XLOC_014657


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_014657
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 16026893 ~ 16031105 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00030179
CTGCTTTCTAAATGGGTGAAGGTTGGATGATGCAGAGCAAGCTGAATGTGTGCACCTGAAAGAAACCCCATTATGATCTTCCTTGATGGGGGCTGAATGACCAACCTTGAAgGTTAAATTGTGCAGAACAAGCTGAATGTTTCGACATGGAGACCTCCTGTCACGATGCTTCTGGATGAGCTAAATGAACAAACATGAAAGATGCAGTCAGTGCAGTGCTTTTCAAGTGGCCACAGTAAGCCATTGTTCTGGTAAGTTCAACATTAATTTTAGTGTTGCACGTATGCGAGAATCAGTGCTCCTAATTTGCGCTTCATTCTCTAACTACGTGCTAAATTAATGGGGAGCCTTTGACCGCCTGTCTGCTGGTGTCTGTGTCGGTCACTCTACTGTCCAACATAAACCAACTGGTTGCGCATGATGACTCCCCATCTGGGTCCAAGATTAACCCCTATAGTTTAAATTTGTACCTAAGATTGAAGCTTTAGCTCATTTTAAGGTTATTTACACTCCCATtacttaaacttgtaaaattcacttaagcttttattattattattttttttttagaataactTAACCGTTAAAATACTTtctgccatttttattttatcagaCATGTGGAGGGTGAGCTTGTTTTGAATTTTGTGACTGGAACACGATGATGTTACAAATGTATaaattgaatatatttttgtgcTTAGGTGCTGGTTAACTGTAGGAATGGTGGTACAGTCTGCTTAAGTAGGAACTTGACTGGTGCGGTTGTCTCAACTTTAACTGGTTTACatgtgcaactttttttttttttccccccccaATAAAcccttttaaataaaagtattttaaaactaTTCTAGACTGCTGTTTTGTTTGCAAATGATACTAAAGTAATATTGGaccataaatttaaaacaatcaatTATTTTCCACCAATATGTATTTCATGTtaaataagtttgactttatgCTGTAAAATAACAAAGATACATGACAACTTTAGTGTAACTCCATACCATTTTATTACTGGAGACAGGTGTACAACAAACCAGCTGGTACTTGACAAACTCCATCACAATGAAGAAAATCTATTAACTTTCCCCCAATGGGATGTCAAACCTTATTGTCATTGCATACAAAAACGataaatttcataaaataaagctACTAATCTTCTGATGACCATTGACGCGACCACTTTTAA
>TCONS_00030178
CTGCTTTCTAAATGGGTGAAGGTTGGATGATGCAGAGCAAGCTGAATGTGTGCACCTGAAAGAAACCCCATTATGATCTTCCTTGATGGGGGCTGAATGACCAACCTTGAAgGTTAAATTGTGCAGAACAAGCTGAATGTTTCGACATGGAGACCTCCTGTCACGATGCTTCTGGATGAGCTAAATGAACAAACATGAAAGATGCAGTCAGTGCAGTGCTTTTCAAGTGGCCACAGTAAGCCATTGTTCTGGTGCTGGTTAACTGTAGGAATGGTGGTACAGTCTGCTTAAGAACTTGACTGGTGCGGTTGTCTCAACTTTAACTGGTTTACatgtgcaactttttttttttttccccccccaATAAAcccttttaaataaaagtattttaaaactaTTCTAGACTGCTGTTTTGTTTGCAAATGATACTAAAGTAATATTGGaccataaatttaaaacaatcaatTATTTTCCACCAATATGTATTTCATGTtaaataagtttgactttatgCTGTAAAATAACAAAGATACATGACAACTTTAGTGTAACTCCATACCATTTTATTACTGGAGACAGGTGTACAACAAACCAGCTGGTACTTGACAAACTCCATCACAATGAAGAAAATCTATTAACTTTCCCCCAATGGGATGTCAAACCTTATTGTCATTGCATACAAAAACGataaatttcataaaataaagctACTAATCTTCTGATGACCATTGACGCGACCACTTTTAA
>TCONS_00030180
CAACTGCTTTCTAAATGGGTGAAGGTTGGATGATGCAGAGCAAGCTGAATGTGTGCACCTGAAAGAAACCCCATTATGATCTTCCTTGATGGGGGCTGAATGACCAACCTTGAAgGTTAAATTGTGCAGAACAAGCTGAATGTTTCGACATGGAGACCTCCTGTCACGATGCTTCTGGATGAGCTAAATGAACAAACATGAAAGGTGCTGGTTAACTGTAGGAATGGTGGTACAGTCTGCTTAAGAACTTGACTGGTGCGGTTGTCTCAACTTTAACTGGTTTACatgtgcaactttttttttttttccccccccaATAAAcccttttaaataaaagtattttaaaactaTTCTAGACTGCTGTTTTGTTTGCAAATGATACTAAAGTAATATTGGaccataaatttaaaacaatcaatTATTTTCCACCAATATGTATTTCATGTtaaataagtttgactttatgCTGTAAAATAACAAAGATACATGACAACTTTAGTGTAACTCCATACCATTTTATTACTGGAGACAGGTGTACAACAAACCAGCTGGTACTTGACAAACTCCATCACAATGAAGAAAATCTATTAACTTTCCCCCAATGGGATGTCAAACCTTATTGTCATTGCATACAAAAACGataaatttcataaaataaagctACTAATCTTCTGATGACCATTGACGCGACCACTTTTAA
>TCONS_00030182
CTTTTCAACTGCTTTCTAAATGGGTGAAGATGTTAACGTTCCCTGAAATGGGAGTTCAGTTTAACCACGTTGTTCCACCGCTAATCACAACTTTCTGTCCAGAGGTTGGATGATGCAGAGCAAGCTGAATGTGTGCACCTGAAAGAAACCCCATTATGATCTTCCTTGATGGGGGCTGAATGACCAACCTTGAAgGTTAAATTGTGCAGAACAAGCTGAATGTTTCGACATGGAGACCTCCTGTCACGATGCTTCTGGATGAGCTAAATGAACAAACATGAAAGATGCAGTCAGTGCAGTGCTTTTCAAGTGGCCACAGTAAGCCATTGTTCTGGTAAGTTCAACATTAATTTTAGTGTTGCACGTATGCGAGAATCAGTGCTCCTAATTTGCGCTTCATTCTCTAACTACGTGCTAAATTAATGGGGAGCCTTTGACCGCCTGTCTGCTGGTGTCTGTGTCGGTCACTCTACTGTCCAACATAAACCAACTGGTTGCGCATGATGACTCCCCATCTGGGTCCAAGATTAACCCCTATAGTTTAAATTTGTACCTAAGATTGAAGCTTTAGCTCATTTTAAGGTTATTTACACTCCCATtacttaaacttgtaaaattcacttaagcttttattattattattttttttttagaataactTAACCGTTAAAATACTTtctgccatttttattttatcagaCATGTGGAGGGTGAGCTTGTTTTGAATTTTGTGACTGGAACACGATGATGTTACAAATGTATaaattgaatatatttttgtgcTTAGGTGCTGGTTAACTGTAGGAATGGTGGTACAGTCTGCTTAAGTAGGAACTTGACTGGTGCGGTTGTCTCAACTTTAACTGGTTTACatgtgcaactttttttttttttccccccccaATAAAcccttttaaataaaagtattttaaaactaTTCTAGACTGCTGTTTTGTTTGCAAATGATACTAAAGTAATATTGGaccataaatttaaaacaatcaatTATTTTCCACCAATATGTATTTCATGTtaaataagtttgactttatgCTGTAAAATAACAAAGATACATGACAACTTTAGTGTAACTCCATACCATTTTATTACTGGAGACAGGTGTACAACAAACCAGCTGGTACTTGACAAACTCCATCACAATGAAGAAAATCTATTAACTTTCCCCCAATGGGATGTCAAACCTTATTGTCATTGCATACAAAAACGataaatttcataaaataaagctACTAATCTTCTGATGACCATTGACGCGACCACTTTTAA
>TCONS_00030181
CTTTTCAACTGCTTTCTAAATGGGTGAAGATGTTAACGTTCCCTGAAATGGGAGTTCAGTTTAACCACGTTGTTCCACCGCTAATCACAACTTTCTGTCCAGAGGTTGGATGATGCAGAGCAAGCTGAATGTGTGCACCTGAAAGAAACCCCATTATGATCTTCCTTGATGGGGGCTGAATGACCAACCTTGAAgGTTAAATTGTGCAGAACAAGCTGAATGTTTCGACATGGAGACCTCCTGTCACGATGCTTCTGGATGAGCTAAATGAACAAACATGAAAGATGCAGTCAGTGCAGTGCTTTTCAAGTGGCCACAGTAAGCCATTGTTCTGGTAAGTTCAACATTAATTTTAGTGTTGCACGTATGCGAGAATCAGTGCTCCTAATTTGCGCTTCATTCTCTAACTACGTGCTAAATTAATGGGGAGCCTTTGACCGCCTGTCTGCTGGTGTCTGTGTCGGTCACTCTACTGTCCAACATAAACCAACTGGTTGCGCATGATGACTCCCCATCTGGGTCCAAGATTAACCCCTATAGTTTAAATTTGTACCTAAGATTGAAGCTTTAGCTCATTTTAAGGTTATTTACACTCCCATtacttaaacttgtaaaattcacttaagcttttattattattattttttttttagaataactTAACCGTTAAAATACTTtctgccatttttattttatcagaCATGTGGAGGGTGAGCTTGTTTTGAATTTTGTGACTGGAACACGATGATGTTACAAATGTATaaattgaatatatttttgtgcTTAGGTGCTGGTTAACTGTAGGAATGGTGGTACAGTCTGCTTAAGAACTTGACTGGTGCGGTTGTCTCAACTTTAACTGGTTTACatgtgcaactttttttttttttccccccccaATAAAcccttttaaataaaagtattttaaaactaTTCTAGACTGCTGTTTTGTTTGCAAATGATACTAAAGTAATATTGGaccataaatttaaaacaatcaatTATTTTCCACCAATATGTATTTCATGTtaaataagtttgactttatgCTGTAAAATAACAAAGATACATGACAACTTTAGTGTAACTCCATACCATTTTATTACTGGAGACAGGTGTACAACAAACCAGCTGGTACTTGACAAACTCCATCACAATGAAGAAAATCTATTAACTTTCCCCCAATGGGATGTCAAACCTTATTGTCATTGCATACAAAAACGataaatttcataaaataaagctACTAATCTTCTGATGACCATTGACGCGACCACTTTTAA
>TCONS_00030183
CTCCTTTTCAACTGCTTTCTAAATGGGTGAAGATGTTAACGTTCCCTGAAATGGGAGTTCAGTTTAACCACGTTGTTCCACCGCTAATCACAACTTTCTGTCCAGAGGTTGGATGATGCAGAGCAAGCTGAATGTGTGCACCTGAAAGAAACCCCATTATGATCTTCCTTGATGGGGGCTGAATGACCAACCTTGAAgGTTAAATTGTGCAGAACAAGCTGAATGTTTCGACATGGAGACCTCCTGTCACGATGCTTCTGGATGAGCTAAATGAACAAACATGAAAGCCAGATGCAGTCAGTGCAGTGCTTTTCAAGTGGCCACAGTAAGCCATTGTTCTGGTAAGTTCAACATTAATTTTAGTGTTGCACGTATGCGAGAATCAGTGCTCCTAATTTGCGCTTCATTCTCTAACTACGTGCTAAATTAATGGGGAGCCTTTGACCGCCTGTCTGCTGGTGTCTGTGTCGGTCACTCTACTGTCCAACATAAACCAACTGGTTGCGCATGATGACTCCCCATCTGGGTCCAAGATTAACCCCTATAGTTTAAATTTGTACCTAAGATTGAAGCTTTAGCTCATTTTAAGGTTATTTACACTCCCATtacttaaacttgtaaaattcacttaagcttttattattattattttttttttagaataactTAACCGTTAAAATACTTtctgccatttttattttatcagaCATGTGGAGGGTGAGCTTGTTTTGAATTTTGTGACTGGAACACGATGATGTTACAAATGTATaaattgaatatatttttgtgcTTAGGTGCTGGTTAACTGTAGGAATGGTGGTACAGTCTGCTTAAGAACTTGACTGGTGCGGTTGTCTCAACTTTAACTGGTTTACatgtgcaactttttttttttttccccccccaATAAAcccttttaaataaaagtattttaaaactaTTCTAGACTGCTGTTTTGTTTGCAAATGATACTAAAGTAATATTGGaccataaatttaaaacaatcaatTATTTTCCACCAATATGTATTTCATGTtaaataagtttgactttatgCTGTAAAATAACAAAGATACATGACAACTTTAGTGTAACTCCATACCATTTTATTACTGGAGACAGGTGTACAACAAACCAGCTGGTACTTGACAAACTCCATCACAATGAAGAAAATCTATTAACTTTCCCCCAATGGGATGTCAAACCTTATTGTCATTGCATACAAAAACGataaatttcataaaataaagctACTAATCTTCTGATGACCATTGACGCGACCACTTTTAA
>TCONS_00029765
CTCCTTTTCAACTGCTTTCTAAATGGGTGAAGGTTGGATGATGCAGAGCAAGCTGAATGTGTGCACCTGAAAGAAACCCCATTATGATCTTCCTTGATGGGGGCTGAATGACCAACCTTGAAgGTTAAATTGTGCAGAACAAGCTGAATGTTTCGACATGGAGACCTCCTGTCACGATGCTTCTGGATGAGCTAAATGAACAAACATGAAAGATGCAGTCAGTGCAGTGCTTTTCAAGTGGCCACAGTAAGCCATTGTTCTGGTGCTGGTTAACTGTAGGAATGGTGGTACAGTCTGCTTAAGTAGGAACTTGACTGGTGCGGTTGTCTCAACTTTAACTGGTTTACatgtgcaactttttttttttttccccccccaATAAAcccttttaaataaaagtattttaaaactaTTCTAGACTGCTGTTTTGTTTGCAAATGATACTAAAGTAATATTGGaccataaatttaaaacaatcaatTATTTTCCACCAATATGTATTTCATGTtaaataagtttgactttatgCTGTAAAATAACAAAGATACATGACAACTTTAGTGTAACTCCATACCATTTTATTACTGGAGACAGGTGTACAACAAACCAGCTGGTACTTGACAAACTCCATCACAATGAAGAAAATCTATTAACTTTCCCCCAATGGGATGTCAAACCTTATTGTCATTGCATACAAAAACGataaatttcataaaataaagctACTAATCTTCTGATGACCATTGACGCGACCACTTTTAA
>TCONS_00030185
CAGCTTCCTCCTTTTCAACTGCTTTCTAAATGGGTGAAGATGTTAACGTTCCCTGAAATGGGAGTTCAGTTTAACCACGTTGTTCCACCGCTAATCACAACTTTCTGTCCAGAGGTTGGATGATGCAGAGCAAGCTGAATGTGTGCACCTGAAAGAAACCCCATTATGATCTTCCTTGATGGGGGCTGAATGACCAACCTTGAAgGTTAAATTGTGCAGAACAAGCTGAATGTTTCGACATGGAGACCTCCTGTCACGATGCTTCTGGATGAGCTAAATGAACAAACATGAAAGATGCAGTCAGTGCAGTGCTTTTCAAGTGGCCACAGTAAGCCATTGTTCTGGTGCTGGTTAACTGTAGGAATGGTGGTACAGTCTGCTTAAGTAGGAACTTGACTGGTGCGGTTGTCTCAACTTTAACTGGTTTACatgtgcaactttttttttttttccccccccaATAAAcccttttaaataaaagtattttaaaactaTTCTAGACTGCTGTTTTGTTTGCAAATGATACTAAAGTAATATTGGaccataaatttaaaacaatcaatTATTTTCCACCAATATGTATTTCATGTtaaataagtttgactttatgCTGTAAAATAACAAAGATACATGACAACTTTAGTGTAACTCCATACCATTTTATTACTGGAGACAGGTGTACAACAAACCAGCTGGTACTTGACAAACTCCATCACAATGAAGAAAATCTATTAACTTTCCCCCAATGGGATGTCAAACCTTATTGTCATTGCATACAAAAACGataaatttcataaaataaagctACTAATCTTCTGATGACCATTGACGCGACCACTTTTAA
>TCONS_00030184
CAGCTTCCTCCTTTTCAACTGCTTTCTAAATGGGTGAAGATGTTAACGTTCCCTGAAATGGGAGTTCAGTTTAACCACGTTGTTCCACCGCTAATCACAACTTTCTGTCCAGAGGTTGGATGATGCAGAGCAAGCTGAATGTGTGCACCTGAAAGAAACCCCATTATGATCTTCCTTGATGGGGGCTGAATGACCAACCTTGAAgGTTAAATTGTGCAGAACAAGCTGAATGTTTCGACATGGAGACCTCCTGTCACGATGCTTCTGGATGAGCTAAATGAACAAACATGAAAGATGCAGTCAGTGCAGTGCTTTTCAAGTGGCCACAGTAAGCCATTGTTCTGGTGCTGGTTAACTGTAGGAATGGTGGTACAGTCTGCTTAAGAACTTGACTGGTGCGGTTGTCTCAACTTTAACTGGTTTACatgtgcaactttttttttttttccccccccaATAAAcccttttaaataaaagtattttaaaactaTTCTAGACTGCTGTTTTGTTTGCAAATGATACTAAAGTAATATTGGaccataaatttaaaacaatcaatTATTTTCCACCAATATGTATTTCATGTtaaataagtttgactttatgCTGTAAAATAACAAAGATACATGACAACTTTAGTGTAACTCCATACCATTTTATTACTGGAGACAGGTGTACAACAAACCAGCTGGTACTTGACAAACTCCATCACAATGAAGAAAATCTATTAACTTTCCCCCAATGGGATGTCAAACCTTATTGTCATTGCATACAAAAACGataaatttcataaaataaagctACTAATCTTCTGATGACCATTGACGCGACCACTTTTAA
>TCONS_00029766
CTCAGCTTCCTCCTTTTCAACTGCTTTCTAAATGGGTGAAGATGTTAACGTTCCCTGAAATGGGAGTTCAGTTTAACCACGTTGTTCCACCGCTAATCACAACTTTCTGTCCAGAGGTTGGATGATGCAGAGCAAGCTGAATGTGTGCACCTGAAAGAAACCCCATTATGATCTTCCTTGATGGGGGCTGAATGACCAACCTTGAAgGTTAAATTGTGCAGAACAAGCTGAATGTTTCGACATGGAGACCTCCTGTCACGATGCTTCTGGATGAGCTAAATGAACAAACATGAAAGCCAGATGCAGTCAGTGCAGTGCTTTTCAAGTGGCCACAGTAAGCCATTGTTCTGGTAAGTTCAACATTAATTTTAGTGTTGCACGTATGCGAGAATCAGTGCTCCTAATTTGCGCTTCATTCTCTAACTACGTGCTAAATTAATGGGGAGCCTTTGACCGCCTGTCTGCTGGTGTCTGTGTCGGTCACTCTACTGTCCAACATAAACCAACTGGTTGCGCATGATGACTCCCCATCTGGGTCCAAGATTAACCCCTATAGTTTAAATTTGTACCTAAGATTGAAGCTTTAGCTCATTTTAAGGTTATTTACACTCCCATtacttaaacttgtaaaattcacttaagcttttattattattattttttttttagaataactTAACCGTTAAAATACTTtctgccatttttattttatcagaCATGTGGAGGGTGAGCTTGTTTTGAATTTTGTGACTGGAACACGATGATGTTACAAATGTATaaattgaatatatttttgtgcTTAGGTGCTGGTTAACTGTAGGAATGGTGGTACAGTCTGCTTAAGTAGGAACTTGACTGGTGCGGTTGTCTCAACTTTAACTGGTTTACatgtgcaactttttttttttttccccccccaATAAAcccttttaaataaaagtattttaaaactaTTCTAGACTGCTGTTTTGTTTGCAAATGATACTAAAGTAATATTGGaccataaatttaaaacaatcaatTATTTTCCACCAATATGTATTTCATGTtaaataagtttgactttatgCTGTAAAATAACAAAGATACATGACAACTTTAGTGTAACTCCATACCATTTTATTACTGGAGACAGGTGTACAACAAACCAGCTGGTACTTGACAAACTCCATCACAATGAAGAAAATCTATTAACTTTCCCCCAATGGGATGTCAAACCTTATTGTCATTGCATACAAAAACGataaatttcataaaataaagctACTAATCTTCTGATGACCATTGACGCGACCACTTTTAA
>TCONS_00029762
CACAGTCTCAGCTTCCTCCTTTTCAACTGCTTTCTAAATGGGTGAAGGTTGGATGATGCAGAGCAAGCTGAATGTGTGCACCTGAAAGAAACCCCATTATGATCTTCCTTGATGGGGGCTGAATGACCAACCTTGAAgGTTAAATTGTGCAGAACAAGCTGAATGTTTCGACATGGAGACCTCCTGTCACGATGCTTCTGGATGAGCTAAATGAACAAACATGAAAGCCAGATGCAGTCAGTGCAGTGCTTTTCAAGTGGCCACAGTAAGCCATTGTTCTGGTAAGTTCAACATTAATTTTAGTGTTGCACGTATGCGAGAATCAGTGCTCCTAATTTGCGCTTCATTCTCTAACTACGTGCTAAATTAATGGGGAGCCTTTGACCGCCTGTCTGCTGGTGTCTGTGTCGGTCACTCTACTGTCCAACATAAACCAACTGGTTGCGCATGATGACTCCCCATCTGGGTCCAAGATTAACCCCTATAGTTTAAATTTGTACCTAAGATTGAAGCTTTAGCTCATTTTAAGGTTATTTACACTCCCATtacttaaacttgtaaaattcacttaagcttttattattattattttttttttagaataactTAACCGTTAAAATACTTtctgccatttttattttatcagaCATGTGGAGGGTGAGCTTGTTTTGAATTTTGTGACTGGAACACGATGATGTTACAAATGTATaaattgaatatatttttgtgcTTAGGTGCTGGTTAACTGTAGGAATGGTGGTACAGTCTGCTTAAGTAGGAACTTGACTGGTGCGGTTGTCTCAACTTTAACTGGTTTACatgtgcaactttttttttttttccccccccaATAAAcccttttaaataaaagtattttaaaactaTTCTAGACTGCTGTTTTGTTTGCAAATGATACTAAAGTAATATTGGaccataaatttaaaacaatcaatTATTTTCCACCAATATGTATTTCATGTtaaataagtttgactttatgCTGTAAAATAACAAAGATACATGACAACTTTAGTGTAACTCCATACCATTTTATTACTGGAGACAGGTGTACAACAAACCAGCTGGTACTTGACAAACTCCATCACAATGAAGAAAATCTATTAACTTTCCCCCAATGGGATGTCAAACCTTATTGTCATTGCATACAAAAACGataaatttcataaaataaagctACTAATCTTCTGATGACCATTGACGCGACCACTTTTAA
>TCONS_00029761
CACAGTCTCAGCTTCCTCCTTTTCAACTGCTTTCTAAATGGGTGAAGGTTGGATGATGCAGAGCAAGCTGAATGTGTGCACCTGAAAGAAACCCCATTATGATCTTCCTTGATGGGGGCTGAATGACCAACCTTGAAgGTTAAATTGTGCAGAACAAGCTGAATGTTTCGACATGGAGACCTCCTGTCACGATGCTTCTGGATGAGCTAAATGAACAAACATGAAAGCCAGATGCAGTCAGTGCAGTGCTTTTCAAGTGGCCACAGTAAGCCATTGTTCTGGTGCTGGTTAACTGTAGGAATGGTGGTACAGTCTGCTTAAGAACTTGACTGGTGCGGTTGTCTCAACTTTAACTGGTTTACatgtgcaactttttttttttttccccccccaATAAAcccttttaaataaaagtattttaaaactaTTCTAGACTGCTGTTTTGTTTGCAAATGATACTAAAGTAATATTGGaccataaatttaaaacaatcaatTATTTTCCACCAATATGTATTTCATGTtaaataagtttgactttatgCTGTAAAATAACAAAGATACATGACAACTTTAGTGTAACTCCATACCATTTTATTACTGGAGACAGGTGTACAACAAACCAGCTGGTACTTGACAAACTCCATCACAATGAAGAAAATCTATTAACTTTCCCCCAATGGGATGTCAAACCTTATTGTCATTGCATACAAAAACGataaatttcataaaataaagctACTAATCTTCTGATGACCATTGACGCGACCACTTTTAA
>TCONS_00030186
CCGCCGTATAAAACATAACGTCACAGTCTCAGCTTCCTCCTTTTCAACTGCTTTCTAAATGGGTGAAGATGTTAACGTTCCCTGAAATGGGAGTTCAGTTTAACCACGTTGTTCCACCGCTAATCACAACTTTCTGTCCAGAGGTTGGATGATGCAGAGCAAGCTGAATGTGTGCACCTGAAAGAAACCCCATTATGATCTTCCTTGATGGGGGCTGAATGACCAACCTTGAAgGTTAAATTGTGCAGAACAAGCTGAATGTTTCGACATGGAGACCTCCTGTCACGATGCTTCTGGATGAGCTAAATGAACAAACATGAAAGGTGCTGGTTAACTGTAGGAATGGTGGTACAGTCTGCTTAAGTAGGAACTTGACTGGTGCGGTTGTCTCAACTTTAACTGGTTTACatgtgcaactttttttttttttccccccccaATAAAcccttttaaataaaagtattttaaaactaTTCTAGACTGCTGTTTTGTTTGCAAATGATACTAAAGTAATATTGGaccataaatttaaaacaatcaatTATTTTCCACCAATATGTATTTCATGTtaaataagtttgactttatgCTGTAAAATAACAAAGATACATGACAACTTTAGTGTAACTCCATACCATTTTATTACTGGAGACAGGTGTACAACAAACCAGCTGGTACTTGACAAACTCCATCACAATGAAGAAAATCTATTAACTTTCCCCCAATGGGATGTCAAACCTTATTGTCATTGCATACAAAAACGataaatttcataaaataaagctACTAATCTTCTGATGACCATTGACGCGACCACTTTTAA
>TCONS_00030187
GTTACCGCCGTATAAAACATAACGTCACAGTCTCAGCTTCCTCCTTTTCAACTGCTTTCTAAATGGGTGAAGGTTGGATGATGCAGAGCAAGCTGAATGTGTGCACCTGAAAGAAACCCCATTATGATCTTCCTTGATGGGGGCTGAATGACCAACCTTGAAgGTTAAATTGTGCAGAACAAGCTGAATGTTTCGACATGGAGACCTCCTGTCACGATGCTTCTGGATGAGCTAAATGAACAAACATGAAAGGTGCTGGTTAACTGTAGGAATGGTGGTACAGTCTGCTTAAGTAGGAACTTGACTGGTGCGGTTGTCTCAACTTTAACTGGTTTACatgtgcaactttttttttttttccccccccaATAAAcccttttaaataaaagtattttaaaactaTTCTAGACTGCTGTTTTGTTTGCAAATGATACTAAAGTAATATTGGaccataaatttaaaacaatcaatTATTTTCCACCAATATGTATTTCATGTtaaataagtttgactttatgCTGTAAAATAACAAAGATACATGACAACTTTAGTGTAACTCCATACCATTTTATTACTGGAGACAGGTGTACAACAAACCAGCTGGTACTTGACAAACTCCATCACAATGAAGAAAATCTATTAACTTTCCCCCAATGGGATGTCAAACCTTATTGTCATTGCATACAAAAACGataaatttcataaaataaagctACTAATCTTCTGATGACCATTGACGCGACCACTTTTAA
>TCONS_00029760
ACTACATATCCCATCGAGCTGTGTGACTGAACAATGTCATTCAGCCAATCAGCGATGAGCCAGTTCACCAATCAGCGTTAGTTACCGCCGTATAAAACATAACGTCACAGTCTCAGCTTCCTCCTTTTCAACTGCTTTCTAAATGGGTGAAGATGTTAACGTTCCCTGAAATGGGAGTTCAGTTTAACCACGTTGTTCCACCGCTAATCACAACTTTCTGTCCAGAGGTTGGATGATGCAGAGCAAGCTGAATGTGTGCACCTGAAAGAAACCCCATTATGATCTTCCTTGATGGGGGCTGAATGACCAACCTTGAAgGTTAAATTGTGCAGAACAAGCTGAATGTTTCGACATGGAGACCTCCTGTCACGATGCTTCTGGATGAGCTAAATGAACAAACATGAAAGCCAGATGCAGTCAGTGCAGTGCTTTTCAAGTGGCCACAGTAAGCCATTGTTCTGGTGCTGGTTAACTGTAGGAATGGTGGTACAGTCTGCTTAAGTAGGAACTTGACTGGTGCGGTTGTCTCAACTTTAACTGGTTTACatgtgcaactttttttttttttccccccccaATAAAcccttttaaataaaagtattttaaaactaTTCTAGACTGCTGTTTTGTTTGCAAATGATACTAAAGTAATATTGGaccataaatttaaaacaatcaatTATTTTCCACCAATATGTATTTCATGTtaaataagtttgactttatgCTGTAAAATAACAAAGATACATGACAACTTTAGTGTAACTCCATACCATTTTATTACTGGAGACAGGTGTACAACAAACCAGCTGGTACTTGACAAACTCCATCACAATGAAGAAAATCTATTAACTTTCCCCCAATGGGATGTCAAACCTTATTGTCATTGCATACAAAAACGataaatttcataaaataaagctACTAATCTTCTGATGACCATTGACGCGACCACTTTTAA
>TCONS_00029763
CAAAACTACATATCCCATCGAGCTGTGTGACTGAACAATGTCATTCAGCCAATCAGCGATGAGCCAGTTCACCAATCAGCGTTAGTTACCGCCGTATAAAACATAACGTCACAGTCTCAGCTTCCTCCTTTTCAACTGCTTTCTAAATGGGTGAAGATGTTAACGTTCCCTGAAATGGGAGTTCAGTTTAACCACGTTGTTCCACCGCTAATCACAACTTTCTGTCCAGAGGTTGGATGATGCAGAGCAAGCTGAATGTGTGCACCTGAAAGAAACCCCATTATGATCTTCCTTGATGGGGGCTGAATGACCAACCTTGAAgGTTAAATTGTGCAGAACAAGCTGAATGTTTCGACATGGAGACCTCCTGTCACGATGCTTCTGGATGAGCTAAATGAACAAACATGAAAGCCAGATGCAGTCAGTGCAGTGCTTTTCAAGTGGCCACAGTAAGCCATTGTTCTGGTGCTGGTTAACTGTAGGAATGGTGGTACAGTCTGCTTAAGAACTTGACTGGTGCGGTTGTCTCAACTTTAACTGGTTTACatgtgcaactttttttttttttccccccccaATAAAcccttttaaataaaagtattttaaaactaTTCTAGACTGCTGTTTTGTTTGCAAATGATACTAAAGTAATATTGGaccataaatttaaaacaatcaatTATTTTCCACCAATATGTATTTCATGTtaaataagtttgactttatgCTGTAAAATAACAAAGATACATGACAACTTTAGTGTAACTCCATACCATTTTATTACTGGAGACAGGTGTACAACAAACCAGCTGGTACTTGACAAACTCCATCACAATGAAGAAAATCTATTAACTTTCCCCCAATGGGATGTCAAACCTTATTGTCATTGCATACAAAAACGataaatttcataaaataaagctACTAATCTTCTGATGACCATTGACGCGACCACTTTTAA
>TCONS_00029764
AACCTATCTAACTGAAATCAGAGTCAATTGACAACCGTTCTTTATAGTACCAATCGGACacataatttgttattattacacaTACGGAAAGATTTCAGCAGAAGCAGCAGAAAATGTTGAAAAGTAGGGAGTGAAGCCACGCATTTCTTATGTATAAAAAATTCCgatcattataaaaaaaataataatcttattaCTATATTAGAAATCCCAGTCGTCATTTAGTCGCAAAACTACATATCCCATCGAGCTGTGTGACTGAACAATGTCATTCAGCCAATCAGCGATGAGCCAGTTCACCAATCAGCGTTAGTTACCGCCGTATAAAACATAACGTCACAGTCTCAGCTTCCTCCTTTTCAACTGCTTTCTAAATGGGTGAAGGTTGGATGATGCAGAGCAAGCTGAATGTGTGCACCTGAAAGAAACCCCATTATGATCTTCCTTGATGGGGGCTGAATGACCAACCTTGAAgGTTAAATTGTGCAGAACAAGCTGAATGTTTCGACATGGAGACCTCCTGTCACGATGCTTCTGGATGAGCTAAATGAACAAACATGAAAGCCAGATGCAGTCAGTGCAGTGCTTTTCAAGTGGCCACAGTAAGCCATTGTTCTGGTGCTGGTTAACTGTAGGAATGGTGGTACAGTCTGCTTAAGTAGGAACTTGACTGGTGCGGTTGTCTCAACTTTAACTGGTTTACatgtgcaactttttttttttttccccccccaATAAAcccttttaaataaaagtattttaaaactaTTCTAGACTGCTGTTTTGTTTGCAAATGATACTAAAGTAATATTGGaccataaatttaaaacaatcaatTATTTTCCACCAATATGTATTTCATGTtaaataagtttgactttatgCTGTAAAATAACAAAGATACATGACAACTTTAGTGTAACTCCATACCATTTTATTACTGGAGACAGGTGTACAACAAACCAGCTGGTACTTGACAAACTCCATCACAATGAAGAAAATCTATTAACTTTCCCCCAATGGGATGTCAAACCTTATTGTCATTGCATACAAAAACGataaatttcataaaataaagctACTAATCTTCTGATGACCATTGACGCGACCACTTTTAA
>TCONS_00029767
TTAACGTTCCCTGAAATGGGAGTTCAGTTTAACCACGTTGTTCCACCGCTAATCACAACTTTCTGTCCAGAGGTTGGATGATGCAGAGCAAGCTGAATGTGTGCACCTGAAAGAAACCCCATTATGATCTTCCTTGATGGGGGCTGAATGACCAACCTTGAAgGTTAAATTGTGCAGAACAAGCTGAATGTTTCGACATGGAGACCTCCTGTCACGATGCTTCTGGATGAGCTAAATGAACAAACATGAAAGGTTTGTTTGCTATTGGTTTTTGTGTTTGTTGGCTGTGATGACAAACTTGCCCTCTCTGAGAGAGCAGCTCTATTATGACAATCAAAAACTTTGCTGAGCCAACTGTAACTCTAaggttttatgtttttattttttttaattgtacttagtacttgactaaaaaaaaaaaaaattcattttctaTTTAGCCAGATGCAGTCAGTGCAGTGCTTTTCAAGTGGCCACAGTAAGCCATTGTTCTGGTAAGTTCAACATTAATTTTAGTGTTGCACGTATGCGAGAATCAGTGCTCCTAATTTGCGCTTCATTCTCTAACTACGTGCTAAATTAATGGGGAGCCTTTGACCGCCTGTCTG

Function

GO:

id name namespace
GO:0044085 cellular component biogenesis biological_process
GO:0016070 RNA metabolic process biological_process
GO:0016072 rRNA metabolic process biological_process
GO:0071826 ribonucleoprotein complex subunit organization biological_process
GO:0022613 ribonucleoprotein complex biogenesis biological_process
GO:0022618 ribonucleoprotein complex assembly biological_process
GO:0071840 cellular component organization or biogenesis biological_process
GO:0007517 muscle organ development biological_process
GO:0034470 ncRNA processing biological_process
GO:0006364 rRNA processing biological_process
GO:0090304 nucleic acid metabolic process biological_process
GO:0006396 RNA processing biological_process
GO:0030490 maturation of SSU-rRNA biological_process
GO:0006139 nucleobase-containing compound metabolic process biological_process
GO:0006725 cellular aromatic compound metabolic process biological_process
GO:1901360 organic cyclic compound metabolic process biological_process
GO:0010467 gene expression biological_process
GO:0042254 ribosome biogenesis biological_process
GO:0042255 ribosome assembly biological_process
GO:0000462 maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) biological_process
GO:0000469 cleavage involved in rRNA processing biological_process
GO:0000470 maturation of LSU-rRNA biological_process
GO:0042273 ribosomal large subunit biogenesis biological_process
GO:0042274 ribosomal small subunit biogenesis biological_process
GO:0000478 endonucleolytic cleavage involved in rRNA processing biological_process
GO:0000479 endonucleolytic cleavage of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) biological_process
GO:0043170 macromolecule metabolic process biological_process
GO:0034641 cellular nitrogen compound metabolic process biological_process
GO:0031167 rRNA methylation biological_process
GO:0034660 ncRNA metabolic process biological_process
GO:0046483 heterocycle metabolic process biological_process
GO:0090501 RNA phosphodiester bond hydrolysis biological_process
GO:0090502 RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic biological_process
GO:0030684 preribosome cellular_component
GO:0030686 90S preribosome cellular_component
GO:0032040 small-subunit processome cellular_component
GO:0030688 preribosome, small subunit precursor cellular_component
GO:0044422 obsolete organelle part cellular_component
GO:1990904 ribonucleoprotein complex cellular_component
GO:0044428 obsolete nuclear part cellular_component
GO:0070013 intracellular organelle lumen cellular_component
GO:0044446 obsolete intracellular organelle part cellular_component
GO:0044452 obsolete nucleolar part cellular_component
GO:0032991 protein-containing complex cellular_component
GO:0005634 nucleus cellular_component
GO:0031974 membrane-enclosed lumen cellular_component
GO:0031981 nuclear lumen cellular_component
GO:0043226 organelle cellular_component
GO:0043227 membrane-bounded organelle cellular_component
GO:0043228 non-membrane-bounded organelle cellular_component
GO:0043229 intracellular organelle cellular_component
GO:0043231 intracellular membrane-bounded organelle cellular_component
GO:0043232 intracellular non-membrane-bounded organelle cellular_component
GO:0043233 organelle lumen cellular_component
GO:0005730 nucleolus cellular_component
GO:0034511 U3 snoRNA binding molecular_function
GO:0003676 nucleic acid binding molecular_function
GO:0030515 snoRNA binding molecular_function
GO:0097159 organic cyclic compound binding molecular_function
GO:1901363 heterocyclic compound binding molecular_function
GO:0003723 RNA binding molecular_function
GO:0140102 catalytic activity, acting on a rRNA molecular_function
GO:0008649 rRNA methyltransferase activity molecular_function

KEGG:

id description
ko00230 Purine metabolism
ko00240 Pyrimidine metabolism
ko03020 RNA polymerase
ko03230 Viral genome structure
ko04623 Cytosolic DNA-sensing pathway
ko05164 Influenza A
ko05016 Huntington disease
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00030179 False 1204 lncRNA 0.36 5 16026893 16030742
TCONS_00030178 False 747 lncRNA 0.37 6 16026893 16030742
TCONS_00030180 False 700 lncRNA 0.36 5 16026893 16030745
TCONS_00030182 False 1287 lncRNA 0.37 6 16026893 16030750
TCONS_00030181 False 1283 lncRNA 0.37 6 16026893 16030750
TCONS_00030183 False 1290 lncRNA 0.37 6 16026893 16030753
TCONS_00029765 False 762 lncRNA 0.37 6 16026893 16030753
TCONS_00030185 False 844 lncRNA 0.38 7 16026893 16030760
TCONS_00030184 False 840 lncRNA 0.38 7 16026893 16030760
TCONS_00029766 False 1303 lncRNA 0.37 6 16026893 16030762
TCONS_00029762 False 1234 lncRNA 0.37 5 16026893 16030768
TCONS_00029761 False 777 lncRNA 0.37 6 16026893 16030768
TCONS_00030186 False 823 lncRNA 0.37 6 16026893 16030789
TCONS_00030187 False 752 lncRNA 0.37 5 16026893 16030793
TCONS_00029760 False 961 lncRNA 0.39 7 16026893 16030873
TCONS_00029763 False 961 lncRNA 0.39 7 16026893 16030877
TCONS_00029764 False 1118 lncRNA 0.37 6 16026893 16031105
TCONS_00029767 True 608 lncRNA 0.40 3 16027912 16030310

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_014656 cited4a coding downstream 171466 15851226 ~ 15855427 (-)
XLOC_014655 ftr55 coding downstream 592080 15423057 ~ 15434813 (-)
XLOC_014654 serinc2 coding downstream 606175 15408363 ~ 15420718 (-)
XLOC_014653 hivep3a coding downstream 628947 15306968 ~ 15397946 (-)
XLOC_014652 edn2 coding downstream 744897 15276713 ~ 15281996 (-)
XLOC_014661 NA coding upstream 4907 16036012 ~ 16044582 (-)
XLOC_014662 CU633478.1 coding upstream 398533 16429638 ~ 16434043 (-)
XLOC_014663 NA coding upstream 728269 16759374 ~ 16765817 (-)
XLOC_014664 CR318590.1 coding upstream 968522 16999627 ~ 16999742 (-)
XLOC_014665 NA coding upstream 1078488 17109593 ~ 17113603 (-)
XLOC_014711 CR382300.3 misc upstream 3697585 19728690 ~ 19728755 (-)
XLOC_014646 NA non-coding downstream 1960343 14062042 ~ 14066550 (-)
XLOC_014639 NA non-coding downstream 2569898 13452858 ~ 13456995 (-)
XLOC_014638 CR450687.1 non-coding downstream 2656740 13364536 ~ 13370153 (-)
XLOC_014636 NA non-coding downstream 2838165 13185953 ~ 13188728 (-)
XLOC_014634 AL928820.1 non-coding downstream 3393630 12633149 ~ 12633263 (-)

Expression


Co-expression Network