XLOC_017013


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_017013
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 58851970 ~ 58855883 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00034016
AGCAAAGGAGTTTTACCTCACCGACACTCTTCAGGATTCACTTCTGTAGAGGAAACCCCAGAGCTGCACCCACGGCCACCAACTCTAAAGGAGCTGCCTATGAtcaggttatgttcaggatatgttctGGTTATATTCAGGATTCCTTCTCAATATGCCAGAGttttgttctggttatgttcaggatgTATTCTCGATATGTCAGAGTTTTGTTCTGGTTATGCTCAGAATATGTTCTGGTTTAGTTCAGGATTTATTCTCCATATATCACAGTTTTGTTGTAGTTATGATCAGGTTATATTCAGGATTCATTCTCTGTATATCATGGTATTGTTCTAGTTATgatcagGTTATGTTCAGGATTTGTTCTGGTTTTGTTCTGGCAGAGCGCTTAAGTTCACTCAACATCTTACACCACACTAACTAGCAGGTTAAGTACTGCTtgattatttacttaattttcaaTCTGGGTTATTTTGGAATCATAAATGTAACTTAGATTTAAACATTCTTTGTCAACATGGTAACACACTGCATGGCTAACCTGCTCTGGGtcaggttatgttcaggatatgttttGGTTTTGTTCAAGTTTTGTTAAGGGTATGTTTCACAATTTCTTCTGGTTATGTTTAGATTTTGTTCTGGTTATTTTGGGATTCATTCTCATTATGTCAAGGTTTTTGTTCTGGTTATATTCAAGATATGTTCTAGTTTTTGGTCAGGTTATGCTCAGCATGTTTTGGTTGTGATCAGGTTTTGTTCTGGTTTTCAGGATGTTTTGCTTATATTCAGTTTACATTCAGGATATTTTTAGGttttgttcaggttatgttcaggatatgtttCGCTTATGTTCAGAATTTGTTCAGGTTAAATTCAGGATATTTTTAGGTTTTGTTATGGTTGCCTTTAACATATTTTCTTGTCATGTTCAGATTTTGTTCTGGTTAAGTGGACATGTTCAAGTTAAATTCATGATATGTCCAGATTCTATTCAAGATATGTTTTGGTTTAGAAAACACAAATTCCAGCAATAAGCTGTGAGCAAAGTTAGCAAAGCCACTCCCCCAGTTTCACTTGTTGcaaattaaaagttaataaatagtaaaacacCTTTTAAGATAGGAAACTGaatgtttattatataattaccagtaattcattaaatatatatatatattttttaaatataaagatgaTTTTTAACATatagtaatataaaatgtaaaatataaagcttaattatattattctgctgAGGAAAATTCTTCCACAGACGGCTGGTCCACCCACACAGAAATACggaaaagctgaaaaaaatcctgcataaaacatgttcagTAAATTATGAATGTAATGTTGATGATTAACAGCTCCCTTTAGTGATTGCAAATTTGTTGACAAAAAGTAAAGTCCCCCTCAACtgcacaaaaacagaaatatgcaattattttatttataatttgtctTTGATTTtacaggaaaataaaaataagggcTGACTCCAGCTGAGCAAAGACTTCATGAGGAAGGATTTTTACTCATTGAAATGAGAGGGCTGTTGATGAATACTTTATTAGTGTAAATTAGTTGGTACAGTAAATATTTAAAGGATATAGAGCCTCAAATCTAAGCAAAAACAAAAGCTTGATCTCATCTGCAGATTTGGAAAATCAACCTTTATGGTTTTTACatttagttaaagtcagaattattcgcccccttctgGATTGAACATTTCCCCAGTGATGTTGAGCAggttgaggaaatgttcacagcatgtctgataatatctgttcttctggagaaattctgatttgttttatttcagctagaataaaagcagtttttaatgttttaaacaccattttagtgtcattattagcccctttaaattaaacttttattcaaaaaatgtttcaaaagttaaccaaacaaaccatcattaataacttgcctaattaccctaacctgcctagttaccctaattaccctagtgaatcctttacatgtcactttaagctgtatagaagtgtcttgaagaatatctagtctaatattatttactgtcatcatgacaaagagaaaataaatcagttattagagatgagttattaacactgttatgattagaaatgtgttggagaaatctgttAGACAGAATTCAGAAATAATAAAAAGGggaactaataattcaggggggttaataattctgacttcaactgttcataATAGCTGTCtctacatttgaaataataataataaaaacaccacTATTTTCCAGGGCCAAAACAGTTTTGCAATTTCGGCACAGAATTTAGTTAATCTGCTGAATCATGCAGTGGAAAGTATACTAACTGAAACTGTTGTACGTGACTAACTTAATCCCTAACTGTGGGATAAACCCTGAGCGAACACAGACGGTTCATATCTAGAGCTGATCTTGGGCAGTTTGCATGTCTTTAGATTTGTCAACCCGAAACTTACAACTGGATCTGTGCAACAGGCCTCAGATCTGAGATGATCAGCAGAGCAGTGATTGGCTGTCGGCAAAAcaacagcgtaatgacatcatctcaTTAATATTCAATTGAAGCCACATGAGCAAAATGATTAAATCACgagtaaatgaaaatatttgttaattaagAGACAACAACTTTACCAACTTGCACATTACTGGACAATTTGAGTGTATTTTCTGTGACAGCATTCAATCCTGCATCATAAGCTTAACTAGTTTTGTAAATTtagcaaatgtatatttataaaatttagtAAAATTAATGTAGTCACACTAGGGCCAAACGCAATCTGTGGACGTTTTATGCTATTTCTGTagagaattttgataaaaatctgcagaattattttgggagtatcatcaCTAAAACCgtgatatatgaaataaaaaaataatactttaacttttgtttcatgtttaaaaggcaaatccaatcagatccactttggtaaacaaagcaagtctctcatataatatctctactgaaGACAGAAAACATTACTGCACAAATTGCagtgtacataaatcagatgaacattttcatattagtcaataatattactataattaatttaaaaaaaacttgaatagatctacacacatttactcaagttaataaacagaatcaatgatgagctaaaaatctgtggGCACAGatttccgtgtgggcctagtcataacATTCATCTGAGAAGTGTGTGCATCACACCACCCGAAAGTCAGTGCTAAACGATTTCCAgtaaattacatttgaaaaaacCTTTCAGAAATATGAGCTCAGACACTCTTTAAAAGGTAACGCGCACAGTGATTTAACTACGCATCTGTATTTAAAAGCTCCATTTTGGCATCTTAAGAATATatagtcaagcccaaaattattcaccccctggcaaaatctgacttaaaatgttttaaaaaaacaaaaaaaaaaaaaagctgagaaatGTTGATTTTGCACAGATGCCTCGTGTACATCTTTACTTTTGGGAGAAGCATGGAGCATGGATAGTCACAGtataaaataaatctgaattcGGCAGGGATGTGAACTTCAGGTTGAACTGTACGTTAGACACTAAAATAGCCCAAATAAACAGGACAGTTTCTGTACATATAATAATGTGTAGATTCATTTAGTATTACATTTTTGTCac

Function

GO:

id name namespace
GO:0031638 zymogen activation biological_process
GO:0044455 obsolete mitochondrial membrane part cellular_component
GO:0098800 inner mitochondrial membrane protein complex cellular_component

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00034016 True 3684 lncRNA 0.33 2 58851970 58855883

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_017012 ptprsa coding downstream 56276 58777364 ~ 58795694 (-)
XLOC_017011 NA coding downstream 88685 58758910 ~ 58763285 (-)
XLOC_017009 CABZ01081294.2 coding downstream 211326 58631830 ~ 58640644 (-)
XLOC_017010 CABZ01081294.1 coding downstream 215178 58636676 ~ 58636792 (-)
XLOC_017008 epb41l3b coding downstream 270307 58513535 ~ 58581663 (-)
XLOC_017014 NA coding upstream 6739 58862622 ~ 58865496 (-)
XLOC_017015 fem1a coding upstream 12226 58868109 ~ 58869453 (-)
XLOC_017016 NA coding upstream 30056 58885939 ~ 58902477 (-)
XLOC_017017 sugp1 coding upstream 58791 58914674 ~ 58919975 (-)
XLOC_017018 NA coding upstream 66739 58922622 ~ 58925516 (-)
XLOC_017006 NA non-coding downstream 410475 58436760 ~ 58441495 (-)
XLOC_017003 AL954696.2 non-coding downstream 511453 58272078 ~ 58340517 (-)
XLOC_017001 NA non-coding downstream 638778 58212549 ~ 58213192 (-)
XLOC_017019 CU914601.1 non-coding upstream 182312 59038195 ~ 59038312 (-)

Expression


Co-expression Network