XLOC_003094


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_003094
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007121.7
NCBI id CM002894.2
chromosome length 45420867
location 45047229 ~ 45051538 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00006137
CGACAGAACAGTTGCAACAACTTGCATCAAACAAATCATTTCTTTCTTTGTAGTAAATTTATTGATTAGTCAAAATTAGACATTTGTATCGTACAAAAAGGCACAGACACTGCTTTAGTGCAAAACATCAGGCACAATCAGGCTTCAGATTAAAATCAACAATTCCCTTCAACATCCGACCATCTCCCTTTGCTAAAGCTACACGCATTAAAACCAGCAGATCTGCTCACAGTAAAGTTTAATTCACAGTACATgaagaaaaacatcataaaacaACCACAGACATAAAGATCAAACCAAACAACTTAAAACGCACAGGGTAAATTACACTCCATCTGGTTCATTTACCGTGAAAAGTGCTGAAAAATCAATGGCATGAGGTGGAAGTGAAGCCAGTAAACTTCCAGAAATCCCTCAGAAATGATTTATTGCAGCCAAAACTACCATCAGGCTGTAAATACATTCACTTTAACACCTTTCCCTCAATATTTACTCACACAAACCTCTATGTTTTCTTTGGCATAGAATGTAAATCCGTCCACTTTTGTGTTTCTAGCATAATGGTGAGTAAAGTGTGCAGAATTTTAATTTCTAGtctttttaaagagacagttcaccaaaaaaataaataaacatttgctgtttatttacccTCCGCTTTATTTCCTTcagtaaaatgagctgaaactcaTTAGTGATTCAGAAAATGCAGGTCAATCTGTACTTTTAGAGTCAAAAATCACACATACAGGCAGAACTAAAGTAATCCCTGTGATGATACATTGAGCTCAGATTCATTTTTAGGTGCGCTGGCCCTTTAAGATAATTATGTTGTAATTTAAGTCTAATGTTTAAATCAGCCAAACTCTTTAGTCATTTTGGAGTAATATGCTatcggtctaatccgattcaatgatctgtgCTAAGCCAAGCTAACTGTGCTCCTGttagacccagagattggctgaatgtgACAGAAGTTGGATTTTTGGATGAGCTGGCCCTTTAAATCCAGTTTTGTTGCTTATAATGACGCTGTTTCTTTAAAGGttgaataatgtaaataatttgaacTAAATGAAGACAGAAGTTTCAGGGTGCGCTGACCCTTTAAGATAATTATGTTGTAAATATTGTCTAATATTCAAATCCGCCCAACTCtttagtcatttttgagtgagatgctaatggtctaatccgattcaatgatctacgctaagctaagctaacagtgctCCTGCTAGACCCAGAGTTCGGCTAATTGTATTCAAAACATGGTAAAACTGACCTGTTTGACTTTAGGAGGGtgtaaaattagcatattttcataaaaagtggagtgtttctttaaactgatgtaatattattgttgtttttcccGTGACAAGACATTGAGCTTTTATTAGGCAAAATGATTGATCTGTGccaaaaactgaacattatttaaccGATATAAAAGAGTTTTAAAGAAACAGCGTCATTACAAGCAACAACACTGGTGAACATGTTCAGGCCTGTCTGCACAAAACTGGATTTAAAGGGccagcgcgcgcgcacacacacacacacacacacacacacaaaaaaaaaatcaaacttctgtcatcctttactgAATTTTAGCTGAAACTAATTAGTGATTCAGAAAACGCTGGTCAATCTGTACTTTTATAAccacaaaacacacatacaagcaGAACTAAAGTAATCCCTGTGACCATACATTGAGTCTCATTTTTGGGTGCGCTGGCCCTTTAAGATAATTATTTAGTAATAATGTCTAATGTTTAAATCAGCCAAACTCTTTAGTCATTtgtgagcgagatgctaatggtctaatccgattcaatgatctatgctaagctaagctaactcagagatcggctgaatgagacagaagtttcatttttgggtgcgcTGGCCCTTTAAGATAATTATGTAGTAATAACGTCCAATGTTTAAATCAGCCAAGCTCtttagtcatttttgagtgagatgctaatggtctaaacagattcaatgatctatgctaagctaagctaacagtgctCCTTTTAGgtccagagattggctgaatgtattgaaaacatggtaaaactcaGCTGTTTGGCTTTGAGGGTGTAAAGtgagcatatttaaaaaaaaacttaaggagTGCTTCTTTAAATTGATCCaacattattgttgtttttccCCTGTGATGATACATGAGGCTCTAATGAAGAAAAATGATTGATCTGTGCAAAAGGATGAACATTATTTACACTATTTAACTGATAAAATAGAGTTTTAAAGAAACAGCGTCATTATAAGCAGCAACACTGGTGAACATGTTCAAGCCTGTCTGCACAAAACTGGATTTAAAGGGCCAGCGCACACAAAATTGTAACATCTGTCATCATTACCTGGATtctttaaacctgtttgaggttctgttgagcaaaaaaaaaaaacaagatattctgaggaATGCTAGAAATAAAAAggagtattttttgttcctactacagaagtcaatgtttgattcttcagtatatcttgtttttgtgttcaacagaaaaatcaAACAGGTTTAAGGAAGCCAGTAAATGAAGAAGTTTCATTTTTTTTGTTGCGCTGGCCCTTTAAGATAATTATGCTGTgaataatgtttaattttcttGCACATGGTTTCACTGAGCCACAGGGAtttattttgctgttgttttctttgactctcaaagtgcctGTAGCTGATGACTTATTTAAATATCTGCATTATATGAATCAATGATGAActttgttaactttttttttggaaCTAAATTTATGATTTAATGTAATTGAAATGTGCTCATTTACCACTCTCCTGCAGTTAAACAGGAGTGTTTCGCCACATTTTAAGCCATTTAGTCAATCTCTGGTCtaacaggagcacttttagcttagcttagcataatttattgaatcagattagaccattagcatctcactgaaaaaaaaaattaccaaagagCTTCCATAATTTAGTTAAAGCTTAACTCTTCTGTAGCTACATCATGCACCAAGCGGAAAAATAATACGCAAAGCCTCAAAATAGCTAGGTAACTAGCTTAGCGTgtagcctagaaaatagcaacttttcattttccatcttATTACTTGATATTACAGACCAGTTAAGTTTAAAAATTgagcttaaaaaaaacacatttttttttgagtg
>TCONS_00006138
ATTTTCCCTTatttaaagcaatgcattttaaAGAATTCAATGAATCTTTTCTGCGACAGAACAGTTGCAACAACTTGCATCAAACAAATCATTTCTTTCTTTGTAGTAAATTTATTGATTAGTCAAAATTAGACATTTGTATCGTACAAAAAGGCACAGACACTGCTTTAGTGCAAAACATCAGGCACAATCAGGCTTCAGATTAAAATCAACAATTCCCTTCAACATCCGACCATCTCCCTTTGCTAAAGCTACACGCATTAAAACCAGCAGATCTGCTCACAGTAAAGTTTAATTCACAGTACATgaagaaaaacatcataaaacaACCACAGACATAAAGATCAAACCAAACAACTTAAAACGCACAGGGTAAATTACACTCCATCTGGTTCATTTACCGTGAAAAGTGCTGAAAAATCAATGGCATGAGGTGGAAGTGAAGCCAGTAAACTTCCAGAAATCCCTCAGAAATGATTTATTGCAGCCAAAACTACCATCAGGCTGTAAATACATTCACTTTAACACCTTTCCCTCAATATTTACTCACACAAACCTCTATGTTTTCTTTGGCATAGAATGTAAATCCGTCCACTTTTGTGTTTCTAGCATAATGGTGAGTAAAGTGTGCAGAATTTTAATTTCTAGtctttttaaagagacagttcaccaaaaaaataaataaacatttgctgtttatttacccTCCGCTTTATTTCCTTcagtaaaatgagctgaaactcaTTAGTGATTCAGAAAATGCAGGTCAATCTGTACTTTTAGAGTCAAAAATCACACATACAGGCAGAACTAAAGTAATCCCTGTGATGATACATTGAGCTCAGATTCATTTTTAGGTGCGCTGGCCCTTTAAGATAATTATGTTGTAATTTAAGTCTAATGTTTAAATCAGCCAAACTCTTTAGTCATTTTGGAGTAATATGCTatcggtctaatccgattcaatgatctgtgCTAAGCCAAGCTAACTGTGCTCCTGttagacccagagattggctgaatgtgACAGAAGTTGGATTTTTGGATGAGCTGGCCCTTTAAATCCAGTTTTGTTGCTTATAATGACGCTGTTTCTTTAAAGGttgaataatgtaaataatttgaacTAAATGAAGACAGAAGTTTCAGGGTGCGCTGACCCTTTAAGATAATTATGTTGTAAATATTGTCTAATATTCAAATCCGCCCAACTCtttagtcatttttgagtgagatgctaatggtctaatccgattcaatgatctacgctaagctaagctaacagtgctCCTGCTAGACCCAGAGTTCGGCTAATTGTATTCAAAACATGGTAAAACTGACCTGTTTGACTTTAGGAGGGtgtaaaattagcatattttcataaaaagtggagtgtttctttaaactgatgtaatattattgttgtttttccCCTGTGATGATACATGGAGCTTTTATAAAGCAAATTGATTGATCTGTGCCAAaa

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00006137 False 3205 lncRNA 0.35 2 45047229 45051485
TCONS_00006138 True 1486 lncRNA 0.35 3 45048515 45051538

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_003093 polm coding downstream 18188 45015225 ~ 45029041 (-)
XLOC_003092 ved coding downstream 45033 44997062 ~ 45002196 (-)
XLOC_003091 purbb coding downstream 65934 44979533 ~ 44981295 (-)
XLOC_003090 NA coding downstream 70586 44974236 ~ 44976643 (-)
XLOC_003089 tuba7l coding downstream 122940 44917351 ~ 44924289 (-)
XLOC_003095 mrps24 coding upstream 2039 45053577 ~ 45058886 (-)
XLOC_003096 pargl coding upstream 153869 45205407 ~ 45230081 (-)
XLOC_003097 NA coding upstream 304086 45355624 ~ 45357482 (-)
XLOC_003098 CABZ01117348.1 coding upstream 319506 45371044 ~ 45379831 (-)
XLOC_003084 CABZ01072084.1 non-coding downstream 545510 44493919 ~ 44501719 (-)
XLOC_003080 NA non-coding downstream 659427 44380918 ~ 44387802 (-)
XLOC_003076 CABZ01074708.1 non-coding downstream 771344 44268481 ~ 44275885 (-)
XLOC_003075 CABZ01085662.1 non-coding downstream 794125 44242236 ~ 44253104 (-)

Expression


Co-expression Network