XLOC_016900


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_016900
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 51398587 ~ 51407308 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00033962
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>TCONS_00033416
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Function

GO:

id name namespace
GO:0042737 drug catabolic process biological_process
GO:0019265 glycine biosynthetic process, by transamination of glyoxylate biological_process
GO:0017144 drug metabolic process biological_process
GO:0004760 serine-pyruvate transaminase activity molecular_function
GO:0008453 alanine-glyoxylate transaminase activity molecular_function

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00033962 False 8722 lncRNA 0.40 1 51398587 51407308
TCONS_00033416 True 1426 lncRNA 0.45 2 51405600 51407126

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_016899 si:dkeyp-104b3.18 coding downstream 10373 51383977 ~ 51388214 (-)
XLOC_016898 NA coding downstream 26496 51369228 ~ 51372091 (-)
XLOC_016897 NA coding downstream 29697 51331052 ~ 51368890 (-)
XLOC_016896 si:dkeyp-104b3.21 coding downstream 67945 51321773 ~ 51330642 (-)
XLOC_016894 si:ch211-215e19.3 coding downstream 82392 51281779 ~ 51316195 (-)
XLOC_016901 NA coding upstream 1923 51409231 ~ 51409948 (-)
XLOC_016902 BX677667.2 coding upstream 8195 51415503 ~ 51415811 (-)
XLOC_016903 BX677667.1 coding upstream 21865 51429173 ~ 51429490 (-)
XLOC_016904 si:dkeyp-104b3.2 coding upstream 43795 51451103 ~ 51454868 (-)
XLOC_016905 BX677667.3 coding upstream 50805 51458113 ~ 51458228 (-)
XLOC_016895 NA non-coding downstream 94650 51299328 ~ 51303937 (-)
XLOC_016890 NA non-coding downstream 191140 51175997 ~ 51207447 (-)
XLOC_016884 NA non-coding downstream 607989 50774409 ~ 50790598 (-)
XLOC_016907 NA non-coding upstream 66605 51473913 ~ 51477055 (-)

Expression


Co-expression Network