XLOC_020210 (si:dkey-253d23.4)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_020210
gene name si:dkey-253d23.4
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007133.7
NCBI id CM002906.2
chromosome length 39133080
location 9871238 ~ 9880408 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00040189
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>TCONS_00040190
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>TCONS_00040191
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Function

symbol description
si:dkey-253d23.4 Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane.

GO:

id name namespace
GO:0016020 membrane cellular_component
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-050208-730 Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane.

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000079762

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00040189 False 1042 mRNA 0.39 3 9871238 9873199
TCONS_00040190 False 2533 mRNA 0.36 6 9871326 9878369
TCONS_00040191 True 4153 mRNA 0.33 4 9872323 9880408

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_020209 si:dkey-253d23.3 coding upstream 2531 9862243 ~ 9868707 (+)
XLOC_020208 BX539307.1 coding upstream 15968 9854088 ~ 9855270 (+)
XLOC_020207 si:ch211-236g6.1 coding upstream 62444 9806867 ~ 9808794 (+)
XLOC_020206 si:dkey-102c8.2 coding upstream 75581 9793923 ~ 9795657 (+)
XLOC_020205 NA coding upstream 79871 9782954 ~ 9791367 (+)
XLOC_020211 NA coding downstream 6337 9886745 ~ 9904498 (+)
XLOC_020212 NA coding downstream 17563 9897971 ~ 9904623 (+)
XLOC_020213 blf coding downstream 36599 9917007 ~ 9923692 (+)
XLOC_020214 zgc:171686 coding downstream 59493 9939901 ~ 9945637 (+)
XLOC_020215 BX539307.2 coding downstream 100671 9981079 ~ 9984032 (+)
XLOC_020197 NA non-coding upstream 487754 9359899 ~ 9383484 (+)
XLOC_020196 BX927329.2 non-coding upstream 511835 9351372 ~ 9359403 (+)
XLOC_020195 NA non-coding upstream 528238 9341455 ~ 9343000 (+)
XLOC_020194 NA non-coding upstream 547421 9322757 ~ 9323817 (+)
XLOC_020216 NA non-coding downstream 109497 9989905 ~ 9991494 (+)
XLOC_020219 NA non-coding downstream 138492 10018900 ~ 10049233 (+)
XLOC_020221 NA non-coding downstream 193012 10073420 ~ 10097227 (+)

Expression


Co-expression Network