LOC118944712


Basic Information

Item Value
gene id LOC118944712
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048591.1
NCBI id CM023245.2
chromosome length 51556237
location 40667017 ~ 40668632 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036965112.1
TGTTCACACTATCTATCCATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTCACACTATCTATCCATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACGCACTGTTCACACTATCTATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTcacactatctatctatctctgttgTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTcacactatctatctatctctgttgTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACGCACTGCATCAGGTAACACTGTTCACACTATCTATCCATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTCACACTATCTATCCATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTcacactatctatctatctctgttgTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTTCACACTATCTATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACGCACTGTTCACACTATCTATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTCACACTATCTATCCATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTCACACTATCTATCCATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTTCACACTATCTATCCATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACGCACTGCATCAGGTAACACTGTTCACACTATCTATCCATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTCACACTATCTATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTCACACTATCTATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTCACACTATCTATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTCACACTATCTATCCATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTCACACTATCTATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTCACACTATCTATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTCACACTATCTATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTCACGCTATCTATCCATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATAGTCCTATTCagctacacacactctctctctcctctttctctctctctctctcctctttctctctcttttatttaTATATCTTCCCACTGagcctaac
>XM_036965113.1
TGTTCACACTATCTATCCATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTCACACTATCTATCCATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACGCACTGTTCACACTATCTATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTcacactatctatctatctctgttgTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTcacactatctatctatctctgttgTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACGCACTGCATCAGGTAACACTGTTCACACTATCTATCCATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTCACACTATCTATCCATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTcacactatctatctatctctgttgTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTTCACACTATCTATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACGCACTGTTCACACTATCTATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTCACACTATCTATCCATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTCACACTATCTATCCATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTTCACACTATCTATCCATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACGCACTGCATCAGGTAACACTGTTCACACTATCTATCCATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTCACACTATCTATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTCACACTATCTATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTCACACTATCTATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTCACACTATCTATCCATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACACACTGTTCACACTATCTATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATGGTCCTGTTCAGCTACATACTGTTCACACTATCTATCCATCTCTGTTGTCTCTCAACTACACTATAGTCCTGTTCAGCTACGCACTGCATCAGCTACACACTGTTCACGCTATCTATCCATCTCTGTTGTCTCTACTACACTATAGTCCTATTCagctacacacactctctctctcctctttctctctctctctctcctctttctctctcttttatttaTATATCTTCCCACTGagcctaac

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC108270343

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036965112.1 False 1454 mRNA 0.43 3 40667017 40668632
XM_036965113.1 True 1417 mRNA 0.43 3 40667017 40668632

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ssr3 LOC106581450 coding upstream 369465 40294831 ~ 40297552 (+)
LOC110507223 LOC106613251 coding upstream 728938 39781189 ~ 39938079 (+)
LOC110507222 LOC106581437 coding upstream 965805 39694561 ~ 39701212 (+)
LOC110508028 neus coding upstream 985457 39667989 ~ 39681560 (+)
LOC118944799 NA coding upstream 1627392 39039573 ~ 39039625 (+)
LOC110507225 LOC106581476 coding downstream 23771 40692403 ~ 40840064 (+)
LOC110508042 LOC106613262 coding downstream 172074 40840706 ~ 40847141 (+)
LOC110507226 LOC106581479 coding downstream 188498 40857130 ~ 40878102 (+)
LOC118944684 LOC106613262 coding downstream 235882 40904514 ~ 40907313 (+)
LOC110508044 LOC106581474 coding downstream 323446 40992078 ~ 40996568 (+)
G2082525 NA non-coding upstream 26626 40636576 ~ 40640391 (+)
G2082517 NA non-coding upstream 43388 40622440 ~ 40623629 (+)
G2082518 NA non-coding upstream 46922 40619412 ~ 40620095 (+)
G2082516 NA non-coding upstream 49174 40617547 ~ 40617843 (+)
G2082500 NA non-coding upstream 70736 40596030 ~ 40596281 (+)
G2082509 NA non-coding downstream 3058 40671690 ~ 40672527 (+)
G2082554 NA non-coding downstream 26976 40695608 ~ 40696534 (+)
G2082604 NA non-coding downstream 136841 40805473 ~ 40805922 (+)
G2082609 NA non-coding downstream 143463 40812095 ~ 40812351 (+)
G2082162 NA other upstream 709266 39957215 ~ 39957751 (+)
G2081949 NA other upstream 733182 39931874 ~ 39933835 (+)
G2081884 LOC106581433 other upstream 829634 39827658 ~ 39837383 (+)
G2080014 NA other upstream 2721866 37944932 ~ 37945151 (+)
G2083005 NA other downstream 312738 40981370 ~ 40984854 (+)
G2083239 NA other downstream 543572 41212204 ~ 41212772 (+)
LOC110507232 LOC106593204 other downstream 837727 41485189 ~ 41507173 (+)
G2083851 NA other downstream 1302627 41971259 ~ 42112036 (+)

Expression


Co-expression Network