XLOC_006005


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_006005
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007124.7
NCBI id CM002897.2
chromosome length 52186027
location 25769999 ~ 25782811 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00013601
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Function

GO:

id name namespace
GO:0005730 nucleolus cellular_component
GO:0003723 RNA binding molecular_function

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00013601 True 12813 lncRNA 0.38 1 25769999 25782811

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_006004 neurog3 coding upstream 7608 25761279 ~ 25762391 (+)
XLOC_006003 pcbd1 coding upstream 43465 25720969 ~ 25726534 (+)
XLOC_006002 sec23ip coding upstream 203691 25549425 ~ 25566308 (+)
XLOC_006001 inpp5f coding upstream 237512 25505580 ~ 25532487 (+)
XLOC_006000 bag3 coding upstream 271338 25486608 ~ 25498661 (+)
XLOC_006006 bcl11aa coding downstream 63717 25846528 ~ 25925224 (+)
XLOC_006007 NA coding downstream 161468 25944279 ~ 25961369 (+)
XLOC_006008 NA coding downstream 182916 25965727 ~ 25983365 (+)
XLOC_006009 NA coding downstream 273646 26056457 ~ 26065264 (+)
XLOC_006010 fancl coding downstream 921086 26703897 ~ 26780797 (+)
XLOC_005997 BX530079.1 non-coding upstream 325476 25443984 ~ 25444523 (+)
XLOC_005984 AL929005.1 non-coding upstream 941130 24828753 ~ 24828869 (+)
XLOC_005978 NA non-coding upstream 1120060 24597665 ~ 24649939 (+)
XLOC_005975 NA non-coding upstream 1197071 24570620 ~ 24572928 (+)
XLOC_005962 CR352246.1 non-coding upstream 1948699 23821186 ~ 23821300 (+)
XLOC_006011 NA non-coding downstream 1019683 26802494 ~ 26809319 (+)
XLOC_006014 BX323884.1 non-coding downstream 1433830 27216641 ~ 27232573 (+)

Expression


Co-expression Network