G145353


Basic Information

Item Value
gene id G145353
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000028
NCBI id null
chromosome length 9874160
location 1610867 ~ 1691443 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU165163
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Function

NR:

description
PREDICTED: heat shock 70 kDa protein 4-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU165163 True 22095 lncRNA 0.37 4 1610867 1691443

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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CI01000028_01180290_01228705 NA coding upstream 381844 1180123 ~ 1229023 (+)
CI01000028_01172762_01175983 NA coding upstream 434732 1172762 ~ 1176135 (+)
CI01000028_01716012_01751372 GRAMD1BB, GRAMD1B coding downstream 23642 1715085 ~ 1752033 (+)
CI01000028_01756600_01766746 NA coding downstream 65157 1756600 ~ 1766746 (+)
CI01000028_01807411_01830472 DNER coding downstream 115968 1807411 ~ 1830740 (+)
CI01000028_01854902_01867810 PID1 coding downstream 163459 1854902 ~ 1868500 (+)
CI01000028_01991288_02032906 SPHKAP coding downstream 299794 1991237 ~ 2034191 (+)
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G145358 NA non-coding upstream 32967 1577632 ~ 1577900 (+)
G145368 NA non-coding upstream 159534 1451126 ~ 1451333 (+)
G145346 NA non-coding upstream 194818 1415842 ~ 1416049 (+)
G145408 NA non-coding downstream 105747 1797190 ~ 1797468 (+)
G145418 NA non-coding downstream 146950 1838393 ~ 1838610 (+)
G145420 NA non-coding downstream 189623 1881066 ~ 1881652 (+)
G145444 NA non-coding downstream 224133 1915576 ~ 1916173 (+)
G145487 NA non-coding downstream 389484 2080927 ~ 2081191 (+)
CI01000028_00525538_00533862 NA other upstream 1088936 524647 ~ 535245 (+)
G145843 NA other downstream 1331703 3023146 ~ 3024220 (+)
G147462 NA other downstream 3267260 4958703 ~ 4989838 (+)
G147636 NA other downstream 3524647 5216090 ~ 5216611 (+)
G147693 NA other downstream 3749011 5440454 ~ 5453610 (+)
CI01000028_07470324_07471346 NA other downstream 5778449 7469543 ~ 7471432 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
zebrafish (Danio rerio) XLOC_013076 NA non-coding NC_007129.7 CM002902.2 46913104 ~ 46925873 (+)