XLOC_011126 (tmem222a)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_011126
gene name tmem222a
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 54930747 ~ 54942534 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00021659
GTTCGGCTAGCGCTCGGCTTTTTCCGGCGGCGCGTGTGCGGGCGTCATGACGTCAGCGCGCACTCTGTGATGGCGGATGTAAGCGAGATTGACACCATGAAGCACTACCACGGCGGTTTCGAGAAAATTGACAGAGAAATGAGCCGGTACCCGCACTGTATCGTCTGGACACCGATCCCGGTACTGACCTGGTTCTTGCCCTTCATTGGCCACATGGGCATCTGCAGCTCCGCCGGGGTGATCCGGGATTTCGCAGGACCGTACTTCGTCTCAGAGGACAACATGGCCTTCGGGAAACCAACCAAATACTGGAAGCTGGATAAGAACAAAGTGTATGGTGGTGGAGCAAACGCCTGGGATGTGGCCGTACATGAAGCGTCGGAGGAATACAAGAACAGAATGCACAATCTGTGTTGTGATAACTGTCACTCTCATGTGGCCATGGCTCTGAATCTGATGCGCTACAACAACAGCTCATCCTGGAACATGGCTAACCTGTGCCTGCGCTTCCTCATCCACAGCAAACACGTCAGCTTCGTGGGGTTTCTGAAGACCTGGCTGCCTTTCCTGATGATTTGTGGGGTCATCGTCACCATCGCCCTTGCCGTCAACCTGCGGTGACTGATGCATGCTGGGAAACGGCGCCGACAGGAGCATCAAACACTGAGAGATGCTGCACAGGATTAACCCAAACTCAGGATTAGCAAGAGTCACGGCTGTAAAACTCAATCAAATGTGAATCTGCTGGAATTACAGAGAGCGCTCCACACCTCACGACTCGCAGATTGTGTGTACATATGTGAATTACGGGGACGCTTTACATTACAGGAGCTTCAACAGGAGATATCATCATATCACACATGCAGAATATCAGTGGCTTACAGTGAAGAAACGCTTCCCATCGAGATGAGCTGCATTCGAAGAAGTGTGCACTCTGAAATATGATGGGTTGTTTTAACACAATGTTTGGTCAGATATGGAccaacccaactgttgggttaaaaaaaagagCAGTTTTAATTCAGTTAAAATAATTCAGCATATTTGACCCAaggttgtgtttatttattgtttaaatataaatgacactttttaaactCAGTGGTTGggttttcccagtgttgggtcaatttaattaaatttaaatgacactttttaactcagcagttgtgtttgtccatatttaactcaaatttgggttaatttattgaattatatttaaattacaccTTGAAAACTCAATAATTGGGTCAGTCTATATTTGGCCCAACGTTGggtcaatttaattaattaaatttaaattacaattttaaaactcaatagttgggtttgtctatatttgacccaatgttgagtcaatttaaatgacactttttaaacaCAATGGTTGTGTcagtctatatttgacccaacgctgggtcaatttaattaattctatttaaatgacactttttggtTGACACTTAATGGttgagtttgttcatatttgacccaacattgaatttatttagttcaatttaaatgacactttttaactcggcagttgtgtttgtccatatttaactcAATGTTGAgttaatttattgaattatatttaaattacacttttaaaaCTCAATATAGTTTGGTCTGTCCATATTTGGCCCAACATTGggtcaattcaattaattaaatttaaattacaattttaaaactcAATAGTTGGGTTtctctatatttgacccaacattgagtttattaattcaatttaaatgacactttttaactcaGTGGTTGTGtctgtctatatttgacccaacagtgggtcaatttaaaaataagtaaaatttttaaacacaatgGCTGAGtctgtctatatttgacccaatgctgggtcaatttaattaattctatttaaatgacactttttggtTGACACTTAATGGTTGAGCTTGTTCATATTTAACCGAacattgaatttatttaattaaatttaaatacaattttaaaactcAATATAGTTGGGTCTGTCTATATTTGGCTAGACGTTTggtcaatttaattaattaaatttaaattacagttttaaaactCAATAGttgagtttgttcatatttgacccatgcaacattgaatttatttaattaaatttaaatgacactttttaactcaGTGGTTGGGtctgtctatatttgacccaacattgggttaatttattgaattaaatttaaatgacacttttaaaactCAGCagttgtgtttgtccatatttaactcaacattgggttaatttattgtattaaatttaaattacactttgaaAACGTTATAGTTGGGTCCGTCTATATTTGGCCCAACTCTGggtcaatttaattaattaaatttaaattactatTTTAAAACTCAAtagttgggtttgttcatatttgacccaacattgaatttatttaatttagtttaaatgacactttttaactcaGCAGTTGTGTTTCTCTATATTTGACTCAACGTTGGGTTAATTTATTGACtgtaatttaaatgacacttttaaaactCAATAGTTGGGTCTGTCTATATTCCACCTAACATGGgatttgttaattaaattataattacacATTTTATCTCAACAATTGGGTTTCTTTATATTTGACCCAATTGTgggtcaatttaattaaatttaaatgacaagcGCAGTGATTGGGTTTGTCCTTATTTGATCAGAATTTAAGttgatatattgaattatttaaatgacactttttaactcaACAGTTgtttttgtctatatttgaccctaTGTTGGGTTAATTTGTTTTTAgtgaatttacattattttaacactacttttgtttttgtttttcaaatttgacccaacattgagtcAATTTATTAAACTCAAATGACAATTTTTAAACACTacatttgggtttgtccatatttgacccagcattgtgTTAAACAGCCCAGTGTTTTTTGAATGTAAGCATGGAAATCCCCTTCGTGTTTTTGTTTTCCTTGTGTTTAATCTGTTTCAGGATGTTTACAGGATGTTTATATCGTGCTCTTTTATTGGGAGTTTCTACATTTGGTTCATTCCTTTTGATTTTTATgtcttcatttatattttatgacCAAATACAAACGTATATCCATGA
>TCONS_00021660
GTGTTCGGCTAGCGCTCGGCTTTTTCCGGCGGCGCGTGTGCGGGCGTCATGACGTCAGCGCGCACTCTGTGATGGCGGATGTAAGCGAGATTGACACCATGAAGCACTACCACGGCGGTTTCGAGAAAATTGACAGAGAAATGAGCCGGTACCCGCACTGTATCGTCTGGACACCGATCCCGGTACTGACCTGGTTCTTGCCCTTCATTGGCCACATGGGCATCTGCAGCTCCGCCGGGGTGATCCGGGATTTCGCAGGACCGTACTTCGTCTCAGAGGACAACATGGCCTTCGGGAAACCAACCAAATACTGGAAGCTGGATAAGAACAAAGTGTATGGTGGTGGAGCAAACGCCTGGGATGTGGCCGTACATGAAGCGTCGGAGGAATACAAGAACAGAATGCACAATCTGTGTTGTGATAACTGTCACTCTCATGTGGCCATGGCTCTGAATCTGATGCGCTACAACAACAGCTCATCCTGGAACATGGCTAACCTGTGCCTGCGCTTCCTCATCCACAGCAAACACGTCAGCTTCGTGGGGTTTCTGAAGACCTGGCTGCCTTTCCTGATGATTTGTGGGGTCATCGTCACCATCGCCCTTGCCGTCAACCTGCGGTGACTGATGCATGCTGGGAAACGGCGCCGACAGGAGCATCAAACACTGAGAGATGCTGCACAGGATTAACCCAAACTCAGGATTAGCAAGAGTCACGGCTGTAAAACTCAATCAAATGTGAATCTGCTGGAATTACAGAGAGCGCTCCACACCTCACGACTCGCAGATTGTGTGTACATATGTGAATTACGGGGACGCTTTACATTACAGGAGCTTCAACAGGAGATATCATCATATCACACATGCAGAATATCAGTGGCTTACAGTGAAGAAACGCTTCCCATCGAGATGAGCTGCATTCGAAGAAGTGTGCACTCTGAAATATGATGGGTTGTTTTAACACAATGTTTGGTCAGATATGGAccaacccaactgttgggttaaaaaaaagagCAGTTTTAATTCAGTTAAAATAATTCAGCATATTTGACCCAaggttgtgtttatttattgtttaaatataaatgacactttttaaactCAGTGGTTGggttttcccagtgttgggtcaatttaattaaatttaaatgacactttttaactcagcagttgtgtttgtccatatttaactcaaatttgggttaatttattgaattatatttaaattacaccTTGAAAACTCAATAATTGGGTCAGTCTATATTTGGCCCAACGTTGggtcaatttaattaattaaatttaaattacaattttaaaactcaatagttgggtttgtctatatttgacccaatgttgagtcaatttatttaattaaatttaaatacaattttaaaactcAATATAGTTGGGTCTGTCTATATTTGGCTAGACGTTTggtcaatttaattaattaaatttaaattacagttttaaaactCAATAGttgagtttgttcatatttgacccatgcaacattgaatttatttaattaaatttaaatgacactttttaactcaGTGGTTGGGtctgtctatatttgaccc

Function

symbol description
tmem222a Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Orthologous to human TMEM222 (transmembrane protein 222).

GO:

id name namespace
GO:0008150 biological_process biological_process
GO:0016020 membrane cellular_component
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component
GO:0003674 molecular_function molecular_function

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-050306-17 Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane. Orthologous to human TMEM222 (transmembrane protein 222).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000069589

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00021659 False 3137 mRNA 0.35 6 54930747 54942532
TCONS_00021660 True 1582 mRNA 0.42 7 54931706 54942534

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_011125 tpbgl coding downstream 1934 54925437 ~ 54928813 (-)
XLOC_011124 kdf1a coding downstream 11487 54890835 ~ 54919260 (-)
XLOC_011123 zbtb7b coding downstream 120283 54804815 ~ 54810464 (-)
XLOC_011122 khdc4 coding downstream 130545 54785264 ~ 54800202 (-)
XLOC_011121 NA coding downstream 163554 54761897 ~ 54767193 (-)
XLOC_011127 wdtc1 coding upstream 5234 54947768 ~ 54978981 (-)
XLOC_011128 NA coding upstream 56452 54998986 ~ 54999993 (-)
XLOC_011129 zgc:114181 coding upstream 60587 55003121 ~ 55028791 (-)
XLOC_011130 cmc1 coding upstream 163011 55105545 ~ 55122776 (-)
XLOC_011131 NA coding upstream 249638 55192172 ~ 55204179 (-)
XLOC_010626 CR392024.2 misc downstream 34035572 20895112 ~ 20895175 (-)
XLOC_011119 NA non-coding downstream 333326 54594910 ~ 54597421 (-)
XLOC_011118 NA non-coding downstream 398657 54526409 ~ 54532090 (-)
XLOC_011114 NA non-coding downstream 491591 54436976 ~ 54439156 (-)
XLOC_011111 NA non-coding downstream 634303 54291662 ~ 54296444 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000086_02897831_02901375 TMEM222, TMEM222A, TMEM222B coding CI01000086 null 2897804 ~ 2901375 (-)