G79678



Basic Information


Item Value
gene id G79678
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000013
NCBI id null
chromosome length 12551977
location 2800130 ~ 2812494 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence


>TU90735
AAGAGTCTCTTTCTGATATAGTGTGGGAAAATAATGCAGCGTGTGGAATTTGTGGTTTCAGTGATAATGTGCAAGTCTGCAGACTGGCAAACAAACAGATCTCTCTAAAATGATACTCTCTGACTAGTTTGTCTGAATATAGCTTCACATGCTTTTCATCCTTTTTTCCTTCTTCATCTGTTTTTTTCTTAGTCCTTCATCTTTTGTCACTCTAAAGGTTTATATGGCTTCTTTTTGTATTTAATTTTAGTTTCCTTGCTTTTTAACTGTGTGCGTGTGTACGCTTGCTTGCTTTTGTGTTGCAGAGCTCTTTTGCTGTTATATTTACAGCAGCGGGGGACATACTCAGTGTGAAATCCAAGTAGGCCCCTTATGATTTCAAAAGCCGGTGTCGTTTTACTCACCCTGGCGTTGACTGTCCCGCAGACGACCGCTCTCAGCTGGTTGGGAGGACACATGCCGGTCCTCACGGGACCTAAAAGAGTCACAGTAAACATGTCTCCTCTAACCAAGTCACAACTTCCCCCTTTTGACCCCAGGGTGTTTAAAGTGTAACATCTTGTTTTCTGTGTATCAGACAGACAGGACCCTCTCTAGAGTTCTGTTTATGCTGCTGTTTAAGTTGTGTGCATGTGTGTCTACGTGGCTTGGCTGTGCTGAGTTGCTAATGAAACGCAGGGCTTTTTCACCATATGATGATTTGAACTCGGTGTAACCCACTCTTTTGTTCCACTGCCCTGTAAATCTCTTCCGTCAGCATTAGGAGGGGGAGGAGGGGAGAATATGTGTGTGTATGTGCGTCTGTGGATGGAGAATATATTGGGTGTGTATGTAAAATTTGCATGCCTCGTGCTCATGTTTTGTGTTGAGTGATTGTGTTTGTAGACAAAGAGAGAGATGGTGTTGTGCGTATTTGTTTTTCAGCTTGATGGACGCTGGATCCTGATGTGGATCCTCATTATAGTGCAGCTGGAGATAGACAGAAAGAGCGGACGAGCGTAGTTGTGTCTGTGTTTTTGCCACTGCCTGTGCCAAATCGTCCCGTCGCCACCGTCGTAAATCTGATGGCTGATGTGCGAGGTGGTCATATTAATGGAGCACCATCAATCACACCAGGCTGTCTGAGATTAGACTGTATTTGCTTGATGGGATGGGGGAGGGAGCTCTACCTACAAGTGAACCTGACAGAAACATCTGCTTAGACTAGTCCAGTTCAGCTAAAACCAGTCTAGATGAACTCGATCCAGCAGTCCAGTTGAGCTAAATCCAGTATAGTCCAGTTTAGCATGCCCAGTCCAGTTTATCTTATTCCATTTTAGCTAAACCCAGTCAATTCAACTCAGATAAGCCCAGACCAGTCCAGTCCAGCTCATTTAAACCCATTCAGGTCAAGTTTAGTATGCCTGTCTTGTTTGGTTCCTGTTTAGCTAAGAAAAGTCCAATTGTACTCAACTAAGCAGCCCAGCCCAGTCCAGTTTTGCTAAACCTATTCAGGTTCATTTTCGCATGCAGAGTTCAGTCCAGAATAGTTTAGCATGCCCAGTCCAGTTTATCTCAGCTAAGTCAAGCTCAGTCCATTTAGCTAAACCCAGTCAATTCAACTCAGATAAGCCCAGACCAGTCCAGCTCATCTAAACCCAGTCGGGTCCAGTTTAATATGCCTGTCTTGTTTGGTTCCAGTTTAGCTAAGAAAACCCTATTGAAAAAAACAGCATATGCTGGTTAGGAATGTTGCTTAGGACCAGCACCTGGCCACCTTAAACCAGCTCATGACCAGCTAAGGACCAGCATAAACCAGCTCAAACCAGCTGCCATGCTTCAAAACATACCTAACCAGCATATGCTGTTTTTTTTTTCAACAGGGAAATCCAATTGTACTCAGCTAAGCCCAGTCCAGTCCAGTCCAGTTTAGTTAAACCTAGTCAGGTTCAGTTTAGCATGCAGAGTTCAGTCCAGATTAGCTAAAACCAGTCCAGTTTAGCATGCTCTGTCCAGTTTAGCTGTAACTAGTCCAGTTATACTCAGCTAAGCCCAGCCCAGTCCAGTTTAGCTAAACCCAGTCATGTTCAGTTTAGCATGCAGAGTTCAGTCCAGATTAGCTAAGGCCAGTCCAGTTGTACTCAGTACCCAGTCCAGTTAAGCTATAAACCAGTCCAGTTTTTAGCTAAGGCCAGTCCATCTGCAGATTGACCAGCCTCTGAAATGCAGCTTGTGGCTTGGCAGTGATGAATGATTAAGTGAAAGGGTGAGGTAGAGAGCAGGAGCCAGGGAAAGGGGGATGGAAGAGAAAGAGACACAGATGAGACAAGTGTAACAGCCACTGGAGAGCCAGAAAATTATATGAAAATTATAAGAAGAAACACAAGACTGCAATGAAAGAGAAGCAGGGTGGCAGTGACAGACACAGAGAGATGAAGAAGACATGAGGAAAGAAAGACACCACAAGAAGCCTGGGAAAAGATAGGAAGAATAAAGAAAATGCTTTATGTTGACCATCCATTTGTATCTTATGAGACCACCATCCCATCAATGTTTGACAAGCTTGACTAAATCTGTTTCCCAACTGTGTGTTTCTCTGTTGAGAAGAGTTAGGAAGTTGTCATTTGACCTATCCAATAATATTTTGTAGTGTTATTTATATACCATTACAGTATTTATTAATAGTTTTCATTTTAGTTAACAGTAATAACACTGGTCCTGTCCTTATGAACCTCTCCACAGGGCATGAGTATGACATCATCAGCATCCGCCTGTGTTTTAATGAACCTTCCTGTCTGGATCCTCATTAAGGATGGGAGAGTGTAGAGTACCTCAATCACATCCTCTCAGCCATGTGTGTGTGTATGTGTGTCCGTATGAGAGTGTATGTGAAATATCATATTGTATATGCACATGGGAACTCTCAATGCTAATGAGCATGCTTGAGTGAGTGTTTGGCGCTGACATGCGAGTGTATGCCTCTTATTTGATGTGCCTAAGCCACACTGCAGCAGCATGAAAAGGCTGTAATCTTTAGCTGAAGTCCCGCTAATCCACGTGAAGGTTACTGCCGCACTGTACATTGCATTCCCTAAATTAAAGCAACAGTGTCCAGGATGTATGCGTTGGAATGCAGCAACTCAATTTCATAATTGATGGATCAAGCAGATTAATCATCTTCACAATGTATTAACTATATTCCATGTTTCTACATCCGACCTTTGGGACTATTCAGGGTCATTTAGTGGCATGCAATGTACAGTGTATTGTGTACTTGAAGATATTATAATCAGGGTCCTTTGGATAAACAGCTAACGTAATGCATAATTAATGTAATTTATTTCACTCTGGCGCTGGAATAGATTATGGTGCCCTCTTTGATTCAGCTTGACCTCCACCATCACCTTTGCATGGTCTTCCTTGAGGAAGCGTCTCATTGGAAGTCGCCACGGATGTGTTCTTGCTCCTGTTGACCTTTTCGATGATGGGAACTTGTGAGGTGTGATTGGGGATTTAGGGAGCTAGAGCACGAGACAGAAAGGTGAGAGAGAGAGGAGGTGATGGGAAAAAGCGAGACAAAACGAGAGACAGTTTTGAAGTGGGTGACTCCATTTCACACAGCTGCTATATTGTGACCTTTCTGCAGACCGTTGTCCCTCTCCTTCATCAAGGCAGTGTGCCGGATTTAAGTTGCATCAGCAGCATGGTACTAACCTAATGTTGCATCTTCCATTTTTCCGCTAGATGGGCGACCTTTAAGCTGCTTGTTGCCTTTTTAATGCCGATGCCAGTGGGCCATGGTTTGCAGAAGGATAACAAAGGGACGTTGCACGTTATTACTGCAGCTTTACGGTAAAAAAAAAAAAAGTCATTTGTGGGCAACAAAGAAGCATGATGTGAAAGAAAATTGATTTTGAAGATTGGCTTTCGATCTCTCGTAGGAATTTGCAGATCTTGGTTTCGTAGAGTGGCCGGTGACAGCTGGGATCTTGCTTTTGTGCCACTGTTTGGATATTATCATTGGTTCCTTAATCACAGTCCCATTACAGCTCACATATAGTACATTGCCAAACACAGCACATTTATAATATTCACTTCCTCTCTGATTTGAAAGACAATGTATGTATGTTTCCACTTTTATGATCAACAATGAGCATGTTTACATGCACACCAGTGCACTGATAACTCACAAAAAACAGCTTATTGAAGTAACCCATTGTCCAGGTTTACATGCAAACCAATAACCCGATAACGCAAGTAAACCGCATGTACAACACTTTATTAAAATCAGATTATTTCCCGGTAGTGACGTCAAAATTTAATAATCTGACTCCGAGTATTTCACATGTTATGTCGATTGTGATGTTAAATAAAGCATTAAAAACCAAAGAAGAGTATTGCAACATGTCAGCGGGAAACTTATGGCTCATATATTATCCTCTCATGCAGTTACAGATGCAGCATTTTGACTGTATTTCTTCTGCTGCTCAAGGTGAGAGCACTTTTATCATTTTTTGGTCAAGAAAGAGTCTGAGTTTGCGATGTATTTCCTCTTCCCTTACTGCAAAATGCTTGCTTTGTCTGGATGTGCTTAAATCCGCAGTAAGGACGAGTTCCTGTCAAATATCATACATTACATGCTGGGCGAAATCGCCGTAAGGGGCAAAAATCTATCTGTGGCAATCGGTTTATGCTTAAGCTGTTTATGACCTTACTCCGATAAAGGAAAATGGGTTAATGTGTTTACTACATGATTGCGTGCATTGTCGACTTATTAAGCATAATCGGGTTAAGAACGTGCATGTTAACGCACTCAATTTGACATCTATAGAAACCCGTTTCTGCCTCAGAGTAAAGAAATAGTATCTGCAACTATAATACAATTTCAACTTCATTGCATCTTTAAATCTCTTGGTTGTCAGTAGAGCAGCACGTTTAATCGTTAAAAGATCTCAATTCAAACACCCATGCTCAGAGTCCTGCACGCGGGTGGGTACCCGCGGGTACCCGATGGGTGACCC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Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU90735 True 12227 lncRNA 0.40 2 2800130 2812494

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
CI01000013_02733870_02751654 NA coding downstream 48476 2733706 ~ 2751654 (-)
CI01000013_02718442_02730091 BCAR1 coding downstream 68541 2718306 ~ 2731589 (-)
CI01000013_02606100_02629603 GNAO1, GNAO1A coding downstream 170527 2606100 ~ 2629603 (-)
CI01000013_02536846_02547039 GNAO1, GNAO1A coding downstream 253091 2536846 ~ 2547039 (-)
CI01000013_02529628_02531898 GNAO1, GNAO1A, GNAO1.L coding downstream 268232 2529557 ~ 2531898 (-)
CI01000013_02834348_02858912 CFDP1 coding upstream 21760 2834254 ~ 2858912 (-)
CI01000013_02870258_02903686 CARMIL2, RLTPR coding upstream 57764 2870258 ~ 2903686 (-)
CI01000013_02912132_02916617 CTCF coding upstream 98697 2911191 ~ 2916617 (-)
CI01000013_02919679_02944235 FAM65A coding upstream 107095 2919589 ~ 2944235 (-)
CI01000013_02999657_03003223 NA coding upstream 186779 2999273 ~ 3003580 (-)
G79761 NA non-coding downstream 159575 2640344 ~ 2640555 (-)
G79757 NA non-coding downstream 166403 2633404 ~ 2633727 (-)
G79756 NA non-coding downstream 166754 2633157 ~ 2633376 (-)
G79755 NA non-coding downstream 167294 2632488 ~ 2632836 (-)
G79752 NA non-coding downstream 168824 2631050 ~ 2631306 (-)
G79779 NA non-coding upstream 72178 2884672 ~ 2884964 (-)
G79842 NA non-coding upstream 350116 3162610 ~ 3164376 (-)
G79852 NA non-coding upstream 379751 3192245 ~ 3194984 (-)
G79856 NA non-coding upstream 387993 3200487 ~ 3200710 (-)
G79929 NA non-coding upstream 430409 3242903 ~ 3243398 (-)
G78296 NA other downstream 2773233 26528 ~ 26897 (-)
G79690 NA other upstream 753 2813247 ~ 2815392 (-)
G80262 NA other upstream 752677 3565171 ~ 3567537 (-)
G80271 NA other upstream 906939 3719433 ~ 3723607 (-)
G80399 NA other upstream 1091573 3904067 ~ 3906240 (-)
G80443 NA other upstream 1252448 4064942 ~ 4066017 (-)

Expression



Co-expression Network