G107055 (nova2,LOC107669728,LOC107589717,LOC103039352,LOC107685091,LOC107548550)


Basic Information

Item Value
gene id G107055
gene name nova2,LOC107669728,LOC107589717,LOC103039352,LOC107685091,LOC107548550
gene type non-coding
species tiger barb (Puntius tetrazona)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_056713.1
NCBI id CM032082.1
chromosome length 23709629
location 15532081 ~ 15652810 (-)
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Sequence

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>TU158134
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>TU158136
gtatatatatatatatatatatatatatatatatatattaatgtcatgacattcatacatttcaaatgtccaaatactttttagGGCCACTGTAACTAATCTGATTAAATAGGAATGACAGGTAGCGTTCAGCAAATGCACATACAGTATTGAAAGTAAATGCAAAGACTGTTCATCTTAATGAAAACAGCTGAGAGTGGCCGACGCGATCTCAGGACAGAGTACTGCGTGTTCTCCCTTGAAAAGTGCTGGACTAAGGACTGGAGATCTTTGCACATGTTCCACAGGTCTGCTTTCCAACTCTAGGGATTTATGAGGGCTGAGAGCATATTCTTGTCTGCTTCTTTGCTCTCTCCTTTTTACGCCCCCTCCGAGGAGAGGAGGGGGGGCGAAACAGTTAGGCTTGCTTTCTGGAACAGCTGGGCTGAAACGAGGAAAAGCCTGTTGGGTTTGAGGTGAGGGGAAGGAACCGAGCTGGAGCAAAGGGGAAAATCAATCATGGCCCAAGGCTGGTAAAGGTGCACAATTAGCGAGATTggatacatttgaaatgatgGAGCTTCGGCTACACCAGCTCACCATTCCCagtggagacagagagagggagtgatGATTCCACTTGAAAGACCTAATTATTCATCACGACAGTTTCCATGTTTAAAAAGGAGCTCGCAGTTTTGGCCCGAGTTATGGATGCAGATAAGGATATCTCAGAATCGTGGCTAGATTAAAATCACTACTTATGCATGATGGGGATATACCTACATATGATTTTTACCAGAGCGAATCAGTATATCCATCCGGGACTTCTAGaagctgtttcttttttaatcccTCATCGCACTGAGTTATTACTGCACAGGATCCTATTAGAATTGAACGCTGCGTTTAAAAGAGCATCACTAAAAAATATCCATTTTGTCTGAACACTGGAGATACTTCTTTAGTGTATGGTTGGTTTTAAATCATGCGGTGAATGTTAATTTCCCTGGGGTCTCCACCACAGATCAATGTGCTGGAAGCCAACATGAAGACCGGTCAACCTCTCTGACCGATGGCTATATCGGGATTTTCCACGGTGCTTTTAGCTGGTGTTGGCTTTGGAGAAATGTTGGGAAGGTGAAAGTGGTTTTTGCAGGTTGGATGAATTAGTGCACAGAAAAAGTGGGATGGCAATGACCAAGAGACTTTATCATGTTTTTGAACTCATCTTGAATTGACTTCATCCCGAAACCACATGCATTAAGAGCAAAAACGACCAAGCATGTGATGGCAAATTACATTGTGTTACATCACACACGCTGCATTTGCATATCAGTCACACTCAAGACAACCATACaagtatgatttttttcaggCTTATTTCACTGATGCACTATTTCAGATGTTTTCTTActagctttatttaaatatttaaactctaACATGTTCCATGTGATggatttcattttcatatattaaataaagtaggtcaaatttgtaatataaaagcaTAATTGATACTTCCCCCCCCTCAATGTAACTTACCTCGTGAGCTTTACAGTCGGTGTTGTAAGTGGCCCTTCAAACTCTACCCACGTGTCCCTGATACTTCCAGTACATCCTTTATTTTCACTGTCACCATatacaaatatgaacaaattcTATACAGTAACGCAAtcacatgaatttttttttcttttcggaCCGCAGTCCGGTACCTTTCTCCAAGATATGTGAGATGAACACTGACATCAATGTAGTTTATTATTAGCAACTAAACGTAGCTCTAACTTTACACTGTACCAGCcattctgacatttaaaaaaatgtaagtcaTTGCAAAAAAGAGGAACATGCAATGTTTCCAAAATGCCTCAGTTAACACATAACTCCATGTCACATagaaattatcatttaaaatgaagtcaCTTCGTAATGACGTAATTATTAAAGAATTGTCTTTGAACTCCTACACATTCTTTCAACAGCGTTGGTCTCGTTAAATTGTAAACATTACAGCATTTTGCTTGCTCCTTTAATTGGGTGCATATCATTCagttgttgttgtctttttttttttcttgaagaaGACTTGATTAGCGATCGTACATGGTAAATTGTCTTTGGGCTCCTTAAAAAGCTTGAGGGAGAGCTGGGTTGCGGTTCTGTGAGTTCACAGAGTAAGGTAGATTACGTAAACACCCTGAGAGTcacttgtctgttttttttttttttcgttttttttttcttttttaacttttttttttttttaaattagcaattatttaataatttgaaccTGGCCCTGGCAGCCGGTATAAGGGATGGTGGCGGATCATGAGCGGAGGGCGAGTTGACTGGCAACCGCCTCCTCTGCAGGCATGAGAACAGAGTTAATGTGGGTCTGGTCGAGTAGTATGTTATCGATGGAGAACATCACATGGCGTGGGAGGTGCGTGGCGAGGGAATGGCTCGTAAGGGGGGAGGGTAAAGGTAGTGGTGGAAAGTGGTTGGCAAACGGAGGAGGGGGAGTTATGGACGATCAAAATCAACTAGGCTTACATGATGGGATTGAGCTATAACATCAGCAGGTTCCATTGGTAAATGGAAACCAAACAGATTTTAGCTTTAGGTGGACAGAAGACATAACACCCACCCGGCCAAGCCTCTCACAAGCAGTCGcattcgttcgttcgttcgcTCGCATCACTCACGCAGCATGGCCCCTCCCCCAAGACCGAGCACATGGTTTCAGGCACGAACTTGCAATGTGTTATTTGATGAAACTGAGTGTAGTGGGAGGTGAAGAATAAGACAACAGAAGACAGGTGATggtaaaatgaacatttataatGACTGCTGTTGCTGTCGGAAAATAATAAcccttaaataaaaaaagaaaaagagaaaaagaaaaggaacgACTTAATAGATATTAGCACTAAATTGCTGACTTCACTGGTAATCCACAAGTCAAGAAACACAACTCactatttttttgtacaaacaCAATGCTAcagttacattaaatatttaatacttttttaagtCAGTTAATGGATGATGTTAAAAGAAAccactaaaatactaaaaacaaaaacagtaattcATCTTTCCAGTCATTCCCTTTTGTCTAGTTTCTTGATGCCATTTATTAATAGTGTATAGtagtttgaaaataaataagctcATGAAGGGttatcagaaaacaaagctggcAGCATAGAAACATTAGATGTGGAGCTCAAGCATGGTTGAGACGCATGAAAATGATCGTTCGGCATCACAGAGAAACAATTTTGTCTCGTGAACAGATGCTGCAATGATCAGGACACCTAATCGACACGTATCACAATTTACACTCGACACGTCTGATATGTACAATGAGATTAGCAACTACCATCAGTTCAAGTATGAAACCTACACTAATCTTAGTCTACCTTGGCGGTTAGTAGTGATTATGCATTATGTGGAGGGGCCGGATCTGGATTTTGACCACCTGATGGTCTCGGTACTTCTCGAGTGGCTTTGTGACCACCGTGTTCAATTGTTGATAGCAGTACCGAATCATTCTTTCTTGAAGctgctttagtttagtttagttcaacTTCCTATCGGCGGCTCGTAGGAGCACTCCACAAAAGCGATTTTATGCTGCCAGCCCCATTACGTTGAACACGTTTCTGGTTACAGTTCAACCAAATCTGACAGATATTTACAATgagagaaaataatgaaattgtgGAGGAAACAGTTTGGatcttattgatttttttttctttcttttgtgtgtctttttttattattatgatttttttcgtCCCCAATGATgacttaaaaaaagagaaataaatccAATCATCTCAACTAGAATTGCACAGTCTCAAAAAGGTTTGGAGATGGAATGGAGATTTTAAGTCCAAACAGTTGATGAACATAGAAGGGGAGGAAGAAGGTCAATAAAGTTCATGAGGGGTGAGAAGTTCAAAGTTCAGAAGACAGAAGATGGCTGCACGGCTGACGTTTACACACTCCTCAGCTTTTTTGAGCATGTTTTTATGCTAAAGGAACAAAAAGAAACCTGCcattaaaatggattttttttgttttgtttttcttaatgttttccATCGAGAAAATCAAATGGAGAGACTCGGGGGGTGAGGAGAGTGACAGTGCCCCCCAACATTATGGCACACAATCAGTGATGTCCTGGAGGTTGAAGAGATGACAGAATTAGGAAAAGCAGTTTATGAGAGGTAGCCAGCCGTGTTTTTACCGTGTTAATCCAGGTCTTGCTTTTACTGCTCGCTTTTTGGGTAATGTTGAGGCGTCATGACTGACATCATGTTATGGAGAAACATGCTGGCTTCATGGGTGCGTCCAATGGATGTCCAACATACAAGAGAACTCAAAAAGTTTGGAATGgtactgtttttgtttggcACTCAGGAGAAAGTCTGGGAGGGTGTGAGGGGGAGGTCGGCAGAAGAGTGGGGAGTGGTTGGAAAAAAGGGGAGCAGTGAAAGTGCAAAAGGGAGAAAAAGGGAGAGTAAACAGGATACAtatgaatgacatttttgttataCTTGGTCTAGGTTAGAGAGTGTcgtacaaataaaaacaggaaaataaaaaagagaacaGAACAGTGATATGACAAATGTATTCTAACATTGCTGGTGCTTCAATGGGTACGAGCTCAAGAGTGACCCCGGGCTGTCGTCTTCTGATGGCGTGGGGGTGGGGTTTGGACTGGGGCGTGTGGGGTTTGGGAAGAGCGACGAGCTCTAGCCATGCGCCCACATAAAAGCAATGACCTTCTCGACCTCAGCTAAACCATAAGTTTGCATTCATCTCgactgcacaaaaacacaactgCGTCGTGTCCTCTAAGCATGAAAACATAGCAACTATGACTAAGCACAGTGCAATTTTGACGTTgaaattgagagagagagagagagagagagagagaaacaatatTCATGATATCAGACATGCCCTTTTTGGCACTTATTATCATTAACAGTaagaataaaaaacactgtCAAAATAACGATTTCTGTAAAAACTATTCTGCCATTTTTGGTCAGCTTCGAACATCTGGCCAATTCTTTCTCATGCAAACAGTAGTGCCGCATCATTGCATTATGACGTCATCGGGAAGTCCCGCCCCTTTCCTTTAATCGTGGAGGTCTGAGGTAAAGGATTCAAGCAGTTTAGCGGAAACAGGGCTGCTCTTATCAGGGGTGGCGTGAAGCGTAAGAGAAGTATAAAGTGCATATTCTCGCGAGAATGAGTCAAGCTTAATGTGCAGTGATGGCAGAACAAGCTAAAGAACAGAAGCCTAATGATGTTAGTACTGACACAGCAAACACAAGCCCTAAAATCATGATCGAAAGAGTGATATGCAAACTTATGTAGTGGTGAATACATTCACGACCATGTTAATGTCGCTAAATTAACCCTCCATTACCCAACTTTTCCCGTTATTTTTCTTAGAAATTATCACAAAACATTGATAAGTCTGTACAAAATGAGTGCTATAGTTATGACGCTGAATATGACCATGACTATGAATGGATTTGGTTTCTGTGGCCTAGTTTTCATGGACAACAAAAACTCCAGCTTGGTCTtagcaaaactaaaaataaaaaggtaaaaatgtgaaaaaagctaatttaatagCTCGAACTGTTGTTGCCATGCAAAGATTTGTCCTCAAAATGAATGCACATTgcctaattgtttttttttttttgtacaattttttgtcttcacttttttttttaaatccacgCTTCACTTGGTATCATGCAATATCGACGTGCAAAAAAGATAACATCTATCttcacaaaatacattttcagaactATAAAAGGCTGACTTAAGAATGCTGATAACTTATAAAACTTTAACCATGCTAAGCTAACTCGGCAGTCTTCTAGCCCCAGGGGATGTGTGTTAATGGCCACATGGCACCCTGCTTTTGTTTGGCCTACGAGATGAATCCCACCCTTCTTTTTTAACAAGGACTAGTTAGTTTAAGGGGGCAGAAAACCTTATAGTGctaatgtctattttttttgcttctctAGTCACTTTACCCCCGCTAGTTATATCTTAACTGTGGCTTGTTTGgcacttttcacattttttttcttttttttaaattacaaaagtaTGTCTGCTCTTAACTAATGGtgtttaaatcacatttaaatctgTAAAGATCTATTTTGGCACAGGTTTATTTAATCCATTGATATAGCAATTATTTCGTTATcaatgtagcatttagttacaCCTCTTACAACTACCACATCCTGCTAAATGACTGACCAgatatgttttttaatcttaaattttAGTACATCACTTATTCAATAGCAGCATCTTCACAACTTAAAAAATAGTATATGCAAATCTACTCAACATCTAGGTAAATCCAAAGCTCCTACACAGACAGAATAAAAGGACAAGACATGACGACATGCTACTACGTATATTGCTTTCAGTACTCATCACATTTGATCTATTTTCCCAGTtactaacaaaaaaacaaacaaaaaaata

Function

symbol description
nova2 Predicted to enable mRNA binding activity. Predicted to be involved in mRNA splicing, via spliceosome and regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome. Predicted to be active in cytoplasm and nucleus. Is expressed in nervous system; neural plate; and posterior cardinal vein. Orthologous to human NOVA2 (NOVA alternative splicing regulator 2).

NR:

description
PREDICTED: RNA-binding protein Nova-1-like isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU158136 False 6561 lncRNA 0.39 3 15532411 15652810

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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slc6a4a slc6a4a,LOC107743629,LOC107669739,LOC107548586,LOC107756784,LOC107685089,LOC107589714 coding downstream 36837 15480505 ~ 15495244 (-)
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prpf8 prpf8,LOC107685080,LOC107589708,LOC107548576,LOC107743637,LOC107756948,LOC107669735 coding downstream 204367 15315385 ~ 15327714 (-)
LOC122358646 LOC107756729,LOC107685095,LOC107589721 coding upstream 166856 15819666 ~ 15823571 (-)
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G107208 LOC107587564,LOC107714172,LOC107666194,LOC107682571,LOC107756533,LOC107589737 non-coding upstream 462737 16115547 ~ 16120552 (-)
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LOC122359058 dph1,LOC107585615,LOC107664954,LOC107685060 other downstream 1209642 14298251 ~ 14322439 (-)
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G106571 lis1a,pafah1b1,LOC107664934,LOC107743664,LOC108431306,LOC103047044,LOC107585584 other downstream 1626587 13883920 ~ 13905494 (-)
G106570 pafah1b1,LOC107744786,LOC107690414,LOC107592620,LOC107743664,LOC107664934,LOC102225619 other downstream 1650387 13878585 ~ 13881694 (-)
G107064 eml2,LOC107669753,LOC107548590,LOC107743713,LOC107685092 other upstream 123698 15776508 ~ 15782011 (-)
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msi2b msi2b,msi2,LOC108425902,LOC107682662,LOC108435815,LOC108277875,LOC107587484,LOC105028669,LOC106603292 other upstream 898381 16551191 ~ 16762064 (-)

Expression


Co-expression Network