G2216976 (LOC106584281)


Basic Information

Item Value
gene id G2216976
gene name LOC106584281
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_050570.1
NCBI id CM025857.1
chromosome length 46327593
location 25819255 ~ 25857045 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2535824
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>TU2535828
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>TU2535818
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>TU2535825
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>TU2535827
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>TU2535831
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Function

NR:

description
glycosaminoglycan xylosylkinase-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2535824 False 1976 lncRNA 0.45 2 25819255 25857045
TU2535828 False 1852 lncRNA 0.44 4 25819255 25857045
TU2535818 False 3326 lncRNA 0.47 2 25852943 25857045
TU2535825 False 3696 lncRNA 0.48 2 25852943 25857045
TU2535827 False 2950 lncRNA 0.46 2 25852943 25857045
TU2535831 True 3065 lncRNA 0.47 4 25852943 25857045

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110521612 LOC106584284 coding downstream 13603 25779306 ~ 25805652 (-)
LOC110521609 LOC106584282 coding downstream 136200 25656346 ~ 25683055 (-)
LOC110521606 ipo13 coding downstream 335394 25429088 ~ 25483861 (-)
LOC110521604 LOC106584290 coding downstream 412095 25392026 ~ 25407160 (-)
rabggta rabggta coding downstream 474235 25337800 ~ 25345020 (-)
LOC110521615 tnfl6 coding upstream 81726 25938771 ~ 25942364 (-)
LOC110521616 LOC106584280 coding upstream 114723 25971768 ~ 25973913 (-)
LOC100305228 prdx6 coding upstream 270491 26127536 ~ 26132937 (-)
itpa itpa coding upstream 450541 26307586 ~ 26312047 (-)
pigc pigc coding upstream 509843 26366888 ~ 26370050 (-)
G2216871 NA non-coding downstream 133215 25668905 ~ 25686040 (-)
G2216807 NA non-coding downstream 225663 25592534 ~ 25593592 (-)
G2216823 NA non-coding downstream 228061 25590737 ~ 25591194 (-)
G2216696 NA non-coding downstream 436457 25361917 ~ 25382798 (-)
G2216699 NA non-coding downstream 464415 25350871 ~ 25354840 (-)
G2217007 NA non-coding upstream 10830 25867875 ~ 25868185 (-)
G2217010 NA non-coding upstream 13431 25870476 ~ 25870726 (-)
G2217011 NA non-coding upstream 13766 25870811 ~ 25871046 (-)
G2217035 NA non-coding upstream 51950 25908995 ~ 25909417 (-)
G2217037 NA non-coding upstream 52716 25909761 ~ 25910074 (-)
G2213647 NA other downstream 2619849 23197647 ~ 23199406 (-)
G2213654 NA other downstream 2639644 23178506 ~ 23179611 (-)
LOC110521564 LOC106584326 other downstream 2818007 22982517 ~ 23008109 (-)
G2212908 LOC106613883 other downstream 3908519 21907963 ~ 21910736 (-)
G2212755 NA other downstream 4152640 21665964 ~ 21666615 (-)
G2217605 NA other upstream 60309 25917354 ~ 25920245 (-)
G2217805 prrc2c other upstream 379640 26236685 ~ 26237398 (-)
G2217824 NA other upstream 411301 26268346 ~ 26341495 (-)
G2218118 NA other upstream 1031844 26888889 ~ 26890611 (-)
LOC110521640 LOC106584214 other upstream 1316208 27157549 ~ 27180815 (-)

Expression


Co-expression Network