G669229


Basic Information

Item Value
gene id G669229
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048572.1
NCBI id CM023226.2
chromosome length 91622588
location 7325550 ~ 7334714 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU762305
AACATTTATTTGGGTTAATTCACCTTGGTCAGACGACCACAACAGTCACAGTACATATTACATTTCTGTATAAAGTAAATAACTCACAACCATCCAAGATTCCAACAATTTATACTCAGGCCTTTATTTGGACAGCCCTaattttctcctcttctcccaatCCCGTGTTTGTCAGTTGGGGACCAGCAATCAACCCGTTTTGCTGGATGGATACTTGTAGTCCACTTCTCAGCAAGCACACCGCTCCACATATACAGTCCCTTCACAACGTTCACAGCCCTTttaacttttccacattttgtgttacagacAGAATTTAATATGAATTACATTTTAGATTTTTGTTATTGATAACCATAATGTCAAAAGTGGTCATTTTGTTTGCAGaacatgttgtttttttaaaatgcTGAAACTATTCCCCCCCTTTTGTTACGACTAacttaagttcaggagtaaaagtgttaaacaagtcacatggactcactgtgttcaataatagtggttaacatgatttttgaatgccTACCCCCACACATACAGGTAAGGCCCCTCAATCGAGTAGTGAATtgcaagcacagattcaaccacaacgaccagggaggtttttccaatgccttccaaagaagggcacctattggtagatgggtaaaaaaaaaaaaaaaagctaaatatCCCTTGGAGCATGGCAAAGTTATTTATTACACTTTGTatggtatatcaatacacccagtcactacaaatatacaggcgtccttcctaactcagttgccagaaaggaaggaaactgctctgggatttcaccatgaggccaacggtgaggatggctcaacattgtacttactccacaatactaacctaattgaaaagaaggaagcctccatatatcctgtttgcaacaaggtactaaagtaatactgcaaaaaaatgtggctaataaatgtaatgttttgtcctgaatacaaagcgttatgtttggggcaaaatcCAATACCGCGttccatattttcaagaatactagtggctgcatcatgttatgggtatgcttgtcattgttaaggactggggagtttttcaggataaaaaaaaataacagaatggagcaaagcacatgcaaaatcctagaggaaaatctttCAACcaaacactgggagatgaattcacctttgaGCAGAACAATaagctaaaacacaaggccaaatcgacATTGGATTTGCTtaaccaagacgacattgaatattTGAGTTGTCtcgttacagtttttacttacaTCTACTTGAAATtctatgacaagacttgaaaatggcatTCAAGTCTTATCAATGATTAACAACCATtactttttaaagaataatgtgtgaacttaca
>TU762306
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>TU762307
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>TU762300
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>TU762301
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>TU762304
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU762305 False 1368 TUCP 0.37 2 7325550 7334714
TU762306 False 1366 lncRNA 0.37 2 7325550 7334714
TU762307 False 1367 lncRNA 0.37 2 7325550 7334714
TU762300 False 1092 lncRNA 0.38 2 7325824 7334714
TU762301 False 1080 lncRNA 0.38 2 7325824 7334714
TU762304 True 357 lncRNA 0.38 2 7326553 7334714

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110529175 LOC106571087 coding downstream 38160 7256917 ~ 7287390 (-)
sipa1l1 LOC106571085 coding downstream 91025 7000285 ~ 7234525 (-)
LOC110529169 LOC106571069 coding downstream 359299 6855891 ~ 6966251 (-)
wdr21 dcaf4 coding downstream 523647 6786377 ~ 6801903 (-)
LOC118965487 NA coding downstream 564006 6759400 ~ 6761807 (-)
LOC110529304 LOC106608157 coding upstream 5985 7340699 ~ 7369522 (-)
LOC110529302 LOC106571090 coding upstream 66193 7400907 ~ 7423688 (-)
susd6 LOC106571091 coding upstream 83617 7418331 ~ 7480048 (-)
LOC118965488 NA coding upstream 333033 7667747 ~ 7670221 (-)
LOC110529176 LOC106571097 coding upstream 336081 7670795 ~ 7689709 (-)
G669270 NA non-coding downstream 20755 7303936 ~ 7304795 (-)
G669240 NA non-coding downstream 62402 7262887 ~ 7263148 (-)
G669230 NA non-coding downstream 69354 7253783 ~ 7256196 (-)
G669180 NA non-coding downstream 189221 7134033 ~ 7136329 (-)
G669166 NA non-coding downstream 220281 7104970 ~ 7105269 (-)
G669251 NA non-coding upstream 12229 7346943 ~ 7350739 (-)
G669285 NA non-coding upstream 16973 7351687 ~ 7355081 (-)
G669307 NA non-coding upstream 52550 7387264 ~ 7388163 (-)
G669311 NA non-coding upstream 59511 7394225 ~ 7395040 (-)
G669278 NA other downstream 5347 7317304 ~ 7320203 (-)
G669087 NA other downstream 333938 6989850 ~ 6991612 (-)
G668192 NA other downstream 1041529 6206558 ~ 6284021 (-)
G668238 NA other downstream 1043910 6280196 ~ 6281640 (-)
G669281 NA other upstream 81311 7416025 ~ 7418235 (-)
G669918 NA other upstream 773157 8107871 ~ 8110958 (-)
G670097 NA other upstream 1006276 8340990 ~ 8342120 (-)
G670549 NA other upstream 1242337 8577051 ~ 8577780 (-)

Expression


Co-expression Network