XLOC_037688


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_037688
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 12889898 ~ 12903013 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00075306
CACATTTCAGGTTATCAGTTCACTATACTGTACTGGATTAGATTTATTTCAAAGATTTAAAGAGAGAAATAGGTGATTTTTTTGGCAATCACTCTTTTGATGCTTTTATTTTTGattcaaatttatttttggaTGGCATGCTGATTCTATGGTCCTGTTATCTTTTTCTGGCATATCTGTCTCTCTACCTCTCCTTCAACTTTCTGAGGAGTTTATTAACCCTGGACAGTGAAAAGCCAAAGGTGACTGCAAGAATTTGCAGAAAGAGACGACGGAGGGGAAGGTCAAGGATGTCCATGAAGATGGGTTTTCAACACAAGAGAGCACattagagGATGGAAACGTAGCGGTCACGGTCAGAGCGGGACTGTTCGTGTACAAAACCAAGAGCGTGCATGAGCTCATGGGACGCCACTCCTGACCACATGCAGCCTGGAGACTGCAGAGAGACCGTCTGACTGCCTCCTGTCATTCCCAGATATGACCAGCAGCTGACGGGACAAACAGTGAGAATACTTCTACAATGTACCCTGTTTTGGGCTGAATATCCAGATAGTCCCTCTGGTGAGTTCTGGGCACGAAGCGCACACAAGTGTCCTGTTCGATGAGCTCCATGCCTTCCTTAATGTTCTTCACGTCTGCATCGTCTGTCAAACCAAAACCAAATTTGGTCCACAGGCAGCTCCTGGCAAAACAGTTCTTCTGACTCCTTCCAGACACAGCAATATCTCCTTCTCTGAGATTGGTGCCGTCCACAGAAAAGACACCTAGAGACAGagaataagacttttttttggcATTGATTCTTTCATTAATTACTTTTTGCAGTCCTTTTCAATTCACAAAAGGTTATTTAGAGAAGATTAAATTGCTGTGGATGTTTAAAACACTTTATCTGTTAACTGAAAACGCAACTTGGCGTCTACAAGTGATTAGTCATACACTGTTAGATTAAGGTTAGGGGGCTTGAGTAAGTTGTAACTGTTACTTTAAAAAGTTTCCAATATTTATAGTCAACG
>TCONS_00075307
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00075306 False 1019 lncRNA 0.42 4 12889898 12902782
TCONS_00075307 True 3846 lncRNA 0.32 1 12899168 12903013

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_037687 ankzf1 coding downstream 1741 12834414 ~ 12888157 (-)
XLOC_037686 myo10l3 coding downstream 77962 12664373 ~ 12811936 (-)
XLOC_037685 pttg1ipb coding downstream 230758 12655278 ~ 12659140 (-)
XLOC_037684 sumo3b coding downstream 236914 12648705 ~ 12652984 (-)
XLOC_037683 tspearb coding downstream 264513 12596038 ~ 12625385 (-)
XLOC_037689 NA coding upstream 42544 12945557 ~ 12948957 (-)
XLOC_037690 NA coding upstream 51554 12954567 ~ 12956248 (-)
XLOC_037691 NA coding upstream 194208 13097221 ~ 13120257 (-)
XLOC_037692 NA coding upstream 343011 13246024 ~ 13246524 (-)
XLOC_037693 CR407547.2 coding upstream 413906 13316919 ~ 13343167 (-)
XLOC_037677 NA non-coding downstream 718113 12076843 ~ 12171785 (-)
XLOC_037675 NA non-coding downstream 1034593 11822379 ~ 11855305 (-)
XLOC_037673 NA non-coding downstream 1234867 11595987 ~ 11655031 (-)
XLOC_037671 NA non-coding downstream 1317544 11571312 ~ 11572354 (-)
XLOC_037667 BX000444.1 non-coding downstream 2043349 10845918 ~ 10846549 (-)

Expression


Co-expression Network