XLOC_029841 (CABZ01041962.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_029841
gene name CABZ01041962.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 6955900 ~ 6962784 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00058528
GATGACCAGAAGACTGTTGATGATGGTATTTGATTCTTTTATAATACATTTCTAATATATCTATTAATACATTTATCTTTAACAATGTTAATATCACCAATATATAAAACATCATCACTTGTCTTTGGCTGTTGGTCCACATTGTATATTGAATTACGCAACAGTGATTCAACTTTATTTGGTATTGCATCAAAAATAACAGCATAGTCTTTTGGTTTTACAGGAACTTTAAATTTTTAAGAAATTCAGAGTATGACAAGAGCAATCCAAGTTCATCAAGTAATTGACtagagtttgcatgtcctttttattttaatttttttctggttatatatatatattttttatttatatacgaAAATGAGAATATACAATCATAGTATGTTAACAAGAAATTGAAGAGACAAAAAGAACAACATTTTtggaaaaagaaacaacaacagatgacgagtttgcatgtcctccccgtgttggcgtggggaGTCGTTACGTCACGAttctgtttccgggtccaagcctcTGGAGCGCTAGCTGAATGTCCGTGTGTTTTCAGTATGCCGCAGTGCTGTGTTCCATGTTGTTTGAACCGATCAGAGTCAAAACAATTGAAGAAGTTGTCATTCTACCGATTTCCGTGCGATGAGAAACAGAAGAGGAAATGGCTGCAGTCGATAAGgCGCAAAAACTTCTACCCAAACTGTAACTCAAGGGTCTGCAGTTGGCATTTCCCCAATGGCAAAGCCGCTGGGCCTTCAAGATTTGCTTGGAATGAGGCAAAAGTTTTCCAGTTCCCCGACCCGCAGAGCCATACCTCTAAAAAGAGGGAACAGTCACCACCAGTGGATTCAATTGCTGATCGACAGCGCACCAAAGAGATGGCAACACAGACCCCTAGTACTGTAGTACTTCAAGTAGAGAATGACATCTTGAAGAAAGAGAATGAGATGTTGAGAAAACAATTGgagacacaaaaacaaacattttctttcaaTCAGATTTCATCCAATTCGGCCAGAGTGCAGTATTTTACTGGATTGCCTGATTCCGCCACTGTTTTCTTTTTGGAAGCATTACTTAATAAATTTGAACTGCAGCACCACTCTGATTGGACTGTCAAATGTATGCCACTAATTGATCAGCTGCTGATGACCCTGATGAAACTGAGGCTTAATTGTGGCCACACAGACCTGGCAACAAGGTTTAATTGTAGCACAGCCACAGTAACGAACATATGTACCACCATTGTTAGCACACTGTATGAGATTTTATATGTTGGCTTTCTTGAAGGCAACATCCCCTCCaaagaagaaaatcaaacatcACTGCCTGACTGTTTCCGGCCCTTTCCCAACTGTAGATTAGTGCTTGACTGCACTGAGGTTGCAGTTTGTAACACTGAGAGACTAGATGAACAGTGTCAGCTGTACAGTCAATATAAGAGAAGGACCACACTAAAGGCTCTTATTGGTGTATCACCCAATGGAGTAATTACATTTTCCAGTGACCTGTATGGAGGCAGTGCTTCAGACAAAGAAATAACAGCTGACTGTGGACTTCTCCAATACCTTAAACCAGGTGACATGGTAATGGCAGACAAGGACTTCACAATTCGTGAAATTTTGCCAAAGGGAGTGTCACTGAATACCCCATCTATCCTGGTCAATGGACAGTTTACTCAAGAGGAAGCAAACAATAACATGCTTATATCCAGTGCTCGGATACATGTGGTGCGTTCCATCCAGAGACTGAAATTGTTTTCTATTTTGGACCATGTACCATACCAATTCAGAAAGAACATCAATAAGATACTCAAAGTATGTGTGTGTCTTACAAATATGCAAACGCCAATTCTCAATGACATTCAATGAACCAATCATGTAAAGAATAAATtaagacgagtcttcgctgaggccagcttccagcctccactgctgagactgcagctctgcacaagacttttggccagtggagaaattaaaatggtcgtgccgaactgagtctggttctctcaagttttttttttttcttcactctcctatcggtgaagttttttttccctttccgctgtcgccactggcttgcatggttcaggatctgaaaagctacacatcgatgaatttgctcttcagtgtttggactctcagtaatgacttcaaaccacactgaactgagctaaactgaactgaactgaactgaacttaaacactaaaaactgaactacactgttccaataaCTATGATCATTTATgtggagctgctttgacacaatctacattgtaaaagcgctatacaaataaagctgaattgaattgaataaatggaTGCACTACACAGATGCACTATGTGagttgtaaattaatttaattagttcaCAGTAGAATGTAACATCTCAAACAATTTGCTGTTTATAATACGTAttgcatgctgatttatttacagtttggTAATAAATGCTCAAAATAAGATTGCAAACTTCATTAGAATATATTAACACTCCTGATAAAGTGCTCCTCTTCTTTATATAAATTTAACAGTAAAACATGGCAAGATCATGTAAATATCACCATGCAAACAATAAGTGctgaaaaataaacttaaaactgGGATAGAATGTTTGGTAGGAAACAATCTTCATAAAATGTTTCCAAAATGTCAGTATTAACAACCCATTCTGGGTCTTTGAGCACCGGTACAATGACAAGTTCAAGAGGACTCCAAACAAGCAGTTGGCACATCTTAGCTCTGATCAGATGTAAGTTGCCCTGGATTTGATGCCAGTAGTCATGAGATTGTTTTAGTGTCAGAGAACCAGTGACCTCATTCAGCTCCAGAAAAAAGTTCTTACTTTCTGCCACCTGCATGATAGTCTTGGTTCTGGCTGGCCATTGACACTTCACCTCAACAATACAATCCTCAGGCACTGTGCcatctgggcccggtttttcaaaaggttaaATCCGGAttaaattgatccagatttagtaatcctgtttttgcgatccgtgatcacgtaatccagcttactttttgagccagttttttaaAGTAACATCGGGATTGGATCAGTCTGATGCGGATAGGAACTTTACAGGATctctaaatctggataaccagtgctcaatcacaatgtagatggatagataggcctatgtaaagagcaacaagtagaatagccagtgtggggtcaatattactttatttttatttgaaatgaaaacacacacatataaaaaaaaaaagaaaaaccctatcccatcctcttccagcagtctgctcatctgagacctacaacacactGTACAttaaggatatttataataagtttcaaatacagatggattaaaaaaaaaagacttaatgtcaaaacctccacaataatttcagacttcctcatctgatgtggagagagcagcttgtctgagcgtagcctttaggaggcggatcttAAGTTTGCcattggtttgctgcagtttggtcagagtcagttgttcctctgccagatgaagctgtgcttctgccctttcagtctctttttgcaattgttgaaggtAATTTCAAAATtcagtgattgccattctttgcttttatttaggttattctgtaatcattgcatgcatcactaataaatattctaaaaacaaatatttttcgttgtgatgaatatatttatattaattagtaacagaataaaatgtgttgtttttggtcaattttggcagctgtttgggggattattttatgaggccaaactctttctactttctactaggcctatactgaaaggctgaatacattaaagcctataatcactatagcctgacagatgaacaaataaaattaaaacctttttaTGAATGAATAGTATATCTCGTGAGATACTGAATGatccaaaaataatattatttaatacattttttaagttttcattacattttgggcatgaaatccacactaaatccacccttctgatgggatcagtttaatccagtttttttttggatcaaagtgatccaaatcctacaaaaaaggtctgaaaaacccaaactaaagttttgatccggatcaaaaccaagattggattacgtgatctaatcttattaggtaatccgttttttcttttgaaaaacacattttcaagatttgatccattcCCTTATctaaaatcctagtggattacttttgaaaaactgggCCCAGGAGATCCACCGAGCAAACCGCTGTCAAAGAGGAAAAGTCCCCTCTCCTGAATGACCACACCAGTCTGCTCTGTATACAGCTGCTTCGCCCTTGGCTCATGGATGATACCCCAATCACATGCCTtggaaagggaaaaaaatcactttgttgGACGACTGACTGTCAACCTGTTTTCCATGCTTTAGAAACAAAAATGTCGTCAgcataaatagtatttttttttttaaatatcaacttACTTTAGATCCTCCTTTGAGGTTGTACTGACCAAGCAGGCTTTTAAACAAGGAAGGTGGGTAAGAACTTCGCTTGACTGCTGCTAAAACCAATCCAAAGTTGCTTGCTGTGATTCGCTTCTTACGATATgtaaacctgtaaaaaaaaaaaagttcacgt

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000076082

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00058528 True 4593 mRNA 0.38 2 6955900 6962784

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_029839 NA coding upstream 16191 6933062 ~ 6939709 (+)
XLOC_029837 smad4b coding upstream 33732 6875272 ~ 6922168 (+)
XLOC_029838 CT955987.1 coding upstream 79866 6875920 ~ 6876034 (+)
XLOC_029836 elac1 coding upstream 91773 6854345 ~ 6864127 (+)
XLOC_029835 me2 coding upstream 111594 6796291 ~ 6844306 (+)
XLOC_029842 NA coding downstream 76660 7039444 ~ 7106159 (+)
XLOC_029843 UNC5C coding downstream 316320 7279104 ~ 7477362 (+)
XLOC_029844 ANGPTL2 coding downstream 601860 7564644 ~ 7569302 (+)
XLOC_029845 NA coding downstream 952232 7915016 ~ 7919510 (+)
XLOC_029846 NA coding downstream 1023517 7986301 ~ 8000304 (+)
XLOC_029833 CU856358.1 non-coding upstream 226947 6722310 ~ 6728953 (+)
XLOC_029830 NA non-coding upstream 557974 6396274 ~ 6397926 (+)
XLOC_029828 CABZ01075627.1 non-coding upstream 1340454 5615331 ~ 5615446 (+)
XLOC_029848 NA non-coding downstream 1278002 8240786 ~ 8246336 (+)
XLOC_029851 FP102192.2 non-coding downstream 1321574 8284358 ~ 8334243 (+)

Expression


Co-expression Network