G681254


Basic Information

Item Value
gene id G681254
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01180000
NCBI id null
chromosome length 11503085
location 5668992 ~ 5681405 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU802188
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU802188 True 12390 lncRNA 0.38 2 5668992 5681405

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01180000_05605783_05625064 ZFAND4 coding upstream 43881 5605783 ~ 5626277 (+)
CI01180000_05587131_05604001 FAM21C coding upstream 63968 5587047 ~ 5605024 (+)
CI01180000_05566677_05569815 ALOX5, ALOX5A coding upstream 99138 5566677 ~ 5569854 (+)
CI01180000_05552106_05558265 SLC25A16 coding upstream 109917 5551875 ~ 5559075 (+)
CI01180000_05460865_05464029 NA coding upstream 204459 5460865 ~ 5464533 (+)
CI01180000_05721160_05745421 MARCH8 coding downstream 39695 5721100 ~ 5745673 (+)
CI01180000_05752328_05757955 VDAC2, VDAC2.L coding downstream 70151 5751556 ~ 5758136 (+)
CI01180000_05875768_05878028 NA coding downstream 193664 5875069 ~ 5878719 (+)
CI01180000_05919195_05919836 NA coding downstream 236700 5918105 ~ 5920447 (+)
CI01180000_05928275_05933064 NA coding downstream 246870 5927492 ~ 5945665 (+)
G681242 NA non-coding upstream 2848 5662188 ~ 5666144 (+)
G681249 NA non-coding upstream 29608 5631099 ~ 5639384 (+)
G681426 NA non-coding upstream 85272 5583517 ~ 5583720 (+)
G681425 NA non-coding upstream 85625 5583100 ~ 5583367 (+)
G681205 NA non-coding downstream 91369 5772774 ~ 5780374 (+)
G681428 NA non-coding downstream 102243 5783648 ~ 5783914 (+)
G681440 NA non-coding downstream 121307 5802712 ~ 5802923 (+)
G681451 NA non-coding downstream 149242 5830647 ~ 5831091 (+)
G681459 NA non-coding downstream 165257 5846662 ~ 5846882 (+)
G681268 NA other upstream 295230 5370410 ~ 5373762 (+)
G681137 NA other upstream 883361 4783305 ~ 4785631 (+)
G680736 NA other upstream 1884551 3765691 ~ 3784441 (+)
CI01180000_03571292_03571611 GNG2.L, GBG2, GNG2 other upstream 2096595 3569165 ~ 3573135 (+)
CI01180000_02690045_02691641 NKX6-2, NKX6-2.L, NKX6.2 other upstream 2973556 2689271 ~ 2693221 (+)
G681592 NA other downstream 791630 6471995 ~ 6478999 (+)
G681686 NA other downstream 951503 6632908 ~ 6634989 (+)
G681667 NA other downstream 974441 6655846 ~ 6659546 (+)
CI01180000_07403482_07412752 HELLS other downstream 1721742 7403482 ~ 7413190 (+)
CI01180000_07694615_07695428 MRPL14 other downstream 1982018 7694529 ~ 7695667 (+)

Expression


Co-expression Network