XLOC_033836


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_033836
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007118.7
NCBI id CM002891.2
chromosome length 74282399
location 31927988 ~ 31975960 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00068867
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>TCONS_00068868
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00068867 False 15293 lncRNA 0.40 1 31927988 31943280
TCONS_00068868 True 786 lncRNA 0.49 6 31930793 31975960

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_033835 mybpc3 coding upstream 28063 31838320 ~ 31899925 (+)
XLOC_033834 eif3jb coding upstream 495885 31425976 ~ 31432103 (+)
XLOC_033833 strc1 coding upstream 502532 31395525 ~ 31425456 (+)
XLOC_033832 ctdspl2b coding upstream 532477 31374383 ~ 31395511 (+)
XLOC_033831 casc4 coding upstream 560071 31339129 ~ 31367917 (+)
XLOC_033837 mettl15 coding downstream 45709 32021669 ~ 32142810 (+)
XLOC_033838 NA coding downstream 194239 32170199 ~ 32171758 (+)
XLOC_033839 lgr4 coding downstream 393066 32369026 ~ 32460223 (+)
XLOC_033840 NA coding downstream 486683 32462643 ~ 32472938 (+)
XLOC_033841 BX511109.1 coding downstream 499383 32475343 ~ 32491150 (+)
XLOC_033822 AL935053.1 non-coding upstream 1451606 30475836 ~ 30476382 (+)
XLOC_033821 BX957301.1 non-coding upstream 1488967 30438905 ~ 30439021 (+)
XLOC_033814 NA non-coding upstream 1810880 30094809 ~ 30117108 (+)
XLOC_033813 NA non-coding upstream 1851816 30072878 ~ 30076172 (+)
XLOC_033808 BX914219.4 non-coding upstream 1996349 29931525 ~ 29931639 (+)
XLOC_033844 AL929252.1 non-coding downstream 705680 32681640 ~ 32681755 (+)
XLOC_033853 BX571811.1 non-coding downstream 1192959 33168919 ~ 33171622 (+)

Expression


Co-expression Network