G107610


Basic Information

Item Value
gene id G107610
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000019
NCBI id null
chromosome length 5832599
location 963042 ~ 971248 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU122333
AGAGGACCTTGCGGGAGTGGGCGGGAGCGGGACGAAAAAAACAGTCCCACGCAGATCTCTATTGCAGCATGCATTAGCTACAACAGTATAGTCAAACATATTCGTTAATAGGTATTTGGCTATTAGTTAACTCTATTTTACCTTTCCGCACCATAGCTGATATCAGCTTATTAATCAGTTACTATATTTTGCTAAAAGATTACAAAAAAAAAAAAAACGGGAATGCGTAACAGTTATTGAGAAAATAAAAAAAGGGTTCATCTATACATTCAAAAATCTGTTTTACATCAGCACGATTTGGCAGTCTTGGGGGTCGCACTTTTATACAACTAATTGTTTCACAGTAATTATTTCTAAAAAGGTCATGTATGTTCAACACTATTGTCTAGTGCTATTTTACCATCTCATCAAATTCTATTATAACTGCTTATTTTTGGGTTAATGTGATATATCCAGCATTGAGCAACTGCCACTGAAATGAATAAATGGGAATGCTTACTGACAGCTCTCTACAGGTACCTCCGTGGTTGCAAAGATGCGCAGATGAATTGTGTAATATATCTGTAAATTTGGCAGTGCCAGGCTAGGGTAGATCATCTCTATACTGTACATTCAAGTATAATTTAGATAGAGACAACAGCTATGCTAATGATACTGTGAGTCACTGTGCTGCTTTTTATGGTCGCTCAGCTCTCACAGATTTTGCATGCCCCTTTTTTCCCAGTATGACACACCAACTGCATTTGAAACCCACTAATAAATTGTTGAGTCACAGTCTGCCAAATGCATCTGCTTCACTAGATACAGAGAGCAGCTGATTGTCAACTAAATCATGATTCAGTCTTCATCAAAGATGTTCCAACATGTGCTGATGTGATGTCACTTTCTCACTGGGCCATGCCTTTGTTGGATATTCATGTCAGTTGTTTAAACATGTCACTTCCTGTCCTGTCACAAGGAGACGGTTGTCAAGATGTGACAAGACGTTACAAGATTGAATACGCCAGCTGAGAGACTTGAAATGTGTTTTTATATTGTAGAAGGAGTGTTTGTTCAGAAAATAGCTCTGAATGCCTGTAAGTAAGAAGGATGAATTAAGTAATTTACAGTAATGAAATTTAGTTTTTCAAGATGTTTTTCACTGGCTAGGAATTTCATTTCACTTGGGTACTTTGGTTTTTAAACACATTCTGGTATGAATGTAATTATTTTCTCTTTTTTTTTTGCCTTTTTTTAAGAACCCCAGTAAATAGGAAAATGCAGAAAATCACCTGTGACAAAAACGAAGTTTTTGTTCCAGCAAAATGTAATTACTTAGATAAATTTATAGTGTGTTTGTATTCTCATGCAGTACGGGCGGCCACGTGCCCATTATTTTGTTCTTGTGCGATTATTGCAAGTGGAAAGTGTAAAATGCTGTTTCCATATTTTATGGGGATATTCCATAGACGTAATGATTTTATACTTTACAAACTGTATATTCTATCCTCTAACCATAACCCTTACCTAACCCCTAAACCTATCCGTCACAGAAAAATTTCTGCATATATTTTCAAAATACATCATTCTAAGTTTATTTATAAGCTGTTTTCCTCATGGACACCAAAAATGTCCTCGCAAAGACAAGGATTTCGGATATTGCCATAACATAGGGTTTACCAGGACCCTTTTTAACTTTTTTTTTTTTGCATTTCTTATCCTTTTTCCCCCAATGTTTTTCAATTTACTATTTGTATCTTCCCTAATTCCCAGCTCTTTGCACTCGCTATGGCTTTTTTTACTCACTACTACATCATTTCTTGCGGTTTCTTTCTCCTTTTCCCACTGACCCCACATGGCTGATCTCACCGTGATTTGTGGTTTGCAGCGATAGAGGCAGAGCTGATTGGATTGTGTTTTATGTGCTCTCAGTTGAGTGTACCACCTGTGTGTGTCTTTGGAACGTGCTACCTGCCAGTGTATTTACTATGACAGCAGACAGTACTTACACACCTGATAGAACAAACTGAAATTGTAATGTAAAATGCAATAATTGGACCTTGAAACTACAAAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAAAAAGAATTAAATAAACACTGATAATAGAATAAATGGTGTTGAATACACCCTTTCCATGCATAAAAAATGTCAAAAATCCATAAAATTCAACAAGCTCTTCTGTATAGGGAATACCTGCAACTCCCGCAGGTAAAGTTACAGAGGGAGGCATGCCTCCTCTCCCCTAATAGAGAATCAACAGACCCCCTAAAGCGTGCGGTGCGTTTTGTGGGGGGTAATTGAGAATGTCACATGAGAGGAGGCAATGTCTCCATCATGCTAAGATTGAAAGTGATTAGTTATGATTGGATATGATTGGTTTGTGCGATAAATCCCACCTCTTGTTTACGTGGCCATTCCGTGCGTCAGTCTGAATGAACAAAATGATGGCGTCATTGGGAAGACAAATTGTAAAGTAAGTAAACAGCTCAGCCACTTAGATATCATCAGCTTGGTGAAATTAAAGATACACCTTCATATCTGTGACAGACGGTGTTTACCAAGCATGACTGATGATCCGAAATAGCCTAAGTTGACTATTTATAAAATTTTTTCTTTTTTGATGTAATATAAAGTAATGTCCATTTAACGAGGAAAATGTGACAACGTTAAGAGTAACAGATATAAATTTACATTTGATTTATATATAAATAAAAAACTATGAGGACTTTGCCTCCTCATTTCAGAACACCACTCAAGTGTTACATATCGCAAATGCAGTGCTGTACCAGGTGAGCTACTGAGCAAGTTTACTACATCAGAAAATCCATACATACATGTATGGAGCTGGTTATGTGATGCAAACATCAAAATATATTATTTTACAAATCATGCACTATAGTAAAAGTGTTTCGAGGTCATAACATAGTATTGTGCAAGGAACCATAATAAGTAAATAAGTCTTTATTAATCAATCATCTGCCCCTGTAATGATAATTTATGCGAAGAAGAATAAAAGTTGGTATTTTATTGTGAAATTTACTAACACTTTCTGAGTGAAATTTGTTCAAAGTAAATCCTACACCATTTTTTTCACATGTTGAATATCTGAGGTATGAACTGATGCTTTTCCTCCATCCTTTCTTCCTGACTTACAATCAGACTGTCAAATCTCATTTCCTGTCTTTTGCTCTCCCACGCAGAAGCAGACAATTCCCTCCCTTAGTGTGTGGAAAAGCAAAAAATAGCCTAGCGCAGTTGTGTTTACTGAGAATTGAATTAACAAAGGTTGATTAATAATGGCTCTTCTTGAGTACTGATAGTTTCAAAACAAAGCTCAATCTCTTTAATGTGATTAGTGATCGTTCACCCAAATATGAAAATTTTGACATAATTTATATTTATATAGTTTACTCACTCAAGTATTGATGGCTTTCAGTTCTCAGTAAACTCAATAGTAGAGGTTGCACCATTATTTTTTGGATCATTTATTATATTTTAGCTCATAACCCAGAAATAGCCCCTTTAGCTGCATGCACATCTTGTGTTATTTACAAATGGGCTCACATGTAAATTATAAAGTAATAAGTCCCCGCTGTTCCATTGAGCCTGGACTGCACCTGCTCTGGCTCAACTCGACCATCATTGTGCCAAGACTGGCCAAATCTGTCCAAAAACCAAACAGTTGAATGGCTTATGGTGGCCAGATTTAATTATTTAAATTAAATGTGCTGTATTACAGTTTCTATTAGAAAAAAAAAAAAAAAAAACACTATATTGTATGAAAAAAAATTCTGTTAATGTTTTCACTGAAAGTTGAATGTACCTTGAATGCAATGTATGTCGCTTTGGATAAAAGCATCTGCCAATTGCAAAAATGTAAATGTAAAATCTAAGTCCGTATTATATATTTGTTTGTGAAATTGCTCATGTTTTTCCTCATTTGTGGTTGCTTTGAATGCTTTGCCACCAATTCACCCATAAAAAAATAAATTAAATGGACATTAATTTTAGCAAAAGAGTGAGAGAGTCCTTTTCTGAAATATGATATTGCCCAAATCTATGTTATTCGGCCAAATAATATATCAATCCCAGAGTTCTCTGCACTATGAGCCTGATTTGAATCGTATATGCCTTATATAAAAATTGGGCTTTTCAGGAGTACTAGATACAGACTATTGGTGTAAAATAATGCAGTGCTATATTTATAAGAGAACAGAAGTGGCTATAAAAAGAAGAAAAAATTAGACTTGCAGCATTGCTCCATTTGTGTCAAAAATTGTGGAGCCCAACGCTTTTGTGTGAGAGTGCTGATGTGAAGTATTGTATGAGCTTGATTATACTTTGTCACTTCAAGAAAACGTGTATTTTTATATGAATATTCTGTATGTTATGTGTCTGCATATAGTTACTTATCTATGTGTGAAGAACATAAATAACATGTAATGTACTCCAGTGAAATGTCACTAGTCTGTAAATAACAGCGTCCTGTTCTTGCTTTTATGAAGAGAGGTTATTTATTTTATTTTCCGCAATCCTTTATTTGCTGTTTTTGCCCCTGGCAGCTTGCCGTACCCATCCATTACCATAGTGCTGATACCCACACTTCAGCATGCTCATTACTGATGCAGTTCGTCTCATTCACACATCATGTGCCATCAGTCAGGTCAAGGGCTTGATCCCCATTCATCTATCCTCTATGCTCTTTCTTTTTTTATTGATCTTTTACACATATTTGACACTATGCTATCTCATGCTATATGAAGGTAAAGGCAAGAAGATAGTTTCTATACATTTGTCTTGTCTTTGACTATTAGCATCACATTGAGAGTTTAACAGTTTTATGCTTTATAACCTTTATAATAGTGGAAATGGGTGATGAAATATTGAAGAAGCTTAAACGTAAAGTTTTAGTATTTTCAAATGTTGCGTTTTACACTGAACACAGAGAAAGTTCAGGCAGCCCAGCCAGAAATTGTATTATTCTAAGAATGTTCTGAGAACATTAA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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU122333 True 8102 lncRNA 0.35 2 963042 971248

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000019_00883109_00944808 IQSEC3, IQSEC3A coding downstream 18234 883070 ~ 944808 (-)
CI01000019_00780085_00781813 NA coding downstream 180849 780031 ~ 782193 (-)
CI01000019_00778246_00779688 NA coding downstream 183354 778044 ~ 779688 (-)
CI01000019_00760820_00771998 NA coding downstream 190465 760312 ~ 772577 (-)
CI01000019_00725134_00725945 NA coding downstream 235829 724038 ~ 727213 (-)
CI01000019_01085786_01091282 TNNI1C, TNNI1D, TNNI1 coding upstream 113079 1084327 ~ 1091282 (-)
CI01000019_01148054_01149463 NA coding upstream 174860 1146108 ~ 1149877 (-)
CI01000019_01193076_01209887 SCYL2 coding upstream 221290 1192538 ~ 1209887 (-)
CI01000019_01213457_01219101 NA coding upstream 241637 1212885 ~ 1219336 (-)
CI01000019_01235890_01236084 PIMR70 coding upstream 264609 1235857 ~ 1236084 (-)
G107601 NA non-coding downstream 173842 788999 ~ 789200 (-)
G107600 NA non-coding downstream 174107 788681 ~ 788935 (-)
G107599 NA non-coding downstream 176681 786091 ~ 786361 (-)
G107591 NA non-coding downstream 195806 766915 ~ 767236 (-)
G107590 NA non-coding downstream 196973 765172 ~ 766069 (-)
G107658 NA non-coding upstream 54648 1025896 ~ 1026510 (-)
G107663 NA non-coding upstream 68762 1040010 ~ 1040287 (-)
G107669 NA non-coding upstream 78150 1049398 ~ 1049610 (-)
G107699 NA non-coding upstream 158090 1129338 ~ 1129674 (-)
G107709 NA non-coding upstream 161580 1132828 ~ 1133116 (-)
G107779 NA other upstream 452317 1423565 ~ 1423817 (-)
G107820 NA other upstream 507603 1478851 ~ 1479141 (-)
CI01000019_01503557_01515831 NA other upstream 532256 1503466 ~ 1517469 (-)
G109437 NA other upstream 1368955 2340203 ~ 2340758 (-)
CI01000019_03618642_03619707 NDUFB2 other upstream 2647140 3618388 ~ 3619973 (-)

Expression


Co-expression Network