G98533 (osbpl8,LOC107656451,LOC107658748)


Basic Information

Item Value
gene id G98533
gene name osbpl8,LOC107656451,LOC107658748
gene type misc
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035907.1
NCBI id CM008310.1
chromosome length 11650534
location 8775798 ~ 8795749 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU132848
ttgGTGTTACAGGTGATTAACATACAGGAAGTTAATccttaaatacaaatacatcaTCATTAACCGTGTAGAACAGAGAGATGCAGCGCACACTGTCCAAGTGacaacaggacacacacacacacacacgcacactctgTGGTCGGTGGGTTAAAACGCGTCTCTAAGGCTGATTATGGCACAGTCACTCACGCAATAGTGAAAAACAaccaaaattaataaaagtggaaaaaaacttAAAGCAGGCTCCACCCATCACATGCCCCTTCTAAGTCCCACCCATGGCATAGCCCCACCCAGTCTCTCCCAAGAACCCCGCCAACCATAGCCACTCTAAAAAGGCACATTAATGATAAATCTGAAGTTATTACTGGTGTGACCACATTCAAACCTCtaaaacacgcacacacaaaacagataAAAGACACATGTGATATGACGACAGTGTCTAAAGCATTTGTGTAGAAAAACGTTAAGTAACTCATTCCTATATTCCTCCCATTTGGCTTTAACtgataatatttacattaaacgAAGGGGGAGGAGCTACAATAGGAAACATCACAAGATATTCTGCTACACCTTTACTATGGTCAAATTACAGGATTAGTCCTAAACCCTAATTCTACCTAAACCTTATTCCTAACCTGAAGCCAAGCAGTGTCCTGCTGGTCCATATATATTAACACTAGCAATGGCGCAGCATGAGGCTGGCGGTTCTCATGCTCTTCTAGCTCATGTAGATCTACAGCTAATGTAAAACTACATACCTGAAATACCATGGACTcccctacacctacacctaagCTCCTCCTACTATTCCCATAGGTGTGTGTtgattagtaaaaaataaaacacatactCTTACACTCGTACAGAGACACAGTTCATCTGTTGCTTTAAAACTAGGAAGGTCCCGATCCAGTGTTCTCATCCCTGTTCAGATTTGAGTCTACTGTAAACGTTTTGAACCGCTGGAGGATAAGAATTACATctgctaattaaaaaaattcttaattacaaaaaagtatGTCTTATTATGGAGGCACAGcagcaaaaaacaaattatCCCAACTGAATCAGGTTCAGGTCCAGAGAGTAAAAATGACCACTGCCTGGGTGCCTCCCACAAAAcccacaaaaaatgtttttacttagGTAAATTTATCACTTGTAAAATAACTACACCAAATTAATGCAGATCTGAACGGGCTGAGAGATGTGTTTTTGGGGTGTGTATAAAATGAGTCTAAGCCTAGTGTTTGTCAGCACTGTTAGCCTAGCATGGCTACAGAAGCAAACATCAGACACTGGATCAAACTGGGACATCCCTCATTAAAACCTTCCATCCAATTCCCTTACAAACACACCAGTAGGAAAAAGTgaacactgtaaaataacaaagataatataacagtataataataataataataataataataataataataataataatagtgataaagtaaaagtaaaagaggCGGTGCTTTTTAGGCTCTCTCATCTTTTGCAGTCCAGAGCATTTCCCATAATGTACTTTATCTGCAGTCAGTCCCGGAGCACCTCTCACTGAAATTCTGGATCCTTCAGAgcgtaaaaaaaacacaaagcgaGGCAAAGTGGACATGTGCAGAGGTCAGGAGCAAGAGAGTGGTGGACAGGGAGGCGTCCATTCTGGTTTATGTTCGGTCCCTGATCCCAGGCTGGAGTTCAAGAATAATCTTCTGATTATTTGTAGATGAGGGTGAGGACGATCTGAGCACagatgaggaagaggatgatTGCGTAGTCTCTCTGAGTAAGGAAGGAGCTGTGCTCAGTCTGGACCGACACTCGACTCCTTAGAGCACTGATACTCCTGCACAGAAACACCAGGTACTgatcaataattaataatcacacAAATATGAAAAACAGTGGAGTAAGCCATCAGTTCCACCCAATCCAGTCTAACCCAATGCATCCCAGCCAAACCCAATACATACCAATCAACCCAATCCAGTCCAACCTGATACATCCCTTACCAACCAAGTTCAACCCAACACATCTAGTCAAATCAGACAGTCTAACCCAATGCATCCCACTCTAGTTCAACCCAATCCACTTTACCCACCCATTATCTAACTCTGTGATTGTCC
>TU132850
ttgGTGTTACAGGTGATTAACATACAGGAAGTTAATccttaaatacaaatacatcaTCATTAACCGTGTAGAACAGAGAGATGCAGCGCACACTGTCCAAGTGacaacaggacacacacacacacacacgcacactctgTGGTCGGTGGGTTAAAACGCGTCTCTAAGGCTGATTATGGCACAGTCACTCACGCAATAGTGAAAAACAaccaaaattaataaaagtggaaaaaaacttAAAGCAGGCTCCACCCATCACATGCCCCTTCTAAGTCCCACCCATGGCATAGCCCCACCCAGTCTCTCCCAAGAACCCCGCCAACCATAGCCACTCTAAAAAGGCACATTAATGATAAATCTGAAGTTATTACTGGTGTGACCACATTCAAACCTCtaaaacacgcacacacaaaacagataAAAGACACATGTGATATGACGACAGTGTCTAAAGCATTTGTGTAGAAAAACGTTAAGTAACTCATTCCTATATTCCTCCCATTTGGCTTTAACtgataatatttacattaaacgAAGGGGGAGGAGCTACAATAGGAAACATCACAAGATATTCTGCTACACCTTTACTATGGTCAAATTACAGGATTAGTCCTAAACCCTAATTCTACCTAAACCTTATTCCTAACCTGAAGCCAAGCAGTGTCCTGCTGGTCCATATATATTAACACTAGCAATGGCGCAGCATGAGGCTGGCGGTTCTCATGCTCTTCTAGCTCATGTAGATCTACAGCTAATGTAAAACTACATACCTGAAATACCATGGACTcccctacacctacacctaagCTCCTCCTACTATTCCCATAGGTGTGTGTtgattagtaaaaaataaaacacatactCTTACACTCGTACAGAGACACAGTTCATCTGTTGCTTTAAAACTAGGAAGGTCCCGATCCAGTGTTCTCATCCCTGTTCAGATTTGAGTCTACTGTAAACGTTTTGAACCGCTGGAGGATAAGAATTACATctgctaattaaaaaaattcttaattacaaaaaagtatGTCTTATTATGGAGGCACAGcagcaaaaaacaaattatCCCAACTGAATCAGGTTCAGGTCCAGAGAGTAAAAATGACCACTGCCTGGGTGCCTCCCACAAAAcccacaaaaaatgtttttacttagGTAAATTTATCACTTGTAAAATAACTACACCAAATTAATGCAGATCTGAACGGGCTGAGAGATGTGTTTTTGGGGTGTGTATAAAATGAGTCTAAGCCTAGTGTTTGTCAGCACTGTTAGCCTAGCATGGCTACAGAAGCAAACATCAGACACTGGATCAAACTGGGACATCCCTCATTAAAACCTTCCATCCAATTCCCTTACAAACACACCAGTAGGAAAAAGTgaacactgtaaaataacaaagataatataacagtataataataataataataataataataataataataataataatagtgataaagtaaaagtaaaagaggCGGTGCTTTTTAGGCTCTCTCATCTTTTGCAGTCCAGAGCATTTCCCATAATGTACTTTATCTGCAGTCAGTCCCGGAGCACCTCTCACTGAAATTCTGGATCCTTCAGAgcgtaaaaaaaacacaaagcgaGGCAAAGTGGACATGTGCAGAGGTCAGGAGCAAGAGAGTGGTGGACAGGGAGGCGTCCATTCTGGTTTATGTTCGGTCCCTGATCCCAGGCTGGAGTTCAAGAATAATCTTCTGATTATTTGTAGATGAGGGTGAGGACGATCTGAGCACagatgaggaagaggatgatTGCGTAGTCTCTCTGAGTAAGGAAGGAGCTGTGCTCAGTCTGGACCGACACTCGACTCCTTAGAGCACTGATACTCctgTTAATCTCCTCCTGTGTGTGACGTATGGACTCCACTGCGCTCTGCAGGTCAGATATTTCTGGAGCTTTTTTCCTTAGACGACTGCTGGGTTTACTCTTATGtcctaaaacacacattcacaaacacacacacacaccaaacatgtAAGAAAAGATTCAGTCACATAAGTGAGTATGCCCCTCCCatttctgtaatttttaaatttgattttcgtgggacaacactgaagacaagaatgtagtcagtgtacagtttttaaaacatgtagACATTAATGCGTTAACAGCTGGCAACAAAACTCAGTACACTCCTgagtgaaaatggccaaataGTGCCCAATTATTCATTTTCCCGCCCCAATGTCATGTGATTGATTCGTTAGTGTTACaaggtctcaggtgtgaatggggAGCAGGCCTGTTAAATTAGTTGTTTTGGGTAGTGATCGACCGATTAATCAGCCGTCTAATTATTGGCATTGACCGATATCTATGCGCACAAGGCCAATATTTAATTGATGCCTTTAGGCACCGCTCCGGGCAGCAGCGTCAGttaataaaacagcattttaataattataaacagGTATAATTACTTGTAGTAGTTTTTTGCCGTCAATTGTTTTGGTTATTGTAATGCATATGTCAGGTGTGGCTGCTGAGTAAATGGCAAATTTTGTactttattttgtaatatattaaaCAGTATAACTGCtctcatttttattgtattatttgtcAGAGATGACAGCCACACTACTCTGTACATTATAAAAGATTAGATAAAGTACTTTTCAGATGTATCACTTAAAAGACCTACTTCCCCATAGTCCACTGAGTGAAGTAATTACAGTATGTATCAGTATTGTAtccatattttgtttgtttaaaataaattgtacaAGACATTTCATTGCcttttgtgtaaaatgttcaATGTTTGAGCCATACATTACAGtgca
>TU132852
ATTTACTATGATAATGATGCAGAAAATACACTCACATGGGACAGCAGTACAGTGTTATTTCAGAAGATGACTCGGAAACAgccacatctgtataagttgtgatgTGTTATCTTGTAGGTGAGGGTGAACACTGGTGAGTGTGCTCATGGTAAGGCCACATGAATTAGAGCGGGAGTCATttatatctcacacacacagacatacacacacactcattcactcactcacttaaaTGCTACAACAGAACAGGAGTGCAAAGCAGCAAGgacaaataaacagacaaagaaaacaaaaacaagccaCTATGAGGCAGCCAAGCACCCAGACGATGGTCAAAGTAAATGGAATGGACCACGAAGAGCAATGGAGAGATGGAAGCAGAAGGAGAAGGAAGGTTGGGCGGGGCTGGACGTACCTGGCTCAGGTAATTGTCCCTCCGGGTGCCCTGCTGGGCACTGAGACTAACTACACTGGCTGAACGTACCATAGGAGTCCTGTGCCGGACTTTAGTCTGAATACAGCCGTCTTTCTCAAACTGGATCAGATCATTCAGCGGGTCCCATGGACGAGTCTGAGTATCTGTAATGCCACTCTCCGGTACCAGGGTCTTGCTCAAACAGTGCTGGAATCCACTCCTCACACTTGGCTTTCCTCTCCCGGGCTGATTTTCTCTGAACCTCCTCCAATATGAATTTCTCATTGGTGGCCTCAGTCTGGTCTTTATTGTTAATGGCTCTGGTCACATGCTGCCAGAGTCTCTCAGACTCAAACTCGCCCTGCTCCTCAGGTGGGACGGTGCAGCGGGTGAGGCGGCTTTGGCGCAGATCCGGTGTTGGGTTCCAAAACGTCTCCATCTCACCTGTCTTTTTATCATTAATAAAGATCTCAGAGTCCCAGTGTCCCTCCAGCGTAGCCAGCACTTCTTTCCCCAGTTTAATCTTCCCACTTATCTGATTAACACTGTCACTGCTGCCCAGAAacggCTTTAGTTTAAACTCCAGCTGGGAGCTGTATCCTGTTTTCTCACAGGTGACTGATACTTGTCCTGCCAGCTCTAGAGTCATCGTTCCATACAGaatacCCTTGCAGTGGGCATAGGGCATGTTCATGATGTAATCCTCTCCTCTGTTCAGGAAGGTCAGTCTGGCTTCACCATCCAGAATTGCAGACAGAGAGTTTCC
>TU132853
gtaattttagaaaaaaagtcTGCCATCTCTCATTCAGTTGAATGGAAATAGGCGGGGTTAAAAGTTGTACTGgagccagccaccagagggcgtaAGAGACGTAGTGGCTCTACTTTTCAACCCCTGTTGTGCTGtccatatttatatacagtctatggtcttaacatatatttatttatttattttttaaatataatttgtgctttttttatttattttacaggtaAGCCTAGCTTTAAACCATTTCTTTATAATCcttaattagatttttagtaagggcgaaaataatataattattataattataaataataatataatggaaTAGTccataatcgcccagcactgCGCTAATCTCACCAATTTTAATCATCTACGTCATATTTCTAATCTAGCCTTCATTTCCAAAATTGTTGAGAAAACAATAGTGACTCAACTCTGTATGAAAAGTTTCAATGTGCTTTCCATCCTTTCCATAGCACAGAAACTGCTCTCATAAGAATCACAGATGAGCTCCTTTATGGCTGCTGATTCTGTTTTACTCTCTATTCTTATCATCTTTGACTTGAGTGCTGTATTCAACACCATCTGTCACACCACTCTCTTCAATAGACCATCTTCCATTGATATCACTCAAACTCCTCTAAACTGGTCTCAATCATATCTCTCTTGCTGTACTAGCCTAAAACATTTACTTTCCAGCTTTCATCCTTTCAGGTGTGCCCCAGGGCCAATtctatttatataaattttcaagcaccactgtatgtctgtggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtaacctgTTAATCTCCTCCTGTGTGTGACGTATGGACTCCACTGCGCTCTGCAGGTCAGATATTTCTGGAGCTTTTTTCCTTAGACGACTGCTGGGTTTACTCTTATGtcTCTCACTGCCAGACGAGTCCTGTTGTTCTGGTTCCGGAGAGGAGCAGCCGCTCTCCGCATTTTTGGCTTTATCGTTCTGCTTGTGCTTTCTTTTAGGTCCCGTTAcCATAGGAGTCCTGTGCCGGACTTTAGTCTGAATACAGCCGTCTTTCTCAAACTGGATCAGATCATTCAGCGGGTCCCATGGACGAGTCTGAGTATCTGTAATGCCACTCTCCGGTACCAGGGTCTTGCTCAAACAGTGCTGGAATCCACTCCTCACACTTGGCTTTCCTCTCCCGGGCTGATTTTCTCTGAACCTCCTCCAATATGAATTTCTCATTGGTGGCCTCAGTCTGGTCTTTATTGTTAATGGCTCTGGTCACATGCTGCCAGAGTCT

Function

symbol description
osbpl8 Orthologous to human OSBPL8 (oxysterol binding protein like 8).

NR:

description
PREDICTED: oxysterol-binding protein-related protein 8 isoform X3

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU132848 False 2144 lncRNA 0.41 2 8793563 8795749
TU132850 True 2828 lncRNA 0.39 3 8788848 8795749
TU132852 False 1181 lncRNA 0.48 7 8775798 8783503
TU132853 False 1284 TUCP 0.40 4 8781286 8790609

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103029934 LOC108443716,LOC106606150 coding downstream 53993 8712872 ~ 8721805 (-)
zhx2 zhx2 coding downstream 128216 8624302 ~ 8647582 (-)
nsmce2 nsmce2 coding downstream 168939 8603108 ~ 8606859 (-)
LOC103027825 NA coding downstream 263500 8509797 ~ 8512298 (-)
fam84b fam84b coding downstream 366549 8406971 ~ 8409249 (-)
glipr1 NA coding upstream 144378 8940127 ~ 8945629 (-)
LOC103035192 NA coding upstream 153000 8948749 ~ 8993021 (-)
LOC103022230 LOC107698273 coding upstream 344950 9140699 ~ 9160699 (-)
LOC103044428 NA coding upstream 712307 9508056 ~ 9524810 (-)
LOC103042898 gnb3a,gnb3,LOC103042898,LOC108432288,LOC107672997,LOC102782474,LOC107549492 coding upstream 927542 9723291 ~ 9743918 (-)
G98524 NA non-coding downstream 38550 8736870 ~ 8737248 (-)
G98523 NA non-coding downstream 39623 8735818 ~ 8736175 (-)
G98522 NA non-coding downstream 42944 8732358 ~ 8732854 (-)
G98521 NA non-coding downstream 47384 8728101 ~ 8728414 (-)
G98520 NA non-coding downstream 51361 8724173 ~ 8724437 (-)
G98541 NA non-coding upstream 19601 8815350 ~ 8816071 (-)
G98550 NA non-coding upstream 58615 8854364 ~ 8858617 (-)
G98555 NA non-coding upstream 73370 8869119 ~ 8874896 (-)
G98559 NA non-coding upstream 91547 8887296 ~ 8888504 (-)
G98562 NA non-coding upstream 100947 8896696 ~ 8897120 (-)
prelid3a prelid3a,LOC107715058 other downstream 299886 8467176 ~ 8475912 (-)
LOC103044427 NA other downstream 967656 7781480 ~ 7808142 (-)
LOC103043934 LOC103043934,LOC108429921 other downstream 996514 7769129 ~ 7779284 (-)
LOC111193437 NA other downstream 1066293 7684766 ~ 7709505 (-)
LOC103044954 LOC103044954,LOC108429942,LOC100705775,LOC107699547,LOC107589412,LOC107582081,LOC103388254,LOC107599504,LOC103356523,LOC101077558 other downstream 1924960 6843486 ~ 6850838 (-)
LOC103034868 NA other upstream 105719 8901468 ~ 8914931 (-)
yeats4 yeats4,LOC107555875,LOC107590554,LOC106609801,LOC107717680 other upstream 366652 9162401 ~ 9179368 (-)
LOC103027931 zgc:92606,LOC108432344,LOC107549485,LOC107724707,LOC107672985,LOC107598403 other upstream 733887 9529636 ~ 9537670 (-)
LOC103043823 tpi1,tpi1b,LOC107700200 other upstream 764383 9560132 ~ 9578053 (-)
G98804 NA other upstream 1003874 9799623 ~ 9800918 (-)

Expression


Co-expression Network