G98718


Basic Information

Item Value
gene id G98718
gene name NA
gene type non-coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035907.1
NCBI id CM008310.1
chromosome length 11650534
location 9460960 ~ 9467046 (-)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU133094
GTGAATAGTAACAAATATTACAAACTGTAGTGcccctgtacacacacacacacacacacacacacacacacacacacactttatttaaaaagcattctCCCTCTTTGTGTCCTTAGTTACCAACTAAAATCACATTTACTGAAATTCTCATTTGGACTCATCTGTACTGTACAGAGAGACGGTTTCATCTGTACTGTACAGAGAGACGTTATGCTACATACAGAATAAAGGGAGGGGCGGGGTGagcagtgacacacacacacacacacactcttcaggTTTGGTTTGCGGTGATTCAGCACAGAGGTGTATGATTGTAGCTGCTGAATAGTTTGGGTGAGTTCTATCTGTGCAGTGAAGAATGGGGTGATACTGTAAATCAGTCTATAGGGGGCAGTAATGTTCTGTCAGTATAAGAGTACAGTGGAGTGAGCAGCAGCAACTGCATGTACACCCTGTTCAGTTtttggttccataaagaaccattAAAGAGACAAGCAAATATAAAGAACCTTTATCAGTTATCAAAGAAATCAGGACACCCTATATCCTATAAAAACTCTCGTCtttttgaacacatttaaatgtagtTGGCAAGGTGTGGCTCAGTAATTAGAGTGATGGCTTACAAatcacaaggttgtgggtttacTTCCCATAATTGCTAAGCTGCCACAGTTAAACCTTCAACCATTTCCACTAGGGCTGGCCATGGTTCTTCCAATAAGCAGTGGTGACTCAGTGGATAGAGCAATGGGTTACCAatcacaaggttgtgggtttaattTCCACAATTATTAAGCTGCCACAATTAGACGTTTGACCATTTCCACTGCAGTCAAGAGTATAGGGCTggcaaatgttatttttgtgaGCTGTAGGGGCTCAGTGGATAAAATGATGGCTTACTGATCgcaaggttgtgggtttaattCCCATAATTGCTAAGCTGCCACAGTTGGACCTTTGATCATTTCCACTCCAGTCAAAAGTATAGGGCTGGCAAATGTTATTTATGTAAGGTGTAAGGGGCTCAGTGGATAGAGTGGACCATTTCTACTCCAGTCAAAAGTATAGGTCTGGCCATGGTTATTCCAGTGAGCAGTGGTGGCTAAGTGGATAGAGCAACGGCTTACTGATCACAAGGTTGTAGGTTCATTTCCCATAATTGCTAAGCTGCCACAGTCGGACCTTTGACCATTTCCACTCCAGTCAAAATTAAAGGGCTGGCAAATGTTATTTATGTGAGCTGTAGGGGCTCAGTGGATAGAGTGATTGGTTACTGATCACAATATCATTGGTTCAATTTCCACAATTGCTAAGCTGCCACAGTTAGACTTTTGACCATTTCTACTCCAGTCAAAAGTATAGGTCTGGCCATGGTTATTCCAGTGAGCAGTAGTGGCTAAGTGGATAGAGCAACAGCTTACTGATCACAAGGTTGCAGGTTCATTTCCCATAATTGCTAAGCTGCCACAGTTGGACATTTGACCATTTCCACTCCAGTCAAAATTAAAGGGCTggcaaatgttatttttgtgaGCTGTAGGGGCTCAGTGGATAAAATGATGGCTTACTgatcacaaggttgtgggttcaattctTACAATTGCTAAGCTGCCACAGTTGGACCTTTGACCATTTCCACTTCAGTCAAATGTATAGGGCTGGCAAATGTTATTTATGTGAGGTGTAGGGGCTCAGTGGATAGAGTGATGGCTTTCTgatcacaaggttgtgggttcaagtCCCACAATTgctaagctgccactgttggacCTTTCACCATTTCTACTCCAGTCAAAAGTATAGGTCTGGCAATCGTTATTCCAGTGAGCAGTGGTGGCTAAGTGGATAGAGCAACGGCTTACCgatcacaaggttgtgggttcattTCCCATAATTGCTAAGCTGCCACAGTTGGACCTAAAATGATGGCTTACTgatcacaaggttgtgggttcaattctTACAATTGCTAAGCTGCCACAGTTGGACCTTTGACCATTTCCACTCCAGTCAAAATTAAAGGGCTGGCAAATGTTATTTATGTGAGCTGTAAGGGCTCAGTAGATAGAGTGATGGCTTACTGATCACAAGGTCATGGGTTCAATTTCCACAATTGCTAAGCTGCCACAGTTAGACTTTTGACAATTTCCCCTCCAGTCAAAAGTGTAGGGTTGGCAAATGTTATTTAATTGAGCAGTAGTGGCTCAGTGGGTAGAGTGATGGCTTACTgatcacaaggttgtgggttcaattcccacAATTGCTAAGCTGCCACAGTTGGACCTTTCACAATTTCCACTCCAATTAAAAGTAAAGGGCTGACCATAGCTATTCCATTgagcagtggtggctcagtggatAAAATGATGGCTTTCTGATCATAAGGTTATGGTTTCCATTCCCACACTTGCAAATGTTAAGCTGCCACATATGGATTGTTGACCATTTCCACTCTAGTCAAAAGTATAGGTGGATAAAGTGCAGGTGGATAAAGTGCTCAAGAgagcagtggtggctcagtggatAGAGTGATCGCTTACTgatcacaaggttgtgggttcaattctTACAATTGCTAAGCTGCCACAGTTTGACCTTTGAACATTTCCACTTTAGTCAAAAGTATAAGTGGAAAAAAGTGCTCAAGTGAGCAGTGGTGGCTTTGCAGATAAAGTGATGGCTTACTGACCACAAAGTTGAGGGTTCATTTCCCACAATTGCTAAGCTGCCACAGTTTGACCTTTGACCATTTCCACTTCAGTCAAAAGTATAGGGCTGGCAAATGTGATTTAAGTGAGCAGTAGTGGTCCAGTGGAAAGAGTGATGGCTTATTGATCACATGGTTGTGGGGTCAATACCCTGTTTTCTTGATCCCTTCTGCAAGGCCCTTAACACTCTGTCCACCAGTGAAAGTATATGGGTGGCCCAAAGCCTCAAAAGGCTATTCTTGGATAATGGCTAATGGTGACTTAGTGGTTTGTAAGCAATGTTATTGATCACATGGTTGTGGATTCAATGCCTGTGACTGCTAAGCTGCATGTTCCACTGCAGCAACAAATGCATAGCTGAacctattctgttctattctagtgggaagtggtggctcagtggctAGAGTGATGGTCTATTGTTTACAGGGTTGTGGGGTTGATACCCTTGTTTTCTAAGCTGTTGCTGGGTGTGGGGCCCTTTAGCAAGGCCTATAACTATATCTGTGGTCCAGTAAAATATATGGATGACCAAAAACCTTAAAAGCATCTGGGTAATGGTGCCTCAGTGATTTGGATAATTGGTAAGTTAATTgatcacaaggttgtgggttcaatacctgcTATGGCTAAGATGCCACAGTTGGACCTCTGAACATTTCCACTCTAGTACAAGGTGTATGGCTGAACCTCAGAGGGTCTCAGAGGGCAACTTTCCTGGGTTAAGAACACTTGAACAAAGGATCCAGTGAGGCAGCGATTGACCACAAGGTTGTAGGTTCCATATCTATGATTGAAAAGCTGCCCTTTTTCAGCGTGTTATTCTGATGGGTCATGGCTTAGTGGGATGAATACTGGGTTGCTAATCACAGGGTTATGGGTTCGGTGCCCTGGTTATGACAATGCTAATGCTTTCCGGCCCTTTACGAAGGCCACTAAATGCTCTATGTTCTAGGTTAAGAGGCTTAATCAAATTAAGTAGCAACTTCAGTGAATGAAGTTTACCTATGGTTGCTCAGTCAATAGAGCACAGGCTTATTAatcacaaggttgtgggtttcaCTTACTATTAACCATCATATCCCTCAGTTctattgttgtttttcttccaTTTGATTCATGATCACGAtcattcaagatttttttttctgaccacaTTTCTTCTTTAAAGATGATGTTTCTCCACTGTCcttccactttttaataatgcacTGGATAGGTCTAGTTCTTAAACAGATTTTAGTAgtttcatccataatctccttAGGTGTTTTCTCTGCTTGTTGCATGCCAATAATTTGACCCTACTGAAAAAGATTACAACAGGATtctttaacaaatgagaagctactcactgcatcagttagggttaaatacAGTAACTTGTTGCCAGCTGAAGCAAAATCACCCATCTATACCTCTTTCACACTCTTGCCTTTGGAGTCATTCTGGTAGAAATATAATGCAGTATGCTTGCTACATACTGTGTAGATGAAATGGTCTTCAAGTATCGCAATGTTCCATCTCCACCacatcgcccacctctagtaaCAACAGCAGGACTTCCTGCTCTCTATTCCCCTACAGCTGACTGAAGCTGAACACTGTGAGGTATGTAAAAATGATCAATTCACGATCAATTCCAGTGGACCACGTGAGCGTGCAAATAAGTTTTCAACTAACTGTACAACAGTAGAGTATATTACTGCGTTTACAGTACACTCAGGAATTCGTGTgatgtctcatgacttttgccatttccCATGAAAGCTGAAAGCttgttgttgctttttttgtcatactaataGTTTTacgattatcaaacaaactgcaatgcacacaaaattatgggtgacatatcagagttcaaaagaggacaaattgttggtgcacgtcttgctggcgcatctgtgagcaagacagcaagtctttgtgatgtatcaagagccacggtatccagggtaatgtcagcataccaccaagaaggaccaaccacatccaacaggattaactgtggacgctgtaagaggaagctgtctgaaagggatg
>TU133095
GTGAATAGTAACAAATATTACAAACTGTAGTGcccctgtacacacacacacacacacacacacacacacacacacacactttatttaaaaagcattctCCCTCTTTGTGTCCTTAGTTACCAACTAAAATCACATTTACTGAAATTCTCATTTGGACTCATCTGTACTGTACAGAGAGACGGTTTCATCTGTACTGTACAGAGAGACGTTATGCTACATACAGAATAAAGGGAGGGGCGGGGTGagcagtgacacacacacacacacacactcttcaggTTTGGTTTGCGGTGATTCAGCACAGAGGTGTATGATTGTAGCTGCTGAATAGTTTGGGTGAGTTCTATCTGTGCAGTGAAGAATGGGGTGATACTGTAAATCAGTCTATAGGGGGCAGTAATGTTCTGTCAGTATAAGAGTACAGTGGAGTGAGCAGCAGCAACTGCATGTACACCCTGTTCAGTTtttggttccataaagaaccattAAAGAGACAAGCAAATATAAAGAACCTTTATCAGTTATCAAAGAAATCAGGACACCCTATATCCTATAAAAACTCTCGTCtttttgaacacatttaaatgtagtTGGCAAGGTGTGGCTCAGTAATTAGAGTGATGGCTTACAAatcacaaggttgtgggtttacTTCCCATAATTGCTAAGCTGCCACAGTTAAACCTTCAACCATTTCCACTAGGGCTGGCCATGGTTCTTCCAATAAGCAGTGGTGACTCAGTGGATAGAGCAATGGGTTACCAatcacaaggttgtgggtttaattTCCACAATTATTAAGCTGCCACAATTAGACGTTTGACCATTTCCACTGCAGTCAAGAGTATAGGGCTggcaaatgttatttttgtgaGCTGTAGGGGCTCAGTGGATAAAATGATGGCTTACTGATCgcaaggttgtgggtttaattCCCATAATTGCTAAGCTGCCACAGTTGGACCTTTGATCATTTCCACTCCAGTCAAAAGTATAGGGCTGGCAAATGTTATTTATGTAAGGTGTAAGGGGCTCAGTGGATAGAGTGGACCATTTCTACTCCAGTCAAAAGTATAGGTCTGGCCATGGTTATTCCAGTGAGCAGTGGTGGCTAAGTGGATAGAGCAACGGCTTACTGATCACAAGGTTGTAGGTTCATTTCCCATAATTGCTAAGCTGCCACAGTCGGACCTTTGACCATTTCCACTCCAGTCAAAATTAAAGGGCTGGCAAATGTTATTTATGTGAGCTGTAGGGGCTCAGTGGATAGAGTGATTGGTTACTGATCACAATATCATTGGTTCAATTTCCACAATTGCTAAGCTGCCACAGTTAGACTTTTGACCATTTCTACTCCAGTCAAAAGTATAGGTCTGGCCATGGTTATTCCAGTGAGCAGTAGTGGCTAAGTGGATAGAGCAACAGCTTACTGATCACAAGGTTGCAGGTTCATTTCCCATAATTGCTAAGCTGCCACAGTTGGACATTTGACCATTTCCACTCCAGTCAAA

Function

GO:

id name namespace
GO:0005198 structural molecule activity molecular_function
GO:0005212 structural constituent of eye lens molecular_function

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU133094 True 4766 lncRNA 0.42 6 9460960 9467046
TU133095 False 1511 lncRNA 0.42 6 9464214 9467046

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC103022230 LOC107698273 coding downstream 300261 9140699 ~ 9160699 (-)
LOC103035192 NA coding downstream 467939 8948749 ~ 8993021 (-)
glipr1 NA coding downstream 515331 8940127 ~ 8945629 (-)
LOC103029934 LOC108443716,LOC106606150 coding downstream 739155 8712872 ~ 8721805 (-)
zhx2 zhx2 coding downstream 813378 8624302 ~ 8647582 (-)
LOC103044428 NA coding upstream 41010 9508056 ~ 9524810 (-)
LOC103042898 gnb3a,gnb3,LOC103042898,LOC108432288,LOC107672997,LOC102782474,LOC107549492 coding upstream 256245 9723291 ~ 9743918 (-)
p3h3 p3h3 coding upstream 287187 9754233 ~ 9770056 (-)
LOC103025791 LOC103025791 coding upstream 506235 9973281 ~ 9981178 (-)
LOC103040958 NA coding upstream 531609 9998655 ~ 10011711 (-)
G98711 NA non-coding downstream 22488 9438109 ~ 9438472 (-)
G98655 NA non-coding downstream 93804 9366468 ~ 9367156 (-)
G98649 NA non-coding downstream 148102 9312620 ~ 9312858 (-)
G98647 NA non-coding downstream 150951 9309733 ~ 9310009 (-)
G98645 NA non-coding downstream 152616 9307103 ~ 9308344 (-)
G98742 leng8,LOC107700201,LOC107724921,LOC107744285,LOC107672965 non-coding upstream 79288 9546334 ~ 9547539 (-)
G98750 NA non-coding upstream 122708 9589754 ~ 9593828 (-)
G98751 NA non-coding upstream 126351 9593397 ~ 9688181 (-)
G98748 NA non-coding upstream 151483 9618529 ~ 9620541 (-)
G98782 NA non-coding upstream 240620 9707666 ~ 9719982 (-)
yeats4 yeats4,LOC107555875,LOC107590554,LOC106609801,LOC107717680 other downstream 281592 9162401 ~ 9179368 (-)
LOC103034868 NA other downstream 546029 8901468 ~ 8914931 (-)
G98533 osbpl8,LOC107656451,LOC107658748 other downstream 665211 8775798 ~ 8795749 (-)
prelid3a prelid3a,LOC107715058 other downstream 985048 8467176 ~ 8475912 (-)
LOC103044427 NA other downstream 1652818 7781480 ~ 7808142 (-)
LOC103027931 zgc:92606,LOC108432344,LOC107549485,LOC107724707,LOC107672985,LOC107598403 other upstream 62590 9529636 ~ 9537670 (-)
LOC103043823 tpi1,tpi1b,LOC107700200 other upstream 93086 9560132 ~ 9578053 (-)
G98804 NA other upstream 332577 9799623 ~ 9800918 (-)
erf erf other upstream 1036908 10503954 ~ 10580725 (-)
G99033 NA other upstream 1136884 10603930 ~ 10606219 (-)

Expression


Co-expression Network