G403725


Basic Information

Item Value
gene id G403725
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000299
NCBI id null
chromosome length 6567443
location 132613 ~ 136933 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU464075
CATGACATCATATCCTGTTCCTTCTAAAATAATTCTGTATTAATCTTACATGCTTATTATCTAGTGTGTCCATCCTTTGATCAGTTGGTTAATCATGTCACTCATTGAATCTTTCATTCAGTAACCATCTCAATATCACACTCTTTCACCAATCACAGTTCAGTATGCAAATAAATTCAAGAACGAGGACCAATCGCTATTCAGTTTGCATGATGACATCAACACAGTCACTTCATTTTTAATGGTGAACATGCTGTCAAAGGGACAGTTTCTTCATTTTCTTAAAAAGTATAAAGTTTACAAAACCCAACAAGCACACTTAAGACTGAAATGATGCAGAAAATAAAGTTTGACTGGAGTCTGTATACGTTTAGGGCTGAATTAATGGCAGAAGTTTAATACTGAGGAAAAGAGATCGAGAACAAACCCAAACCAGAATGTTTGCTGAGTACAAACACTGTGAATATCCACTATCTTTAATGTGGGAGATTCACGGGGGGCCGCACTGTTAGTCGATAGCTTCAGGAGTGAAGACAAAGACCCTCAGAAGCAGACAAAGCAGAAAAGGGTCGGTCGATGCCCTTGAGGCATCACTGAAGAGAAGAGTGCTTGTTCTGGGGGTCTTTTGGCCTTAATGCATGGCATTGAGTTTCAGGTCTACTTGCTCCGTGATGCAGCAGGGGAAGTGCAGGATGTCGGCCAAGCTGTTAGCAGAGCTTCAAAACTAGGGCCAAGGCACAGATTCAACCTAAGCAAATCATGACCTTTATGTGACTCCAACTAACCCATCTGTAGCAGTCAATGAATCAACCTTTCACCAGCTGGAGGGGCGGCCACACTAGACCTCCGCCCGATCGCTTTCATTCATACTCATGTACAGTAGAGGCCTTTGCTACATTTTCCTGGTTCACTTCAAACAGCACTCGCAACAGAAAAGGCCTCCGCTTGCGCTCGAAAAAGAGCCCCACCCCCAACAAACACACAGTGCATACACCAGGGTGAGAAATTAATAGGGGCTTGGGGCAAAAAGGCCACCAAAATGAATAAAAATGCTTCCAAAAAAACAAGATATGGTGCAAAAAAGTCTCTGTATAAGTTCTTGTTTTTATTATTTATAAACAATATCACAGAAGCAAAAGTGCTGCTTTCCCAAAAATCAGCAGCATGTTTGCAAATGTGATATTGATTATATTGATAAAGCAATAAGTTAATAGGCTAGGTGACTTACATTTTAGACACAATATTGTCAATATTGTCAGTTTATCCTTTTTTTTCCTCTCTGAAAAGGGCTTCTGAACTGCAAAGGCCGCCTCTGCTCGTGTAAACACGGGGTATGCGAGAATGTGCGTAGGACTTTCTGACCTGGAAATCTGCATTTGTAAAAAAGATGCTTGGCCAATTCGTAACATTAACATCACTGATTCACCTCCTGGCTAAACATCAAACGCTCATTTTGACATCAGTACCTGTTTACAAGAACATGAACTTACACTACTGAAGAAAAGAGAAACTTTTGTTGTAGAGTCGCTAGGGCATTTCTATGCAGTTGCTATGGTGTTCAAATTGGCTTCCAGATTGTTGCTAGGATGCTATTGGTGTTTGTTAGTGTTGTATGTAGTTGCTAGGGCATTTCTAAGTAGTTTCTATTGTGTTTTGGGTGGTTGCTATGGTGCTCAAAGTGATTTCTAAGATGTTCTTGGTCTTTGCTACAGAAGATTGTTTTGGTAGTTGCTAGGGCATTTCTATGCAGTTGCTATGATGCTCAGAGTGTTGTAGAGTTGCTAGGGCATTTCTATGCAGTTGCTATGGTGTTCAAATGGGTTTCCAGATTGTTGCTAGGATGCTATTGGTGTTTGTTAGTGTTGTAGGGAGTTGCTAGGGCATGTCTATGCAGTTGCTAGGATTTTATTGCTCTTTACTACAGTAAATTATTGTAAGTAGGGCATTTCTAAGTAGTTTCTATTGTGTTTTGGGTGGTTGCTATGGTGCTCAAAGTGGTTTCTAAGCTGTTTCTAAGATGTTCTTGGTCTTTTGCTACAGAAGATTGTTTTGGTAGTTGCTATGGTGTATCTATGCAGTTGCTATGGTGTTAAAAGTGATCTAAGACTGTTGAAAGTATGCTCTTGGTGATTGCTAGAATGTTGTAGAGTTGCTAGGGCATTTCTATGCAGTTGCTATGGTGTTCAAATTGGTTTCCAGATTGTTGCTAGGATGCTATTGGTGTTTGTTAGTGTTGTAGGGAGTTGCTAGGGCATTTCTATGCAGTTGCTAGGATTTTCTTGGTCTTTACTACAGTAAATTATTGTAAGTAGGGCTGTTTCTAAGATGTTCTTGGTCTTTTGCTACAGAAGATTGTGTTGGTAGTTGCTAGGGTTTTTCTATGCAATTGCCATGGTGTTCTAGGTGGTTGCTATGTTGTTCAAAGTGGTTTCTAAGCTGTTTCTAGGATGTTCTTGGTCTTTGCTACATTAGATTTTTGTAGGTAGTTGCTATGGTGTATCTATGCAGTTGCTATGGTGTTAAAAGTGGTCTAAGACTGTTGCAAGTATGCTCTTGGTGATTGTTAGAATGTTGTAGTTGCTAGGGCATTTCTATGCAGCTGCTAGGATTTTCTTGGTCTTTACTACAGTAAATTATTGTAAGTAGGGCGTTTCTAAGAAGATTCTATTGTGTTGTGGGTGGTTGCTATGGTGCTCAAAGTGGTTTCTAAGCTGTTTCTAAGCTACAGAAGATTGTTTTGGTAGTTGCTAGGGTGTTGAAAGTGGTTTCCACACTGTTGCTGGAAAGCTCTTAGTGTTTGTTAGTGTTGTAGGTAGTTGCTAGGGTGTTTATATGCAGCTGCTAGAATGTTCTTGTCTACTGCTACAGTAGATTGTGGTAGGTAGTTGCTAGGGCATTTCTATACAGTTGCTATGGTGTTCGGGGTGGTTGGTAGGATTGTGCTATGATGCTATTAGTGCTTAAGTTACTAAAGTGTTGTGGGTAGTTGCTTAGGTGTTTCTATGCAGTTGTCATGGTGCTCTGGGTGTTTCCTAGGCTGTTGCTAGGTAGTTGTAACAGCATTTTTTTAGTGTTCACTGCAGAGTTGCTTATCAATTCCTAAGGTGTTGCTAACAGTTGCTAAGGTGTTCTGGATGGTTGCTAGAGTGTTGCTAGCTAGCTAGACAGATGTGTCAAGCTACATGTTTTGTATTGTCGCTGGAAACAGAATAGGTATATTTTAACATTGTGAATTAAAAAAAAATCTTCAAACTTTATATATTCTTTCAGGTCCAAATTAATTTAACATTCTTAAAATCTAGTGTGACCGCCCCTGTTGCATTACAGTTAACCAGTTGACAATGGTTGGCTAGTTAGTTTTTAGAGGGATCGGTTGGTCAGAGCTGGTCAACTCTGGATGGGTTAGAAAACAAAACTGAACAGTGCATACAGTACGACAATGAACAATGTCACAAAATCACAGATAAAATATCATCTTTCACATTGTGACATGGGTTCAGCTCCTCCCATGTCTCGCAAAAGGAGAGTAGCACCATATTCAGAAGAATCATGGTATAAACTAGTATCTTTAAACCCTGATCTGGAAGCAAAAGTTCTCTTTGGAGCTTGATGTAGTGTAATATAATCCTTCAGTTTGTCAAAACCTGCTTGGATCTTGGCAGGTATCTCATCAGAGTGTAAAAAAGTCTTCTTTAACATTTCTTGTTTCAATGTAGACTGACGAAACGTTTATAAATCCAACAAAAAGTGTTCCCGGCTGATATAAGAATGTGCTTAGTGCAATATTTGAGTAATTTGCCCTGGTCGTTGACTCTGATTCAGTAGTTATTTCCTCTGAGAGTGTAGTTGCTCCTTTCAGGCGGTGCATAACGTGACGAGACGCGTCCCAGAGTTTTTCAGTTGTCACCACGGCTTCCAGGTCGGAAGGGGACAACTGTACTGTCTTTGTCAATCCAGCTCCAGCTCCATGAGTTTGTTGCGAGAGCGTGGAGTAGGTGTAGTGGTTTTACAGCAGCAGTGAGCACAGACCAGGCCCAGGGCGAGAGAAAAGAAGCCTACAGTTACTGAAGCGCAGATCCCATACAGTAAAGGCA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU464075 True 4094 lncRNA 0.40 2 132613 136933

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000299_00169255_00170695 NA coding upstream 32290 169223 ~ 170986 (-)
CI01000299_00185106_00209299 NA coding upstream 47841 184774 ~ 209299 (-)
CI01000299_00448948_00449565 NA coding upstream 311930 448863 ~ 449757 (-)
CI01000299_00452374_00452868 NA coding upstream 314408 451341 ~ 452868 (-)
CI01000299_00670925_00672195 NA coding upstream 533747 670680 ~ 673625 (-)
G403714 NA non-coding downstream 16514 93601 ~ 116099 (-)
G403737 NA non-coding upstream 97107 234040 ~ 234262 (-)
G403772 NA non-coding upstream 102604 239537 ~ 239755 (-)
G403738 NA non-coding upstream 103280 240213 ~ 240461 (-)
G403773 NA non-coding upstream 104217 241150 ~ 242770 (-)
G403774 NA non-coding upstream 105893 242826 ~ 243621 (-)
G404372 NA other upstream 933674 1070607 ~ 1075891 (-)
G404784 NA other upstream 1522722 1659655 ~ 1660000 (-)
G404976 NA other upstream 1718706 1855639 ~ 1880988 (-)
G405053 NA other upstream 1880754 2017687 ~ 2018050 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
zebrafish (Danio rerio) XLOC_000043 NA non-coding NC_007112.7 CM002885.2 2001716 ~ 2005632 (+)