNA downstream 127786 24342303 ~ 24636681 (+) False XLOC_004722
TCONS_00009356 mRNA downstream 130094 24344611 ~ 24637303 (+) False XLOC_004722
TCONS_00009359 mRNA downstream 130446 24344963 ~ 24640339 (+) False XLOC_004722
TCONS_00009360 mRNA downstream 130446 24344963 ~ 24640339 (+) False XLOC_004722
TCONS_00009358 mRNA downstream 130446 24344963 ~ 24640339 (+) False XLOC_004722
TCONS_00009349 other upstream 282386 23923325 ~ 23932015 (+) True XLOC_004717
TCONS_00009347 other upstream 303452 23910832 ~ 23910949 (+) True XLOC_004718
TCONS_00009341 other upstream 348048 23838799 ~ 23866353 (+) False XLOC_004717
TCONS_00009336 other upstream 637010 23577266 ~ 23577391 (+) True XLOC_004712
TCONS_00009332 other upstream 1104124 23110163 ~ 23110277 (+) True XLOC_004708
TCONS_00009355 other downstream 127814 24342331 ~ 24345493 (+) False XLOC_004722
TCONS_00009361 other downstream 203707 24418224 ~ 24418340 (+) True XLOC_004723
TCONS_00009364 other downstream 350961 24565478 ~ 24565592 (+) True XLOC_004724
TCONS_00009372 other downstream 1009282 25223799 ~ 25251787 (+) False XLOC_004732
TCONS_00009380 other downstream 1253795 25468312 ~ 25477906 (+) True XLOC_004734