G153423


Basic Information

Item Value
gene id G153423
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000029
NCBI id null
chromosome length 9486966
location 3191593 ~ 3201635 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU174228
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU174228 True 9891 lncRNA 0.37 2 3191593 3201635

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000029_02976262_03013586 MAN1A1 coding upstream 177680 2976107 ~ 3013913 (+)
CI01000029_02956475_02956765 NA coding upstream 234705 2955888 ~ 2970825 (+)
CI01000029_02904113_02950205 NA coding upstream 240270 2903780 ~ 2951323 (+)
CI01000029_02860076_02868432 NA coding upstream 322656 2858909 ~ 2868937 (+)
CI01000029_02772065_02813214 TBC1D32 coding upstream 377102 2772065 ~ 2814491 (+)
CI01000029_03266557_03286137 NA coding downstream 64848 3266483 ~ 3286145 (+)
CI01000029_03291762_03308373 NA coding downstream 90127 3291762 ~ 3308793 (+)
CI01000029_03324084_03378615 CEP85L coding downstream 122449 3324084 ~ 3378615 (+)
CI01000029_03499444_03499713 NA coding downstream 297558 3499193 ~ 3500186 (+)
CI01000029_03511828_03527110 GOPC coding downstream 310193 3511828 ~ 3528842 (+)
G153405 NA non-coding upstream 7353 3142987 ~ 3184240 (+)
G152522 NA non-coding upstream 138863 3052495 ~ 3052730 (+)
G152465 NA non-coding upstream 199440 2901660 ~ 2992153 (+)
G152446 NA non-coding upstream 455542 2735816 ~ 2736051 (+)
G153430 NA non-coding downstream 195210 3396845 ~ 3490373 (+)
G153449 NA non-coding downstream 252675 3454310 ~ 3456618 (+)
G153461 NA non-coding downstream 282309 3483944 ~ 3484379 (+)
G153466 NA non-coding downstream 294656 3496291 ~ 3496522 (+)
G152451 NA other upstream 428654 2761594 ~ 2762939 (+)
CI01000029_01526863_01527414 NA other upstream 1663694 1526754 ~ 1527899 (+)
G151495 NA other upstream 2819671 366541 ~ 371922 (+)
G151415 NA other upstream 2966348 170521 ~ 225245 (+)
G153475 NA other downstream 343490 3545125 ~ 3562004 (+)
G153790 NA other downstream 1531954 4733589 ~ 4740107 (+)
G154587 NA other downstream 2069385 5271020 ~ 5271535 (+)
CI01000029_05461497_05468985 BATF other downstream 2255606 5461497 ~ 5470346 (+)
G155079 NA other downstream 3081050 6282685 ~ 6288398 (+)

Expression


Co-expression Network