G92501



Basic Information


Item Value
gene id G92501
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_053120.1
NCBI id CM020917.1
chromosome length 41568296
location 1925990 ~ 2016043 (-)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence


>TU124614
gtagtagtagtagtagtagtagataactttattgtcccttgGGGGCAGTTGGGTTTGTGGCACAATCGCAAGGCACTTCATGAcaagacatcagacatatgatccAAACAcagtccttacatcagacacCGACACACATAACATGAAgaatatacatcacacactacaatacactacaacacactacaatacactacaacacactataacacactataacacactacaatacactacaacacactacaacacactacaacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataatacactataacacactataatacactataatacactataacacactataatacactataatacactataacacactataacacactacaacacactacaacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactacaacacactacaacacactacaacacactacaacacactataacacactacaacacactacaacacactacaacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactacaatacactacaatacactataacacactataacacaATACAatacactacaatacactacaacacactataacacactataacacactataacacactataatacactacaacacactataacacactataatacactataacacactataatacactataacacactataatacactacaacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactacaacacactacaacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactacaacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataatacactataatacactataacacactataacacactataatacACTATAATACACTAGAACACACTAGAACACACTagaacacactataacacactataacacactataacacactataatacactataacacactataacacactataatacactataacacactacaacacactataacacactataacacactacaacacactataacacactacaatacactagAACACACTagaacacactataacacactataatacactataacacactataacacactataacacactataacacactagaacacactataacacactataacacactataacacactataatacactataatacactataacacactataacacactataacacactataacacactacaacacactataacacactacaatacactataacacactataatacactagaacacactataacacactataacacactataacacactataacacactacaacacactaGAACACACTATaatacactataacacactataacacactataatacactataacacactataacacactataacacactagaacacactataacacactataacacactataacacactataatacactagaacacactataacacactataacacactagaacacactataacacactagaACACACTagaacacactataacacactataacacactataacacactacaacacactataatacactataacacactataatacactataatacactataacacactataacacactataacacactataatacACTATAATACACTATAATACACTATAATACACTAGAACACACTATAATACACTATAATACACTATAATACACTAGAACACACTATaatacactataacacactataacacactataatacactataacacactataatacACTATAATACACTATAATACACTataacacactagaACACACTAGAACACACTAGAACACACTAgaacacactacaacacactacaacacactaGAACACACTAGAACACACTAGAACACACTAGAACACACTAGAACACACTAGAACACACCCTTGGGTGGGACCAGGCCAGCTGGACCACTAAGCTTTAGCTTATTCTGACTGATTTGAGGCTTTATGGCTCGTGGTTGGATGTGTTCGTGGTCAGAAGGGGCAGGAAGAAACGAGGCCTAGATGGCAGTAGTTTAACCTGAGATGGGG
>TU124619
gtagtagtagtagtagtagtagataactttattgtcccttgGGGGCAGTTGGGTTTGTGGCACAATCGCAAGGCACTTCATGAcaagacatcagacatatgatccAAACAcagtccttacatcagacacCGACACACATAACATGAAgaatatacatcacacactacaatacactacaacacactacaatacactacaacacactataacacactataacacactacaatacactacaacacactacaacacactacaacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataatacactataacacactataatacactataatacactataacacactataatacactataatacactataacacactataacacactacaacacactacaacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactacaacacactacaacacactacaacacactacaacacactacaacacactataacacactacaacacactacaacacactacaacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactataacacactacaatacactacaatacactataacacactataacacactacaaTA

Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU124614 True 2353 lncRNA 0.33 7 1925990 2016043
TU124619 False 701 lncRNA 0.34 2 2015010 2016043

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
si:ch211-1a19.3 NA coding downstream 320024 1583388 ~ 1605966 (-)
LOC120565409 cunh19orf24 coding downstream 464041 1456573 ~ 1461949 (-)
si:ch211-152f22.4 NA coding downstream 530462 1390241 ~ 1395528 (-)
map1sa NA coding downstream 703572 1189910 ~ 1222418 (-)
palm1a NA coding downstream 739420 1168821 ~ 1186570 (-)
LOC120565577 NA coding upstream 118518 2134561 ~ 2163094 (-)
LOC120565424 NA coding upstream 437276 2453319 ~ 2456640 (-)
LOC120565579 NA coding upstream 476769 2492812 ~ 2526088 (-)
apc2 apc2 coding upstream 519284 2535327 ~ 2600128 (-)
LOC120565580 NA coding upstream 587370 2603413 ~ 2617402 (-)
G92447 NA non-coding downstream 11567 1898546 ~ 1914423 (-)
G92498 NA non-coding downstream 28943 1896673 ~ 1897047 (-)
LOC120565417 NA non-coding downstream 101744 1815893 ~ 1824246 (-)
G92460 NA non-coding downstream 121821 1710477 ~ 1804169 (-)
G92466 NA non-coding downstream 153056 1715473 ~ 1772934 (-)
G92488 NA non-coding upstream 11490 2027533 ~ 2048577 (-)
G92518 NA non-coding upstream 38516 2054559 ~ 2056284 (-)
G92523 NA non-coding upstream 62403 2078446 ~ 2093734 (-)
G92524 NA non-coding upstream 75603 2091646 ~ 2092146 (-)
G92531 NA non-coding upstream 85489 2101532 ~ 2101922 (-)
G92445 NA other downstream 12953 1893688 ~ 1913037 (-)
G92495 NA other downstream 35285 1888362 ~ 1890705 (-)
LOC120565407 camk4,LOC104962492,LOC102785978 other downstream 252622 1420640 ~ 1673368 (-)
G92437 NA other downstream 367572 1522491 ~ 1558418 (-)
G92415 NA other downstream 402909 1275932 ~ 1523081 (-)
slc30a7 slc30a7 other upstream 47623 2063666 ~ 2087124 (-)
G92535 NA other upstream 272232 2288275 ~ 2307309 (-)
G92564 NA other upstream 344948 2360991 ~ 2361662 (-)
G92565 NA other upstream 350109 2366152 ~ 2369666 (-)
G92930 NA other upstream 879886 2895929 ~ 2898679 (-)

Expression



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