G205344


Basic Information

Item Value
gene id G205344
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053131.1
NCBI id CM020928.1
chromosome length 36057207
location 22930930 ~ 22947866 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU278109
ATTTTTCACAGGTTACACAGATTTATTGCACAAAACATTGTCTGAAATCACAAAAAGTGCTGTTTAGTAAATTAAATTAACTGATGTAATTTGCAATTGCTTCCTTCATCtggcaaaagtaaaaaaaaagatcgtgAAAGCATCTTGGTCCTTCATGGTATTCAGATGAGTGCAGCGAGGCCTAGCACTGTTCCTCCAACACCAGCTGCTCCAGCGCCAGCCGCAGCTGCAGTGGCAGCTCCTGACAGACCAGTTGCAGCTACACAGCGAGAAATACACAGGTTCAATATCAAGGTACAGAGAAGCTGACAAAAGGATTGTCCTCAAGCTAAAAGAGTAGGCTAGCCTAAGTAAAATGGTAGCATTAGGCTACTAGCGTCATGTTCTACATAAACACTGTATTGTAAACCAAAAGCTACACATCATTATGACAATGTGAAATTACCATTAAGATGAACGTCAAAACCACAAGattaacatttaaacaaaaacgaaaaaaaaatcaagttaaGGGTTTTACCTGCTGCCTGACAAATAGCCACCAGACTTCCTGCTGCCACTCCTCCTCCGTTAGCGACCGCAGCAGCCGACATCATGCTGGCAGCATAGGAGCCTGCTGCTATTCCAGCTGAGGTGAAACCTATGGCTCCCAGAACAACAGGAGCCCCGACCACACTAACTACTGCACATggacaacacaacacagcagaGGGAACTTTGTTGTTAGTGATAGTGTGCTAATCGGTCAGCTCACTTTAAAATGGATCATGCATGTATAAGTTTAACATGTAAATGGTGTTAAAAATCAGTTTAAAAACGTAAACAAAGGTGGTCCATAAAGTCTGGACGTTACAAAGTCCTACCTGCACCTCCTACAATGGCAGCAGCTGTCCCTGAAACAAAAGATGAAAGCCAAAATCCACCTTTACAGTCCATCTGGCTTAATCAATGACATTTGCTTTGGTTTCTCACATTATAACATGTTTTTTAAGGAAAGCTTATCAGTAAAAGTATCAGTACTTTCAAGAATTTTGTAGGTATCATCTAGGGTGTAATTTCCAATGGGGACAGGGAGGACATGTCCCCCCCCACTTTTCAAACTCCTgtttgtgtccccccccccacacacactttcaaattCGGttgatgttattttatttaaaagtctCTGTGATCTGcccctattttaaacaataaagaaagtaagacatctttttctttcttattttctgGAATAATCTATAATTACGATCAACTTAATTATTTTCCGGATTTTTAATCATCATAGTTGCTAAACTTATgtagaaatgcaggaaataTGATTCAAATAGAAAatggttttttgggggggcagaGGACCCCCAGACCTCCCCTGTTTTGTGTCCCCCCTACTTCTCAAACCAAAGTCACACTCTTGAGTATCATCAAATGACCAGCAATACTCACCAGCAGGGCCCATCTTGTTTATAGGTCTGACGAACTGTTCTGAGAAACCACACTGTTggaatcaaaacaaaaaaggggGTCCCTTGGTGTGTCATCGAAGAACAGGAAGTGAAACTTAAACTGTTCTCTTTAATCATAACAAAAAAGACAGAAGTCTTTAATACGTCAATGATTAACATTTCCGGTGTGACGTGTCAAAATGATTGTTCACAATGCTTTACTGATAGCTCcaaaaccatagatatagaacaaaaTAAACTGTTTTATATCTATGTCTAAAACCGTACCgtgaacacactgtaacaacACGCTAGAAGTgaagaagaaaacaacaaatCTCAATGTTTTACTTGTTGAAACAAAATGACAAACTGATAGCACGCTATAACGTTAATTGATGATAAAGCTTGGCTATATTTATAATTACAATACACATTAAAACAGCGAAATAGAATAAATCTTTAATGTCCACAGACAACATCTCAGACATAATAAGTGGAGCATAAAAAgatgaaatgaaacaaaaaaaaaagaatatcaggataaaaaaaaagaataaatacgcttaaatacattaaaatagcaGCTCAGTTTGATGTTGTCATTTGGTCTGGATGAGGATACTGATGGCATTTGGAATAAAGGATTTTTTAAATACACGTTTTGCCAGAGGCACTCTGAGGCGTCTCCCAGACTGCAGGAGCTCAAAATGGCTGGAAAGAGGGTGGTATATCTGCAGTGATTTTCCTAGCGTTCTTCCTCATTCTGTCAGTGTATATTTGGGTCAGATGTTTTGGGGGGTTTCCCAATATTTTGCTAGCCATTGACACTATTCTGTTAAGCTTGTTCTTGAGTTTGCAGCTCAAATGGTCAAACCAAGCAGAAATTAGCTAGCTAAGACAAACAAAATTCAGCTCCAACCCTAATGTTCCAATGATGATTCGCCGCCCCATATACTACTCCAATACACACTTCATAGTTAGGCATTGCTTCAGACACGTAACAGGAATGCAAACTGTTAACGAAATTATGGAAAATTAACCATAAAGTTAGCACAAACATGCTCACCCAACcaagcaaaactacaaaaaatctttttaatgTCACTTAGGATACGAATTATTGACAAATCGTGTGCCCTTATGCTAATACACATTAGCACAAAAGGTACAAATCCTAAACGCACCTTCTTCTGGAAGACAGCCGAGAAGTTAAAATGCCCCTCAGTCCGCAGACAGCCGCCTCGACCAGGTCCCGAGCATTGACATAAAATGGACCAACGGTCCCGAGTGACACAGCAGCCGTTTTGACGTCTTTCCGGAACTgcaccttcaaaataaaggtaCCAGCCTTGCTAATGTAATTTACGC
>TU278110
ATATCTTTCACAGGTTACACAGATTTATTGCACAAAACATTTCAGTTGTCTGAAATCTGAAGTGCTGTTTAGTAAATTAACTGATGTAATTTGTAATAACCTCCTTAATTTGGTAAACGTAAAGATATCGGAAATGTATCTTGTTCCTTCTTGATTTTCAGCGGATGAAGCTAGTCAGCCATCCCACTGCTGCTCCAGCTCCAACCACAGCTGCAGTGGCAGCTCCTGACAGACCAGCTGCACCTACTGCTGCCTGCAAAACAGCCACTGTACTTCCTGCTGCCACTGCTCCTCCGTTAGCGACTGCAGCAGCCGACATCATGCCGGCAGCATAGGAGCCTGCTGCTATTCCAGCTGAGGTGAAACCTATGGCTCCCAGAACAACAGGAGCCCCGACCACACTAACTACTGCACATggacaacacaacacagcagaGGGAACTTTGTTGTTAGTGATAGTGTGCTAATCGGTCAGCTCACTTTAAAATGGATCATGCATGTATAAGTTTAACATGTAAATGGTGTTAAAAATCAGTTTAAAAACGTAAACAAAGGTGGTCCATAAAGTCTGGACGTTACAAAGTCCTACCTGCACCTCCTACAATGGCAGCAGCTGTCCCTGAAACAAAAGATGAAAGCCAAAATCCACCTTTACAGTCCATCTGGCTTAATCAATGACATTTGCTTTGGTTTCTCACATTATAACATGTTTTTTAAGGAAAGCTTATCAGTAAAAGTATCAGTACTTTCAAGAATTTTGTAGGTATCATCTAGGGTGTAATTTCCAATGGGGACAGGGAGGACATGTCCCCCCCCACTTTTCAAACTCCTgtttgtgtccccccccccacacacactttcaaattCGGttgatgttattttatttaaaagtctCTGTGATCTGcccctattttaaacaataaagaaagtaagacatctttttctttcttattttctgGAATAATCTATAATTACGATCAACTTAATTATTTTCCGGATTTTTAATCATCATAGTTGCTAAACTTATgtagaaatgcaggaaataTGATTCAAATAGAAAatggttttttgggggggcagaGGACCCCCAGACCTCCCCTGTTTTGTGTCCCCCCTACTTCTCAAACCAAAGTCACACTCTTGAGTATCATCAAATGACCAGCAATACTCACCAGCAGGGCCCATCTTGTTTATAGGTCTGACGAACTGTTCTGAGAAACCACACTGTTggaatcaaaacaaaaaaggggGTCCCTTGGTGTGTCATCGAAGAACAGGAAGTGAAACTTAAACTGTTCTCTTTAATCATAACAAAAAAGACAGAAGTCTTTAATACGTCAATGATTAACATTTCCGGTGTGACGTGTCAAAATGATTGTTCACAATGCTTTACTGATAGCTCcaaaaccatagatatagaacaaaaTAAACTGTTTTATATCTATGTCTAAAACCGTACCgtgaacacactgtaacaacACGCTAGAAGTgaagaagaaaacaacaaatCTCAATGTTTTACTTGTTGAAACAAAATGACAAACTGATAGCACGCTATAACGTTAATTGATGATAAAGCTTGGCTATATTTATAATTACAATACACATTAAAACAGCGAAATAGAATAAATCTTTAATGTCCACAGACAACATCTCAGACATAATAAGTGGAGCATAAAAAgatgaaatgaaacaaaaaaaaaagaatatcaggataaaaaaaaagaataaatacgcttaaatacattaaaatagcaGCTCAGTTTGATGTTGTCATTTGGTCTGGATGAGGATACTGATGGCATTTGGAATAAAGGATTTTTTAAATACACGTTTTGCCAGAGGCACTCTGAGGCGTCTCCCAGACTGCAGGAGCTCAAAATGGCTGGAAAGAGGGTGGTATATCTGCAGTGATTTTCCTAGCGTTCTTCCTCATTCTGTCAGTGTATATTTGGGTCAGATGTTTTGGGGGGTTTCCCAATATTTTGCTAGCCATTGACACTATTCTGTTAAGCTTGTTCTTGAGTTTGCAGCTCAAATGGTCAAACCAAGCAGAAATTAGCTAGCTAAGACAAACAAAATTCAGCTCCAACCCTAATGTTCCAATGATGATTCGCCGCCCCATATACTACTCCAATACACACTTCATAGTTAGGCATTGCTTCAGACACGTAACAGGAATGCAAACTGTTAACGAAATTATGGAAAATTAACCATAAAGTTAGCACAAACATGCTCACCCAACcaagcaaaactacaaaaaatctttttaatgTCACTTAGGATACGAATTATTGACAAATCGTGTGCCCTTATGCTAATACACATTAGCACAAAAGGTACAAATCCTAAACGCACCTTCTTCTGGAAGACAGCCGAGAAGTTAAAATGCCCCTCAGTCCGCAGACAGCCGCCTCGACCAGGTCCCGAGCATTGACATAAAATGGACCAACGGTCCCGAGTGACACAGCAGCCGTTTTGACGTCTTTCCGGAACTgcaccttcaaaataaaggtaCCAGCCTTGCTAATGTAATTTACGC
>TU278111
TATCTTTCACAGGTTTATTGCACAAAGCATTTCAATTGTCTAAGACGACAAAAGTGCTGGTTATTAAGTGAACTGATGTAATTTGCATTACCCACAattcaaaaagtaaaaacattagAAGTGCATCTGGTTCCttcttgatattttttttattgctgacTTAGATATTCAGccgctgctgcagctgctGCTCCTGACAGACCAGCTGCACCTACAGCAAGATACACAGGCTTTATATCAGGGTATAGAGCTACAGAGAAACTGAGAGAATATTGTTCTGAAGCTTTAAAGACTAAATGTAACAATAGCATTTTATAGGCATACATACTTTTTAATCATGTAATGGCATTTACCTGCTGCCTGCAAAACAGCCACTGTACTTCCTGCCACGGTGGCAACTGTCCCTGAAAAGAAGAAAGACGAAATCAACATTCACAGTCCGTATGAGACATTTGCCTTGGTTactatcattattttttttaaatgagaaaagCTTATATTAATTAAAGAATAAGTACTTTTGAAAGAAACGTATCAAAGGAACAGTACTTACAAGGGTCCATGTCGTTCTCTGTTTTGACGAGTCACGAACTGGGCTGAGTTTTATAAACAGCTGGGTTAGctttcatttcttcaaaaaTGAAACTTAAGCATGCATGACCTGCAGTTATTTGAGGCAAAAAAGTCTTTACCATTCATTTTCATAAAGTTTATTGCAATAAAAAGGGAGCAtttatctaaataaataaatataaatacaaatacataattatTTAAGTCCCCATCCTctcaattaaaataaatgacaaacaaaAACGTAGCCGTAATACTAAACTCTTGTCAGTGGAGGGCGGTATTTCCCTGCTATTTGAAAGCTATCAGCGGCAGCAAAGTTTCGAGGAGAATCACGCTGCAGCCCGCGGGAAGGCGGGGCTTGACAtcagtaactacatgaaaacgtCACTATTGTTGcgtgaaatgtcgtttgtgttgtAGGCCTCTGCCAGAAATGTAAATGAGCCTGTGATGGTTATGGGTTCACCTGAGATGGATTTTGGTACAGGGATTATAATTGAGTTTTAAAAGCACTGTGGCT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU278109 True 2816 lncRNA 0.39 3 22930930 22947866
TU278110 False 2542 lncRNA 0.40 2 22944936 22947866
TU278111 False 1096 lncRNA 0.37 2 22934732 22935857

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120549680 NA coding upstream 11665 22913711 ~ 22919265 (+)
LOC120548707 LOC103357057,LOC101482474,LOC102308648,LOC106519654 coding upstream 25637 22889991 ~ 22905293 (+)
LOC120549820 mycl,LOC103357056 coding upstream 54216 22873591 ~ 22876714 (+)
si:dkey-157l19.2 NA coding upstream 87802 22799017 ~ 22843128 (+)
LOC120548821 rbbp4,LOC103390756,LOC100711479,LOC105015627 coding upstream 136342 22788635 ~ 22794588 (+)
LOC120549681 LOC103375071,LOC100696357,LOC104924638,LOC102794258 coding downstream 3325 22951191 ~ 22955699 (+)
LOC120549876 NA coding downstream 569986 23517852 ~ 23528486 (+)
LOC120548746 NA coding downstream 605770 23553636 ~ 23569842 (+)
tfb1m tfb1m coding downstream 803390 23751256 ~ 23775958 (+)
mocs3 mocs3,LOC103136035 coding downstream 1018395 23966261 ~ 23973551 (+)
G205345 NA non-coding upstream 2225 22925253 ~ 22928705 (+)
G205349 NA non-coding upstream 8291 22922315 ~ 22922639 (+)
G205293 NA non-coding upstream 86544 22832052 ~ 22844386 (+)
LOC120548825 NA non-coding upstream 99340 22830232 ~ 22831590 (+)
G205284 NA non-coding upstream 150655 22777821 ~ 22780275 (+)
G205359 NA non-coding downstream 31220 22979086 ~ 23003616 (+)
G205461 cln8,LOC102794823 non-coding downstream 392713 23340579 ~ 23341739 (+)
G205463 NA non-coding downstream 396414 23344280 ~ 23344666 (+)
G205464 NA non-coding downstream 396861 23344727 ~ 23346941 (+)
G205477 NA non-coding downstream 545117 23492983 ~ 23493222 (+)
G205294 NA other upstream 84522 22833987 ~ 22846408 (+)
srp14 srp14 other upstream 402181 22525155 ~ 22528749 (+)
gchfr gchfr other upstream 565030 22363664 ~ 22365900 (+)
LOC120549475 gpatch2l other upstream 1770644 21137212 ~ 21160286 (+)
acyp1 acyp1 other upstream 1934987 20994307 ~ 20995943 (+)
si:ch211-195o20.7 LOC102076813 other downstream 583042 23530908 ~ 23552582 (+)
ralgapa2 ralgapa2 other downstream 1381247 24329113 ~ 24447362 (+)
mgst3b LOC106536548,LOC108237254,LOC107096417,LOC100690646 other downstream 1806351 24754217 ~ 24759498 (+)
LOC120549173 LOC103365836,LOC101483368 other downstream 2149300 25097166 ~ 25149128 (+)
LOC120549233 LOC103365834,LOC101066181,LOC100705758,LOC102786033,LOC101484046 other downstream 2201585 25149451 ~ 25180207 (+)

Expression


Co-expression Network