RNA id: TCONS_00033962


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00033962
length 8722
lncRNA type inter_gene
GC content 0.40
exon number 1
gene id XLOC_016900
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 51398587 ~ 51407308 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

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Function

GO:

id name namespace
GO:0042737 drug catabolic process biological_process
GO:0019265 glycine biosynthetic process, by transamination of glyoxylate biological_process
GO:0017144 drug metabolic process biological_process
GO:0004760 serine-pyruvate transaminase activity molecular_function
GO:0008453 alanine-glyoxylate transaminase activity molecular_function

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
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TCONS_00033414 lncRNA downstream 29697 51331052 ~ 51368890 (-) True XLOC_016897
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TCONS_00033417 lncRNA upstream 66608 51473916 ~ 51477055 (-) True XLOC_016907
TCONS_00033965 lncRNA upstream 76239 51483547 ~ 51484324 (-) True XLOC_016909
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TCONS_00033047 mRNA downstream 10373 51383977 ~ 51388214 (-) False XLOC_016899
TCONS_00033048 mRNA downstream 13873 51383998 ~ 51384714 (-) True XLOC_016899
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TCONS_00033041 mRNA downstream 82392 51281856 ~ 51316195 (-) False XLOC_016894
TCONS_00033051 mRNA upstream 43795 51451103 ~ 51454868 (-) True XLOC_016904
TCONS_00033053 mRNA upstream 54072 51461380 ~ 51468756 (-) True XLOC_016906
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TCONS_00033026 other downstream 689105 50709366 ~ 50709482 (-) True XLOC_016882
TCONS_00033024 other downstream 925045 50473426 ~ 50473542 (-) True XLOC_016880
TCONS_00033003 other downstream 1629035 49767578 ~ 49769552 (-) True XLOC_016869
TCONS_00033002 other downstream 1731538 49666756 ~ 49667049 (-) True XLOC_016868
TCONS_00032992 other downstream 2651775 48746683 ~ 48746812 (-) True XLOC_016857
TCONS_00033049 other upstream 8195 51415503 ~ 51415811 (-) True XLOC_016902
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TCONS_00033068 other upstream 329789 51737097 ~ 51741713 (-) False XLOC_016919
TCONS_00033071 other upstream 331378 51738686 ~ 51748935 (-) False XLOC_016919

Expression Profile

//