G1016364


Basic Information

Item Value
gene id G1016364
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048575.1
NCBI id CM023229.2
chromosome length 86280908
location 74048916 ~ 74052009 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1155946
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>TU1155947
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>TU1155949
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>TU1155950
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>TU1155951
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1155946 False 2881 lncRNA 0.37 3 74048916 74051911
TU1155947 False 1158 lncRNA 0.38 2 74048916 74050163
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TU1155950 False 2498 lncRNA 0.36 3 74048916 74052009
TU1155951 True 928 lncRNA 0.37 2 74048916 74050163

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
zgc:112294 LOC106579817 coding upstream 37673 74007753 ~ 74011243 (+)
selenoe fep15 coding upstream 43313 74001387 ~ 74005603 (+)
LOC110536373 LOC106579808 coding upstream 65957 73949572 ~ 73982959 (+)
hscb LOC106579811 coding upstream 751630 73283122 ~ 73297286 (+)
LOC110535110 LOC106579812 coding upstream 794124 73155366 ~ 73254792 (+)
LOC110536376 fbxo21 coding downstream 185715 74237724 ~ 74251184 (+)
LOC110536377 tesc coding downstream 199412 74251421 ~ 74262706 (+)
spring1 cssa20h12orf49 coding downstream 260522 74312531 ~ 74316581 (+)
LOC118937457 NA coding downstream 467376 74519385 ~ 74521046 (+)
rfc5 rfc5 coding downstream 637446 74689455 ~ 74697615 (+)
G1016329 NA non-coding upstream 42299 74006296 ~ 74006617 (+)
G1016253 NA non-coding upstream 79073 73969487 ~ 73969843 (+)
G1016233 NA non-coding upstream 113660 73934682 ~ 73935256 (+)
G1016232 NA non-coding upstream 114620 73934088 ~ 73934296 (+)
G1016554 NA non-coding downstream 138766 74190775 ~ 74190980 (+)
G1016617 NA non-coding downstream 245894 74297903 ~ 74298263 (+)
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G1016620 NA non-coding downstream 249407 74301416 ~ 74303560 (+)
G1016632 NA non-coding downstream 270433 74322442 ~ 74324226 (+)
G1014834 NA other upstream 1287971 72760521 ~ 72760945 (+)
G1013922 NA other upstream 2169244 71879296 ~ 71879672 (+)
G1013617 NA other upstream 2208446 71838302 ~ 71840882 (+)
LOC110536353 LOC106580623 other upstream 2251601 71738585 ~ 71797315 (+)
G1017593 NA other downstream 1248329 75269723 ~ 75328737 (+)
LOC110536406 LOC106570821 other downstream 2436499 76396096 ~ 76600566 (+)
G1018678 NA other downstream 2472129 76524138 ~ 76525567 (+)
G1019189 ptar1 other downstream 2766496 76818505 ~ 76821968 (+)
mamdc2a LOC106570826 other downstream 2837718 76889699 ~ 76939449 (+)

Expression


Co-expression Network