XLOC_006473 (camkmt)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_006473
gene name camkmt
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007124.7
NCBI id CM002897.2
chromosome length 52186027
location 10360444 ~ 10620794 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00012553
AAAATATGACATATAATTCAGGAAAGACTAATCGAGTCTAGAATCGTAAACGATAGCCATAATACGACAGTGTTCGATGACTTCGGTGGTTGATTCGATTTCCTTTTTGCCAGCACAAGTGGAGGTGGTGTACGGAAGTAGCATGGGATTTTATTACTAAGCAACAGAGAACCGGCGAATTGGTAAAACACGATTAAATTACGCCATGGACTTTAACCGCATCCGTAGAACAAATGCCAAATAAGCCTTCGATTAGACTCTGCATTCCGCAGCTGTTCTAGTGATACAGTGAGAAGTAATTTTCTGCATGAGTTCCAGCAGGTTGCTTTGGGATGAATAACGTTACATTTAAAGACGCCCCTTTGGCTGCGACAGAAATGCATGCGAATGATCACCAAAATCACGACTCTCACTGTGGAACCGATGTGGCCCGTGCACGATGGGCTCTTCTGCGACAGGTGCTGAAACAGAAGCAGCTCGACAGTCAAGATGTTCAGCAGGTGTCAGTGCGGAGATTCTCCTCCTTTAACCTGTTCTCCAGGAGCAGAGGGACTCCCCCAGAAACGGAGGACCCTTCTGACGGCCAGTGGGTGGAGTACAGAAGTGCAATCTTTCCCCAGTACAGTGCCTTACTCAGAGACAATCTTGGCCCCATTAGAGTGGATGAGGTTCTCAGCAGCTTTGACAACACGGGAAATGTCTGTGTCTGGCCTTCAGAAGAGGTGATGGCCTACTACTGCCTGAAGAAACGCCACATGTTTACGGGTTCCTCGGTCTGTGAGCTGGGTGGAGGAATGACATGTCTCGCCGGCCTCATGATTGCGGTTTGTGCTGATGTGAAGGAAGTGCTGCTATCTGATGGAAACGAGAAGGCAATTCAGAATGTGCGCAGCGTAATTGAGAGAAACAGACGAGAAGGGCTCTTCCTGTCTACCAACGTGTCAAGCAGggTGGTGAGATGGGACAATGAGGCTGATGTGTCTTCTTTGGAAAGTCGCTTTGACGTGGTGATGTGCGCTGACTGTCTGTTTCTTGACCAGTACAGAGGCAGTCTGGTTGATGCACTAAGAAGATTACTGCGACCTGATGGCACGGCTCTAGTATTTGCCCCTACCAGAGGAGACACACTGGCAGAATTCAGCCGACTGGCAGAGAGCGTAGGCCTGAGAGTGTGCCGCTACGATAACTACGATTCACACTTGTGGGACCTTCATCTAAAGATGCAGCAAGAGGGAAAGGAGGTGTACGATGAGAACATCCACTATCCTCTTCTACTGACTCTTACTCATGGGTCCAGTCCAGCCCTGATCTGACCTGATCACCACTGGGCAAAGCCATCTCATGCCAGGCTGCCTTCCTGTACCGCCCACCCCGCCTGTGCCACTGTGTGTgtggttgtatgtgtgtgtgtgtgcgtatgtctgtgtgtatgtgtgagcaccAGGGCTAAGCGGCCACTTATCACACTCCTCAACTTTTTTTAACtaccgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgctttgaAAAACAAACTATGTATGTAGGTgagtcactgtgtgtgtttgacctGTTTACTGTGCAACACCAGTGTGAAATGTGTTCAATGGGAAGGGAGAACACATCCCTCCCTCTCATAATAACAAAAGAAGCTGTGGATGTGATGCTCAGATATGAACTCATTCAATGCCTGTGAGGATGCGTGATATCAGAGATGATGATGATTCAGGGCAGAACCTTATGATTTTATGAGTTTGACTCTGGAGGCTGATACAGCTAATCAGGTTGGCCTCGTAAATGAGGCCGTCTTGGTCATGAGATCTAGTTATTGTAATGATACCAGCTCTCAGTTCACCGTTAGACACTGATTCTGTATTTACACTCAGAGGTTGACTCTGACACCAAAGGTTAGGGTGGTTGAGATGGATTCTGCTGCTGCGCTGAATGTTATTTGCTTCACTGTGAATTTCTCTCACATCGAAAACTGAAAAGATATGACAGATCAGGCCAGAATTGCTGAACTGATGTCTTGACTGTGTCACTACACACTGCTTTACTGGTAAGACCCGCAGCACTGTTCTTCTTTAAAGATATATTTCACCACAGATATGATAAATATGGTGTCTTTTACTCATTGCCTGTTTAGGTCAGCAATTAAGAATGcattcaaacaaacaataaaaggtaacactttacaataaggttatattaattaattttagttttacgaacactgaaaaataaatttattactgtatttgttAAAGGCACCTATGATTAAAATCATCTTTTGAAAGATGTTTGGACAATTGTGTATAGGTATGATGCGTCCACAGTCATACTGCGGTGATTTAAAGACATTACATCTGGGGTCTCGATAGAGCCCCACTATCTCTTTTAAATgaatttgcttttctttttatcTTAGTAAAATGAATGTGCTGTTTTCCATGCAATTAAAGTAGATAGAGACTGTATGCAGGATTGTTAAGAGCAGTGATGCCCAAACTTTTTGTTATTAGGGGCCAAATACCAATCTTGATTGAGAGTTGTGGGCCGAAGGTATTTCAAGCTGTATAACAAAATTACCATTGATAATATCCATTAATAGAAAACATGATCAGATTAAGCaatgcttatatttatttatttatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatacactttataaTGATATTAGTTTCATTTATAGCACAATTGAGTTTAACGCCAAAAACACTAGTCAAGCTGCATCTGTCTTTGCCTTGGTTTGCTCACTGAGGATTTCTGAGTTGTGGTGTTGAGCAACTGGATGTTCATTAAAAGAAtcctaataataatttacaatatataattgaaatatttaatcaaagttagttttttgtagcttaaattaaaacaaacaaaggttatgttaaattagaaatgaccaTGTGTGTAAGGTATTAACCCAAATTCTCCCCAAAATTCTCCCTCAGGTTGTTCTCACTAGTTTGGGTATCTCTGATTTTGGATATAATGGcttaaattttgtattttctgCACACAAATGCTTTAAATTGTGtcaaataatttaatgttttggtatttttttagaaACCTGACACTGATCACCATCTACTTTTACTGCATGGGAAAAGAGCAGCTTGAACGCTCGCTAGAAATGTTTCAtggaagaaagagagaaaaaagtttttaaaaaaatttacaatatatgacttaattttcatttttaggtataCTGGACCTTGTTCACACTTGCTATTTTCTTCTCTTGGTTTGTTTGGTCTGGTACAAAAGTGGAAATGATACATTTAGTCCTGGTTCACTTAATGTTCGCACTATAcgttttattatttacaatagaATGCCTTTCATGACATAATTCTTGACTTAAGAACTTACAAAAGATCCTAAACAATGTTTTGTGCTTTTGTTAGgccttttaaaatgtgtaaaagagTCAAACAGCACTAGAAATTCCTCCGCCTCATACATAATATAGAATCTGCTGCAAGAGGTGTTTCTGATGCCTGTATTGAGCAACACCAGGGTTTTTACATACAAACAGCCTTTTAATAGCCACATTTTATAACATCATATTctgttttggtttgtttaaatgtgtttggTCTGTATTGCAGCCATATTCCAGTCAAACCACTCAATAGACTGAGCCTTAAACATTTTGTGGTTTCAGTCTGTTTGTTTGGTTCAAATTCTATTTAATCAAACTAAACCTGACAAGTGCGAACACCAAAAGTGTGAACTGAATTAACAGGaaacaatgttgttgttttttctgatGTGTGGCATTTCTGTTGTATTCAGAAGAGTATTATTTTGCTCAAATATTAAACTCTATATCTATTTTATGGATTCTGTCGGTTAAATCTGTTGATTTTGTTTGTTATTCTGACACAGGGCTTTCTCACAGTAACCTTTTCTCCACTGTTGTTTTGTGCTGGTGGTGAGCTGGTGACACCTCATTCAGAGCTCTTTGGGTGGTTGTGAATTGTTCAGGGCTGTGCGCTTCAGCACTGTGATTACATTTGTACAAAACACGGATGAGTCCAAAGTGATTGTTTCTCACTGACACTGCAGGTGCTTGTAACGACTGTGattaaatcattgttttcaaTCCTCCTGTGTCCCAGTCATTTTTGTGTGGCACATAATGTGTAATTGATGT
>TCONS_00012554
TTCAGGTGTCTGGCCTTCAGAAGAGGTGATGGCCTACTACTGCCTGAAGAAACGCCACATGTTTACGGGTTCCTCGGTCTGTGAGCTGGGTGGAGGAATGACATGTCTCGCCGGCCTCATGATTGCGGTTTGTGCTGATGTGAAGGAAGTGCTGCTATCTGATGGAAACGAGAAGGCAATTCAGAATGTGCGCAGCGTAATTGAGAGAAACAGACGAGAAGGGCTCTTCCTGTCTACCAACGTGTCAAGCAGggTGGTGAGATGGGACAATGAGGCTGATGTGTCTTCTTTGGAAAGTCGCTTTGACGTGGTGATGTGCGCTGACTGTCTGTTTCTTGACCAGTACAGAGGCAGTCTGGTTGATGCACTAAGAAGATTACTGCGACCTGATGGCACGGCTCTAGTATTTGCCCCTACCAGAGGAGACACACTGGCAGAATTCAGCCGACTGGCAGAGAGCGTAGGCCTGAGAGTGTGCCGCTACGATAACTACGATTCACACTTGTGGGACCTTCATCTAAAGATGCAGCAAGAGGGAAAGGAGGTGTACGATGAGAACATCCACTATCCTCTTCTACTGACTCTTACTCATGGGTCCAGTCCAGCCCTGATCTGACCTGATCACCACTGGGCAAAGCCATCTCATGCCAGGCTGCCTTCCTGTACCGCCCACCCCGCCTGTGCCACTGTGTGTgtggttgtatgtgtgtgtgtgtgcgtatgtctgtgtgtatgtgtgagcaccAGGGCTAAGCGGCCACTTATCACACTCCTCAACTTTTTTTAACtaccgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgctttgaAAAACAAACTATGTATGTAGGTgagtcactgtgtgtgtttgacctGTTTACTGTGCAACACCAGTGTGAAATGTGTTCAATGGGAAGGGAGAACACATCCCTCCCTCTCATAATAACAAAAGAAGCTGTGGATGTGATGCTCAGATATGAACTCATTCAATGCCTGTGAGGATGCGTGATATCAGAGATGATGATGATTCAGGGCAGAACCTTATGATTTTATGAGTTTGACTCTGGAGGCTGATACAGCTAATCAGGTTGGCCTCGTAAATGAGGCCGTCTTGGTCATGAGATCTAGTTATTGTAATGATACCAGCTCTCAGTTCACCGTTAGACACTGATTCTGTATTTACACTCAGAGGTTGACTCTGACACCAAAGGTTAGGGTGGTTGAGATGGATTCTGCTGCTGCGCTGAATGTTATTTGCTTCACTGTGAATTTCTCTCACATCGAAAACTGAAAAGATATGACAGATCAGGCCAGAATTGCTGAACTGATGTCTTGACTGTGTCACTACACACTGCTTTACTGGTAAGACCCGCAGCACTGTTCTTCTTTAAAGATATATTTCACCACAGATATGATAAATATGGTGTCTTTTACTCATTGCCTGTTTAGGTCAGCAATTAAGAATGcattcaaacaaacaataaaaggtaacactttacaataaggttatattaattaattttagttttacgaacactgaaaaataaatttattactgtatttgttAAAGGCACCTATGATTAAAATCATCTTTTGAAAGATGTTTGGACAATTGTGTATAGGTATGATGCGTCCACAGTCATACTGCGGTGATTTAAAGACATTACATCTGGGGTCTCGATAGAGCCCCACTATCTCTTTTAAATgaatttgcttttctttttatcTTAGTAAAATGAATGTGCTGTTTTCCATGCAATTAAAGTAGATAGAGACTGTATGCAGGATTGTTAAGAGCAGTGATGCCCAAACTTTTTGTTATTAGGGGCCAAATACCAATCTTGATTGAGAGTTGTGGGCCGAAGGTATTTCAAGCTGTATAACAAAATTACCATTGATAATATCCATTAATAGAAAACATGATCAGATTAAGCaatgcttatatttatttatttatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatacactttataaTGATATTAGTTTCATTTATAGCACAATTGAGTTTAACGCCAAAAACACTAGTCAAGCTGCATCTGTCTTTGCCTTGGTTTGCTCACTGAGGATTTCTGAGTTGTGGTGTTGAGCAACTGGATGTTCATTAAAAGAAtcctaataataatttacaatatataattgaaatatttaatcaaagttagttttttgtagcttaaattaaaacaaacaaaggttatgttaaattagaaatgaccaTGTGTGTAAGGTATTAACCCAAATTCTCCCCAAAATTCTCCCTCAGGTTGTTCTCACTAGTTTGGGTATCTCTGATTTTGGATATAATGGcttaaattttgtattttctgCACACAAATGCTTTAAATTGTGtcaaataatttaatgttttggtatttttttagaaACCTGACACTGATCACCATCTACTTTTACTGCATGGGAAAAGAGCAGCTTGAACGCTCGCTAGAAATGTTTCAtggaagaaagagagaaaaaagtttttaaaaaaatttacaatatatgacttaattttcatttttaggtataCTGGACCTTGTTCACACTTGCTATTTTCTTCTCTTGGTTTGTTTGGTCTGGTACAAAAGTGGAAATGATACATTTAGTCCTGGTTCACTTAATGTTCGCACTATAcgttttattatttacaatagaATGCCTTTCATGACATAATTCTTGACTTAAGAACTTACAAAAGATCCTAAACAATGTTTTGTGCTTTTGTTAGgccttttaaaatgtgtaaaagagTCAAACAGCACTAGAAATTCCTCCGCCTCATACATAATATAGAATCTGCTGCAAGAGGTGTTTCTGATGCCTGTATTGAGCAACACCAGGGTTTTTACATACAAACAGCCTTTTAATAGCCACATTTTATAACATCATATTctgttttggtttgtttaaatgtgtttggTCTGTATTGCAGCCATATTCCAGTCAAACCACTCAATAGACTGAGCCTTAAACATTTTGTGGTTTCAGTCTGTTTGTTTGGTTCAAATTCTATTTAATCAAACTAAACCTGACAAGTGCGAACACCAAAAGTGTGAACTGAATTAACAGGaaacaatgttgttgttttttctgatGTGTGGCATTTCTGTTGTATTCAGAAGAGTATTATTTTGCTCAAATATTAAACTCTATATCTATTTTATGGATTCTGTCGGTTAAATCTGTTGATTTTGTTTGTTATTCTGACACAGGGCTTTCTCACAGTAACCTTTTCTCCACTGTTGTTTTGTGCTGGTGGTGAGCTGGTGACACCTCATTCAGAGCTCTTTGGGTGGTTGTGAATTGTTCAGGGCTGTGCGCTTCAGCACTGTGATTACATTTGTACAAAACACGGATGAGTCCAAAGTGATTGTTTCTCACTGACACTGCAGGTGCTTGTAACGACTGTGattaaatcattgttttcaaTCC
>TCONS_00012555
ATGGGATTTTATTACTAAGCAACAGAGAACCGGCGAATTGGTAAAACACGATTAAATTACGCCATGGACTTTAACCGCATCCGTAGAACAAATGCCAAATAAGCCTTCGATTAGACTCTGCATTCCGCAGCTGTTCTAGTGATACAGTGAGAAGTAATTTTCTGCATGAGTTCCAGCAGGTTGCTTTGGGATGAATAACGTTACATTTAAAGACGCCCCTTTGGCTGCGACAGAAATGCATGCGAATGATCACCAAAATCACGACTCTCACTGTGGAACCGATGTGGCCCGTGCACGATGGGCTCTTCTGCGACAGGTGCTGAAACAGAAGCAGCTCGACAGTCAAGATGTTCAGCAGGTGTCAGTGCGGAGATTCTCCTCCTTTAACCTGTTCTCCAGGAGCAGAGGGACTCCCCCAGAAACGGAGGACCCTTCTGACGGCCAGTGGGTGGAGTACAGAAGTGCAATCTTTCCCCAGTACAGTGCCTTACTCAGAGACAATCTTGGCCCCATTAGAGTGGATGAGGTTCTCAGCAGCTTTGACAACACGGGAAATGTCTGTGACCAGATATTGATTAACAGTCATTcaactttaccgaagcctctctgcATGATGATTGGTCTCGCATGACTGCCATGTTTaaagtttgtttacactttttatccgagtttgtagttctaatcaaattcacatCCAACATTTAATGTATTGTTGACAATATCAGTGGTTAGAGTGTGAACGCTTCTACACTTCAAATATTTAACTGAAATAGTAAACTATCCaagcatactcttttcaacatactac

Function

symbol description
camkmt Predicted to enable calmodulin-lysine N-methyltransferase activity. Predicted to act upstream of or within methylation. Predicted to be located in cytoplasm and nucleus.

GO: NA

KEGG:

id description
ko00310 Lysine degradation

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-090313-164 Predicted to enable calmodulin-lysine N-methyltransferase activity.

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000091900 ENSDARG00000095224

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00012553 False 4242 mRNA 0.40 11 10360444 10620794
TCONS_00012554 False 3497 mRNA 0.38 8 10360492 10431476
TCONS_00012555 True 808 mRNA 0.44 4 10494920 10620652

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_006472 NA coding downstream 13554 10275286 ~ 10346890 (-)
XLOC_006470 six3a coding downstream 99061 10258007 ~ 10261383 (-)
XLOC_006469 NA coding downstream 107410 10250174 ~ 10253034 (-)
XLOC_006468 NA coding downstream 128366 10150919 ~ 10232078 (-)
XLOC_006467 NA coding downstream 241509 10077215 ~ 10118935 (-)
XLOC_006474 slc3a1 coding upstream 28275 10649069 ~ 10672538 (-)
XLOC_006475 ppm1ba coding upstream 61633 10682427 ~ 10731325 (-)
XLOC_006476 AL928999.1 coding upstream 291692 10912486 ~ 10912602 (-)
XLOC_006477 abcg8 coding upstream 305734 10926528 ~ 10945394 (-)
XLOC_006478 cep170aa coding upstream 359961 10980755 ~ 11072964 (-)
XLOC_006471 BX537274.2 misc downstream 95539 10264741 ~ 10264905 (-)
XLOC_006338 rn7sk misc downstream 9534219 825904 ~ 826225 (-)
XLOC_006458 NA non-coding downstream 802019 9501767 ~ 9558425 (-)
XLOC_006480 NA non-coding upstream 822044 11442838 ~ 11445780 (-)
XLOC_006482 CR556710.1 non-coding upstream 944942 11565736 ~ 11565863 (-)
XLOC_006492 CR792443.2 non-coding upstream 1353658 11974452 ~ 11974568 (-)
XLOC_006496 CR792443.1 non-coding upstream 1484984 12105778 ~ 12105894 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01180000_09521269_09522469 NA coding CI01180000 null 9521269 ~ 9522683 (+)