XLOC_033465


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_033465
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007118.7
NCBI id CM002891.2
chromosome length 74282399
location 8835309 ~ 8840615 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00068777
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>TCONS_00068778
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>TCONS_00068779
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00068777 False 4710 lncRNA 0.34 2 8835309 8840615
TCONS_00068778 False 4421 lncRNA 0.34 2 8835313 8840615
TCONS_00068779 True 4385 lncRNA 0.35 2 8835334 8840615

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_033464 si:ch211-1o7.2 coding upstream 154127 8670398 ~ 8681182 (+)
XLOC_033463 NA coding upstream 208625 8623945 ~ 8626684 (+)
XLOC_033462 jac8 coding upstream 290454 8543317 ~ 8544855 (+)
XLOC_033461 jac4 coding upstream 376847 8456999 ~ 8458462 (+)
XLOC_033460 CR382283.1 coding upstream 405390 8428954 ~ 8429919 (+)
XLOC_033466 zgc:113057 coding downstream 167757 9008372 ~ 9046302 (+)
XLOC_033467 NA coding downstream 220810 9061425 ~ 9063381 (+)
XLOC_033468 pcsk6 coding downstream 348932 9189547 ~ 9273323 (+)
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XLOC_033470 selenos coding downstream 468010 9308625 ~ 9322493 (+)
XLOC_033457 NA non-coding upstream 483002 8344719 ~ 8352307 (+)
XLOC_033454 CABZ01030291.2 non-coding upstream 1056133 7778963 ~ 7779176 (+)
XLOC_033453 CABZ01030292.1 non-coding upstream 1062931 7772165 ~ 7772378 (+)
XLOC_033472 NA non-coding downstream 715429 9556044 ~ 9556645 (+)
XLOC_033476 NA non-coding downstream 1212728 10053343 ~ 10054205 (+)
XLOC_033477 CU184872.1 non-coding downstream 1407457 10248072 ~ 10248187 (+)
XLOC_033481 NA non-coding downstream 1826856 10667471 ~ 10681656 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) G775603 NA non-coding NC_048573.1 CM023227.2 16045612 ~ 16047293 (-)