G156430


Basic Information

Item Value
gene id G156430
gene name NA
gene type non-coding
species bowfin (Amia calva)
category of species ecological fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030142.1
NCBI id CM030142.1
chromosome length 21087710
location 17159577 ~ 17171780 (+)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome

Sequence

>TU197030
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU197030 True 12136 lncRNA 0.36 3 17159577 17171780

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
AMCG00006150 NA coding upstream 38072 17104337 ~ 17121505 (+)
AMCG00006151 NA coding upstream 57716 17095682 ~ 17101861 (+)
AMCG00006130 NA coding upstream 83313 17070040 ~ 17076264 (+)
AMCG00006125 dapk3 coding upstream 241597 16908516 ~ 16917980 (+)
AMCG00006143 NA coding upstream 428346 16723292 ~ 16731231 (+)
AMCG00006136 NA coding downstream 340122 17511902 ~ 17518833 (+)
AMCG00006191 NA coding downstream 617203 17788983 ~ 17811459 (+)
AMCG00006189 thop1,mepd coding downstream 680259 17852039 ~ 17877059 (+)
AMCG00006187 NA coding downstream 708203 17879983 ~ 17905624 (+)
AMCG00006162 LOC106613602 coding downstream 776743 17948523 ~ 17960210 (+)
G156329 NA non-coding upstream 514728 16644447 ~ 16644849 (+)
G156326 NA non-coding upstream 531864 16625558 ~ 16627713 (+)
G156321 NA non-coding upstream 559719 16599532 ~ 16599858 (+)
G156302 NA non-coding upstream 654371 16504770 ~ 16505206 (+)
G156279 NA non-coding upstream 691901 16464008 ~ 16467676 (+)
G156440 NA non-coding downstream 160756 17332536 ~ 17342156 (+)
G156506 NA non-coding downstream 351454 17523234 ~ 17524750 (+)
G156509 NA non-coding downstream 363851 17535631 ~ 17547361 (+)
G156521 NA non-coding downstream 395779 17567559 ~ 17571532 (+)
G156564 LOC100846954,LOC107575789 non-coding downstream 535890 17707670 ~ 17708721 (+)
AMCG00006149 NA other upstream 31944 17123205 ~ 17127633 (+)
G156327 NA other upstream 530395 16627793 ~ 16629182 (+)
AMCG00006089 NA other upstream 1014339 16123128 ~ 16145238 (+)
AMCG00006113 slc35e1,LOC106573890 other upstream 1092679 16054035 ~ 16066898 (+)
AMCG00006111 smim7,LOC106573893 other upstream 1123608 16032892 ~ 16035969 (+)
AMCG00006188 adamts10,LOC106584371,LOC108439663 other downstream 490410 17662190 ~ 17735084 (+)
AMCG00006190 LOC107695212,LOC107676806 other downstream 574353 17746133 ~ 17764228 (+)
G156640 NA other downstream 801961 17973741 ~ 17980637 (+)
AMCG00006138 NA other downstream 1018444 18190224 ~ 18356589 (+)
AMCG00006174 NA other downstream 1306348 18478128 ~ 18480087 (+)

Expression


Co-expression Network