G73536


Basic Information

Item Value
gene id G73536
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 66335295 ~ 66342335 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU81279
agacagagcaggtagacctagacagagcaagtgagtacaggtagacctagacagagaaggtgagtacaggtagacctagacagagaaggtgagtacaggtagacctagacagagaaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagaaggtgagtacaggtagacctagacagagcatgtgagtacaggtagacatagacagagcaggtagacctagacaaagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtccaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagaacaggtagacctagacagagcaggtgagtgcaggtag
>TU81282
agacagagcaggtagacctagacagagcaagtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagaccttgacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtaggcctagacagagcaggtgagtacagctagacctagacagagcaggtgagtccaggtagacttagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtatacctagacagagcaggtgagtacaggt
>TU81285
agacagagcaggtagacctagacagagcaagtgagtacaggtagacctagacagagaaggtgagtacaggtagacctagacagagaaggtgagtacaggtagacctagacagagaaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagaaggtgagtacaggtagacctagacagagcatgtgagtacaggtagacatagacagagcaggtgagtacaggtagacctaaaCAGAGCAGGTGAGACCAGgtatacctagacagagcaggtgagtccaggtaagcctagacagagcaggtgagtacagggaGACCTAGATAgagcaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtccaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagaacaggtagacctagacagagcaggtgagtgcaggtaggcctagacagagcaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgaataCAGgtagacctagacagagcaggtgagtacaggtaggtctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagaccttgacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtaggcctagacagagcaggtgagtacagctagacctagacagagcaggtgagtccaggtagacttagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtatacctagacagagcaggtgagtacaggt
>TU81287
agacagagcaggtagacctagacagagcaagtgagtacaggtagacctagacagagaaggtgagtacaggtagacctagacagagaaggtgagtacaggtagacctagacagagaaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagaaggtgagtacaggtagacctagacagagcatgtgagtacaggtagacatagacagagcaggtgagtacaggtagacctaaaCAGAGCAGGTGAGACCAGgtatacctagacagagcaggtgagtccaggtaagcctagacagagcaggtgagtacagggaGACCTAGATAgagcaggtagacctagacagagcaggtaagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtgcaggtaggcctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagatctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagaacaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtggacctagacagagcaggtgaataCAGgtagatcTAGACAGAGCATGTAGACCTAGATagagcaggtgagtccaggtagacctagacagagcaggtagacctagacagagcaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtaggtctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtccaggtagacctagacagagcaggtgagtacagctagacctagacagagcaggtgagtccaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacgggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacatagacacagcaggtgagaacaggtagacctagacagagcaggtgagtgcaggtaggcctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagac
>TU81288
agacagagcaggtagacctagacagagcaagtgagtacaggtagacctagacagagaaggtgagtacaggtagacctagacagagaaggtgagtacaggtagacctagacagagaaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagaaggtgagtacaggtagacctagacagagcatgtgagtacaggtagacatagacagagcaggtgagtacaggtagacctaaaCAGAGCAGGTGAGACCAGGTAGActtagacagagcaggtgagacCAGGTAGActtagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtatacctagacagagcaggtgagtccaggtaagcctagacagagcaggtgagtacagggaGACCTAGATAgagcaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtagacctagacagagcaggtgagttcaggtaggtctagacagagcacgtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagcacaactagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtccaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtaggtctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtaggtctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagaccttgacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtaggcctagacagagcaggtgagtacagctagacctagacagagcaggtgagtccaggtagacttagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtatacctagacagagcaggtgagtacaggt
>TU81289
agacagagcaggtagacctagacagagcaagtgagtacaggtagacctagacagagaaggtgagtacaggtagacctagacagagaaggtgagtacaggtagacctagacagagaaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacagggaGACCTAGATAgagcaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtagacctagacagagcaggtgagttcaggtaggtctagacagagcacgtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagcacaactagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtaggtctagacagagcaggtgagtagaagtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtagacctagacagagcaggtga
>TU81278
gagcaggtgagtccaggtagacctagacagagcaggtagacctagacagagcaggtagacctagacagaacaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtgcaggtaggcctagacagagcaggtgagtacaggtagacatagacagagcaggtacacctagacagagcaggtagacctagacagagcaggtgagtccaggtaggcctagacagagctggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtatacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtatacctagacagagcaggtgagtacaggt
>TU81284
gacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtctaggtagacctagacagagcaggtgagtccaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagtacaggtagacctagacagagcaggtgagaacaggtagacctagacagagcaggtgagtgcaggtag

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU81279 False 585 lncRNA 0.63 2 66335295 66340770
TU81282 False 370 lncRNA 0.52 3 66335295 66342335
TU81285 False 1229 lncRNA 0.51 7 66335295 66342335
TU81287 False 1201 lncRNA 0.51 7 66335295 66341203
TU81288 False 1268 lncRNA 0.51 4 66335295 66342335
TU81289 False 700 lncRNA 0.51 3 66335295 66338337
TU81278 False 335 lncRNA 0.42 3 66336333 66342335
TU81284 True 262 lncRNA 0.33 2 66336748 66340770

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
wu:fj16a03 LOC100135970 coding upstream 316257 66014081 ~ 66019044 (+)
LOC110527177 LOC106576750 coding upstream 331955 66000257 ~ 66003340 (+)
LOC110532572 LOC106576752 coding upstream 335447 65993868 ~ 65999848 (+)
LOC110527164 LOC106576754 coding upstream 413010 65915581 ~ 65922285 (+)
LOC110527154 LOC106576753 coding upstream 423760 65898427 ~ 65911535 (+)
prph2b LOC106576743 coding downstream 9076 66351411 ~ 66355894 (+)
LOC118965274 LOC106576739 coding downstream 75160 66417495 ~ 66424081 (+)
LOC110527255 LOC106576738 coding downstream 207928 66550263 ~ 66567928 (+)
LOC110527278 qki coding downstream 296590 66638925 ~ 66734658 (+)
yipf3 yipf3 coding downstream 432533 66774868 ~ 66783655 (+)
G73501 NA non-coding upstream 66311 66268585 ~ 66268984 (+)
G73496 NA non-coding upstream 73702 66261094 ~ 66261593 (+)
G73492 NA non-coding upstream 78979 66256094 ~ 66256316 (+)
G73488 NA non-coding upstream 81953 66253121 ~ 66253342 (+)
G73528 NA non-coding downstream 18874 66361209 ~ 66457570 (+)
G73552 LOC106576742 non-coding downstream 27909 66370244 ~ 66371618 (+)
G73640 NA non-coding downstream 150804 66493139 ~ 66493679 (+)
G73611 NA non-coding downstream 221464 66563799 ~ 66564430 (+)
G73610 NA non-coding downstream 226310 66568645 ~ 66569036 (+)
G73515 NA other upstream 46826 66287679 ~ 66288469 (+)
LOC110526969 stk32c other upstream 1433671 64809255 ~ 64946164 (+)
G70011 NA other upstream 3059999 63274963 ~ 63275296 (+)
G67930 mcmbp other upstream 4601907 61729765 ~ 61733388 (+)
G74067 LOC106576735 other downstream 413872 66756207 ~ 66758984 (+)
G74139 NA other downstream 442000 66784335 ~ 66784969 (+)
G75747 NA other downstream 2032170 68374505 ~ 68374929 (+)
G78121 NA other downstream 4229330 70571665 ~ 70654961 (+)

Expression


Co-expression Network