G139123


Basic Information

Item Value
gene id G139123
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000027
NCBI id null
chromosome length 10680226
location 209732 ~ 216101 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU158100
TGTAATTTGTCTGAAATATATATCATCTTTCATTTTATACAGACTCCTCTTTTTTTCTTTCTCATAGGAGATCTTTGCCTACTCCAGAGCCTGTATTATTCTGTCAGCTGTAAAGGAAGTACTAATTTGAAGGCTCTTGTCTCCCTTCTGTAATGCAGATTTGACTACTTTCTCCCGCTCAAGCAGCTGTAATTATGTACTCGGGCTCTGCAGCAGCTTTAATAAGATAGCACTCTTCAGCAGACAGAGGACTATTCACAAATCAACGGCTTCTCCGCTCCTCTGCTCAATTACGACTGGAGTTTCTCACGAGCTTTCGAGAACGTAATAAACTGGGATATGAAAACATTTTGGAGAGAGCATTCAGTTTGCGATAATAATGACAAAACATTCCCTGTTATTAATCAAAACCCTGTTGATAAGAACATTGCCAAGCATCTTTAAGGGCTCAAATTAGGCTGTAAGCTCAATAAGCCAAGAGCATTGTTGGACTCGTTGTAGTTTCCCAGCCTCTCGTCTTTTCATTTTTTGTCAGTCATGGTTGAAGTTGATTTCTAGTAGAGCCCAAAAACAAAATCAAGACTTTGAAAAAGTGCATAATAGGTCCCCTTTAAGGAAAGATGTTTAAACGACACCCTAGCATCATGTAGATGAGATTTTCATGGACAAACACCACTCACAAATCTGGTTATGTTTCTATTTCAGTTGCAGAAGGTTTTCTTAGAAGAACTCGTCGATTAATGTGTTCGGCTCCGGTCTCTTTTAACAGTGGTGGTATTACTGTGTAACACGAACGTAGTTTTCACAGGCTGATGTGTCCTGGGTCGAGTGTTCATCTAATGTGTCAGCTGGAAGTAGTGATAGTTTACACTGTCTCACACCATGTATTTGGAAACCAGATGGGAAAAGCCATTCAGATGTGTGGGAAAACACAGAATCTCCTTTTCAGAATAGACGTGAACTGGCCAAGTGATATTCTGATGGGCATTTTGATTTGAATCCTGCAAAAATAATTGTTTGGAATGTTGTACAATATTTTTGAGATCATAAACATCTACGTTTTTATATTTGGTGATTTTCAATGCAAAACTCACCACTACTGTGCAGTTGCTAAGGTATTCTGAGTAGCTTTTTATGATGAATAGATTGAATTTAGACTTTTATTCACATATAAACATTGATCACCAAACATAAACTTCAACCGTTCTTGTTTGACGCGAGAGCAAACCTCATTGGGTTTTTTTGCAGAAGCTCAAATGTGCTGCGTAACGCCAGAATAAACCTCATTGGTTCTTGCACATCAAGCAAATGTGCTTGAGCTTCCGTTACCATATCTGATGTGTGTGTTGACAGATGTCTATATGTACATAAAAGCCAAAAATTAAAACTGTTCATCATATAAAGTGATCAAATCTCTTCAGAAAATTTCGACTAAACTGCTCAATTCATATGGATTAGTAGTTTGTGATCTCTTTATGAACTTTTTGAAGCGTGATAGTGGTAGTTGCGTAGCTGTCAATGGAGGGACAGAAATCTCTCAGATTTCATTTAAAATATCTTCATTTGTGTTCCGAAGATGAACGAAAGTCTTACAGGTTTGGAACGACGTGAGAGTGAGTAATTAATGACAGAATTTTTGGGTGATGTAATCTTTAAGGTTAGTGGTTTGTTCAAATCACTAACTCTAAGTAGTAGTTGATCTTGCTTTCACAAACAACACTAATGATTCTTTGTGGCCTTTTGCTCGCTTGTAATCAGCTGTTTTTAAAATCGGCCATGTTTTAATTGGTGTTTTGGGAACGTTCTTTCCACATCCACAGAGTTACGTGTTAAACTAACAGACTCTAGAATGTTATACGGTCGGTCAAACAACCGTGTAGAAATGGTTTGTTTTATCAGTGTTCATATAGATTAAATGTTATCTGTTTGTTCAAACAGCATTCGGCCAGTAGAGCAGAATGTTAATGACTAAAATGACATACCAGAGTCAATCAAACCCAGGGTCAACCGATGTTGGTGCCGAATGAATGTTTATTGTGTTTTGTATGACATTTTTCAAATGTTATGCTTTGCACTTGTAATAAACTTGAAACTTCAATCAGTGAAAAGAAAAACAGAAAGACATTATTAACCCAACAATAGGCTCAATCCTTAGTTCACTTTGGACAAGGCAGTGAATCAATGTGATTGATTTGCATGTCATTTTCTTGTCTTGTTCCCTATAGTTACTTTATACTGGGTTAGAGCGAACGTGTTGGCTTGCATCTCGCCGCAGCTAAGCCAGAGACGTGGATTAAACCTCTCTATAAATACATCTCGTAGCTCGACGTCAGGCTGTCCTCACATCATACGGCTAGCATGTGTTTTTCTCGTCTCTCGTTTGGCACCGATTCTTAATTAGAAGCGTGACGTGAGCTTTCGGTTTTACGGTGAGCATTTGATCCCTTCTGGCCGTGGCAGATAGTCTGTCCCTCTCGCTGGCTGACCGTTCAGACCGGTGACTGCTGGTTGAGTTCAGGGATTTCATGCTAGATTTACGCAATGACACTGACACTGTTTGTACTTTAGAGTAAGACACTAAGTAGGGAGCATAAATGAGCATCATCCCTGTTTTCAGTTGATGTTTCTCCAGTACATTCATGTTAGGTTGCTCCAGATTTGTTATTGTTAAGGTGCCCCTATTATGCTAATTTAAACGTTCCTAATTGTGTTTTGGAGTCTCTTACAATAGATTTACATGCATCCAAGGTCATAATATACGTTGCACATCACTTCATTTCTCAAAGAGTCTGAAATGGTTAATTCAAAGTTAATTCAGTGATACTAAATACTATTTTTGATTTGAATAATGTTACCATTTATTTCAGTATTCCATGATTTTTTTTTTTGTTGTTGTTGGCTCGTTATACATGTTTTCTGAGTGTCATATGGGTGAGGGATTGTTTCTATAGTTCCTGGAAACATAAAAACATTGACCTGTTTTCTGATAGTTGTGATGTTTGCTCTGGATTCAGAGCGTCGGTTTATGAAGGGTTCTTCTGTGGCTTTAACATTTGAAGGGTAGTATTAGTCAACATGTTTAATTACAGACCATACAGATGTTTCCCAATAAAACGTATTTTTCCATGGCACATTAAATGTTTGAGCTTTCCCCTTTGGTCTCTTTGGTTCTGTGAAAAACATTTGGTAGCAATATGTGTCATTGACGAGACTTTAACTGTGCCAGATCTAGTTCATAACTCTGATGTTTTTCAAATGAACTAGTCTTTCACATGGGAACATAGTGGTTGCTGATACATGCAATATTTTACATCGCACTTTTATAGGACAAAAATTAAAAAGCTAATTAAAAATTGTCTTGTAGACTAAGCTTTTCTAGTGTTTGTAGAATAATGTCAGTTACTACATCATATATATATATATAATACACATCAATTTAAACCCTACTATGCAATGGTGTATTGAAGCACTACAATAGAAATGCTACTTGAAAACACTTGTTTTACCAGTTTATTGTTTCATAATAAATCACCACCCCTCCTTACAATGTGGAAAGCACTCCTAAAGTTGCTTTACTTTGCTTTTGGTTGCTAAAAACTGAGGTGTGTTTTCCAGATGCAGATTAATAGTCGTATTTCTTGCTGAGGGAAAGAGGCTGTGGGAGTGAACAGATGTTCTTGTGTCTCCTGAGGAATGGAACAAGGCAAGGTTAAAATGTTTGGAAAGCAGGACGGGTCTTACTGCCAGTTTCCAATGTTCTTTAGGGCAAATAGTTGTGCTTTACATACTAAACGCTTTTAATGCCATTTCGAATGTTTCCATTTTCAGCCAATTAACATATTTCGGCCCATGTTTACAGGATGCAGATTCAATATTTAGCAAGTAGCATTGCAACTCATTTTGCATGCAAACAGGTCATTTACAGTAGCAGAAACAGCGGGTTAAATGTTTAATGCAAGTATGTAGATGGTCAATATGTTTCAAGCATGCTGTGGTGATAACCAGACAAACCTCAGATATATAGTACGTTAACTGTGCAACGTGTACATTGTTATGCATTGCAGTTGGTGTATTTCAAAATGCATTGATGCCTGAAGTTATTCGTACTTGCCTGGTAGCATTTGTTTGGGCTGCTTGCATTAAGTATGTTTTGGGCCAAAGTGTCAGAGAGTGACAGTGAAAAATAGTCGAAGCTTGACTAAAGTTATAAGTGGATTGCGAGGAAAAACAATGCAGCAAAAGTGTAAAATATGACTCCTATAAATGTCTGTAGCACTGAAGCTCATTTGAATACAGCTCCCACGTTATCAGTGCATAATGTGCAGTGAAAAATTCACTGCGACGGAGGCCTTGCCTGGTCACATTTCCCTCACAGCCAAAGGCAGAGAAACTGTCAAGAGTGGTCAAATCAGGCACTTTCCACGGACTCACCTATGCCGTCACAAGCATTTTGAAGCACTTGAAGTGATGAAGTGAAACGATAGAGGTTGTATAAGCTCAAAATGTTTGACCTGACTTATGTCAATCTATTTCAGCTTGTGCATTATGCATGTGTTTCCTTCTCTCAGTTTAAGGGTACATCCATTTGAATATTCAGAGCTCTTCACCTTGTTTAATGTAAGCTGAATCAACATTTTCCATATGTGTGCGTAGGAGGATAAATGGATGATTGGTGAACAAGCAGACCCTTAAAAAAAACACGGATTAGCGACTGCAGACTCTGACTAATGGACCTATTGTGTTCAGCTGATGCACATTAATGAAGAGGGAAGGTTATAATGTTCATCAGCTGTGTGTATGATGAACTACCTGCCGTTTCTGATCAGTTTCAGTGCTTTATATATTAGTGAGAGATGTGTGTGTATTTATGTTTATATATGTGTATGTGTTTTTTAAATTTGAATAAAATGAAAACTAAAAGACTTTCAAATTTTTTATTTACAATAGAACATAGATAACATAACAAATGTTTAAACTGAGACATTTTCAAATTTTATGCTCAAAATGAGCTCATTTCAAATTTGATGCCTGCTACAGGTCTCAAAATAGTTGGGACGGGGGCATGTTTACCATGGTGTAGCATCTCCTCTTCTTTTCAAAACAGTTTGAAGACGTCTGGGCATCGAGGTTATGAGTTTCTGGAGTTTTGGTGTTGGAATTTGGTCCCATTCTTGTCTGGTATAGGATTCCAGCTGCTGAAGAGTTTGTGGTCGTCTTCGACGTATTTTTCGTTTAATGATGCGCCAAATGTTCTCTATAGGTGAAAGATCTGGACTGCAGGCAGGCCAATTCAGCACCCGGACTCTTCTACGATGAAGCCGTGCTGTTGTAATAGCTGCAGTATGTGGTTTTGCATTGTCCTGCTGAAATATACAAGGCCTTCCCTGAAATAAACGTCGTCTGGAAACCTTTATATACCTTTCAGCATTCATAGTGCCTTCCAAAACATGCAAGCTGCCCATACCGTATGCACTTATGCACCTCCATACCATCAGAGATGCTGGCTTTTGAACTGAATGCTGATAACACGCTGGAAGGTCTCCCTCCTCTTTAGCCCGGAGGACACCGCATCCGTGATTTCCAACAAGAATGTCAAATTTGGACTCGTCTGACCCACTTTGAAACAGTCCATTTTAAATGAGCCTTGGCCCACAGGACACGACGGCGCTTCTGGACCATGTTCACATATGGCTTCCTTTTTACATGATAGAGCTTTAGTTGGCATCTGCAGATGGCACGGCGGATTGTGTTTACCGACAGTGGTTTCTGGAAGTATTCCTGGGCACATTTAGTAATGTCATTGACACAATCATGCCGATGAGTGATGCAGTGTCGTCTGAGGGCCCGAAGACCACGGGCATCCAATAAAGGTCTTCGGCTTTGTCCCGTACGCAGAGATTTCTCCAGTTTCTCTGAATCTTTTGATGATGTTATGTACTGTAGATGATGAGATTTGCAATTTGACGTTGAGGAACATTGTTTTTAAAGTATTCCGTAAAAATCTTTTTACGCACTCTTTCACAGCTCTGCCCATCTTAACTTCTGAGAGACTCTGCCTCTCTAAGACATCCCTTTTATAGCTAATCATGTTACAGACCTGATATCAATTAACTTAATTAGTTGCTAGATGTTCTCCCAGCTGAATCTTTTCAAAATTTCTTGCTTTTTCAGCCATTTGTTGCCCCCATGCCAACTTTTTTTAACCTGTAGCAGGCATCAAATTTGAAATGAGCTCATTTAGTGGATAAAAGTGTAAAATTTCTCAGTTTAAACATTTGTTATGTTATCTATGTTCTATTGTGAATAAAATATTGGCTCATGTGATTTGAAAGTCTTTTAGTTTTAATTTTATTCAAATTTAAAAAAAGGC

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU158100 True 6370 lncRNA 0.38 1 209732 216101

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000027_00178291_00179467 EXT1B, EXT1A, EXT1, EXTL1 coding downstream 30265 178289 ~ 179471 (-)
CI01000027_00137910_00141799 NA coding downstream 66455 137292 ~ 144599 (-)
CI01000027_00131884_00132650 NA coding downstream 77082 131395 ~ 132650 (-)
CI01000027_00108990_00118237 NA coding downstream 91324 108119 ~ 118408 (-)
CI01000027_00078634_00087807 TAP1 coding downstream 121013 78492 ~ 88719 (-)
CI01000027_00332200_00343377 NA coding upstream 115881 331982 ~ 344039 (-)
CI01000027_00645077_00650763 SLC25A32B, SLC25A32 coding upstream 428893 644241 ~ 651285 (-)
CI01000027_00701871_00719591 COL28A1B coding upstream 485665 701766 ~ 719591 (-)
CI01000027_00742700_00758723 COL28A1B coding upstream 526530 742631 ~ 758723 (-)
CI01000027_00798826_00806532 ICA1 coding upstream 582585 798686 ~ 806532 (-)
G139138 NA non-coding downstream 63946 145381 ~ 145786 (-)
G139089 NA non-coding downstream 87227 121498 ~ 122505 (-)
G139154 NA non-coding upstream 22572 238673 ~ 239396 (-)
G139155 NA non-coding upstream 23339 239440 ~ 239676 (-)
G139158 NA non-coding upstream 24743 240844 ~ 241126 (-)
G139160 NA non-coding upstream 33022 249123 ~ 249388 (-)
G139167 NA non-coding upstream 38269 254370 ~ 254604 (-)
G139117 NA other upstream 18111 234212 ~ 237579 (-)
CI01000027_01241417_01245177 NA other upstream 1028534 1240478 ~ 1246267 (-)
CI01000027_01303308_01319462 NR2F5, NR2F1, NR2F1.L, NR2F2 other upstream 1085933 1302034 ~ 1321178 (-)
CI01000027_02119227_02124423 NA other upstream 1906029 2119131 ~ 2125142 (-)
CI01000027_02226447_02227499 NA other upstream 2010524 2225781 ~ 2227499 (-)

Expression


Co-expression Network