RNA id: TCONS_00009361


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00009361
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_004723
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007123.7
NCBI id CM002896.2
chromosome length 49182954
location 24418224 ~ 24418340 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGCCACAAccttatcaccctgcagcccaagactggttacacgctgaagctaagcatggctgagcctggtcaatacctggatgggagatcacatgggaaaactaggttgctgttagaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000182453

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00010737 lncRNA upstream 558792 23812530 ~ 23859432 (+) False XLOC_004717
TCONS_00010736 lncRNA upstream 639047 23778952 ~ 23779177 (+) True XLOC_004716
TCONS_00010935 lncRNA upstream 767168 23649892 ~ 23651056 (+) True XLOC_004713
TCONS_00010933 lncRNA upstream 812502 23589024 ~ 23605722 (+) False XLOC_004711
TCONS_00010738 lncRNA downstream 525832 24944172 ~ 24944504 (+) True XLOC_004726
TCONS_00009368 lncRNA downstream 654965 25073305 ~ 25075120 (+) False XLOC_004728
TCONS_00010739 lncRNA downstream 655178 25073518 ~ 25075120 (+) True XLOC_004728
TCONS_00009371 lncRNA downstream 783203 25201543 ~ 25214727 (+) False XLOC_004731
TCONS_00010936 lncRNA downstream 787191 25205531 ~ 25214727 (+) False XLOC_004731
TCONS_00009352 mRNA upstream 341083 24060894 ~ 24077141 (+) True XLOC_004720
TCONS_00009350 mRNA upstream 365145 23991276 ~ 24053079 (+) False XLOC_004719
TCONS_00009351 mRNA upstream 365145 23991639 ~ 24053079 (+) True XLOC_004719
TCONS_00009348 mRNA upstream 485648 23912074 ~ 23932576 (+) False XLOC_004717
TCONS_00009346 mRNA upstream 514086 23892972 ~ 23904138 (+) False XLOC_004717
TCONS_00009362 mRNA downstream 143492 24561832 ~ 24636401 (+) False XLOC_004722
TCONS_00009363 mRNA downstream 144327 24562667 ~ 24635682 (+) True XLOC_004722
TCONS_00009365 mRNA downstream 320622 24738962 ~ 24770190 (+) True XLOC_004725
TCONS_00009367 mRNA downstream 534562 24952902 ~ 24958792 (+) False XLOC_004727
TCONS_00009366 mRNA downstream 534562 24952902 ~ 24958792 (+) True XLOC_004727
TCONS_00009355 other upstream 72731 24342331 ~ 24345493 (+) False XLOC_004722
TCONS_00009353 other upstream 203707 24214401 ~ 24214517 (+) True XLOC_004721
TCONS_00009349 other upstream 486209 23923325 ~ 23932015 (+) True XLOC_004717
TCONS_00009347 other upstream 507275 23910832 ~ 23910949 (+) True XLOC_004718
TCONS_00009341 other upstream 551871 23838799 ~ 23866353 (+) False XLOC_004717
TCONS_00009364 other downstream 147138 24565478 ~ 24565592 (+) True XLOC_004724
TCONS_00009372 other downstream 805459 25223799 ~ 25251787 (+) False XLOC_004732
TCONS_00009380 other downstream 1049972 25468312 ~ 25477906 (+) True XLOC_004734
TCONS_00009383 other downstream 1229787 25648127 ~ 25648243 (+) True XLOC_004738
TCONS_00009419 other downstream 2716529 27134869 ~ 27134967 (+) True XLOC_004762