CI01000036_02022324_02026053



Basic Information


Item Value
gene id CI01000036_02022324_02026053
gene name NA
gene type misc
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000036
NCBI id null
chromosome length 2115676
location 2021947 ~ 2031983 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence


>CI01000036_02022324_02026053.mRNA
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>TU198055
GGATGTCTAATTTATCCCTGTTTGCTGTCCTTTGTTGGTGCCCTGATTTGAGGAACAACTTGTTCCTATTCTAAAATGCAAGTTAGCATCTATCTTTGTATGTATGTAGGGTTTGTAAATATGATTTTGTTGGGGCTTAGCATCAGACACATGTTTGTTTATTGTTTGTTTGTTTATATGCAGAGGGTTTCTTGTGTGAGAGAGGATCAGCACAATTTCAAACAGGACCTAGACCAATGGGAGTAATTGTCTTTGTTCATCCAGCAACCATCTACTACTAATCATCTCATAAGCTATGGTCAACAACTGATGAATTGTTTGCTGATACGGATTCTTTATCACTTCACTTAAGGACTGTTTTATCTCACACATTCTACTTTGAAGACTGATCTCTCTGTGGCCGGATGATACTTATTGTTGTATCTATAAACTGATGGACTTTCCAACTGATGGTGTTTCCAAGAACGTTGTGCTGGTATAGACTTGTTGATGTTGATGTTGATGTGTGGCTCACAATATGCACTGAATACGCATGGTTCATTGAAATGTAGCAGTCTGTGTGGTCCCTCAAAACTTCTTTATGCAGCATCCAAAAGGTAGGTGTTACAGGCTGAAAGTGCATCATAAATAAAGTTACTGTCTCTCAAGTCAACTCTGAACTGCTTAAACGAGTTTTTAGTTTGAATCCCATTTTGCGAAGTTCACACGTCACAAGTTAACACATTTGCATAATGCCTGCCTACGTTCTGTGTGGACATCCCACGAAAACTTGAACCCTTCTCAAATGCTGTTGTTCGTTCATGTGGATAACATGTCAACAAGATGCTGTGCTCTGCACTGTGAAAGGAAATTCAGTTTATTTTCACTTCTAAAGGATGAGGCTGTGAAAAATCAGTGATTAAAGATGGGACAGTACCTGCTTTATTTGGACCAACTTGCTCCTCAGAATCACAAACTGTAAGTGTGATTAATTATTGATGTATTTTATACCGTTCAAAATACATCGTTTTGTGTTTTAGCTATATTGTGTATGTCTCCAGCTAACCCACATTATTACTGTCTTAGAGAAATACTTCTGCTAATCAGCTGTTGGCCACTATTACCTAAAACTGTGTCCATTAATACAGATTGTCTGTCATTCTTACTACTTTGAGTAATAATAAAAGATGGAGCAAGATTTTATTTAATGTTAAATCAGTCATTAGTGCTAGGCTAACGTATGCACCGTTATTGATACAGTTAATGATAAAGTTACCACATGTGCACCGCAAAAATTAGGTTTGTTGATGGACATACACTTGTTAACGCTGATAGTAAATTACATCTCATAATGTACCTCAAACTGAGTAGTGTACACTGAGAAACTCAAGTCGTTCTTGTGATGGAGACTAGGGTTGAATACCTATTTCTTATGTTTCATCATCGGACTCACGCTCAGATTCACATGGTAAAATCGATGCTATCGCTACTGTCTTTACAGTGTGTACGATCACTGAGCTTTAGGAAGCATATGGAGCTGATCAGTTATGGGCTTTTGTTTCTGACTTGCACTGTACGCTGTAGACCAATCACAACAGACTGGGCCGTCTGGCCAATCAGAGCAGAGCAGGCTCACTGAAAGGAGGGATTTAGAGAGACTGATTTATCCATTGAGTAGTTTGAGAATCATTGAACAATGTGGTGATATGCAATGTATATTATGAGAAAATGTTTTTTGACCTTGGATGCATGTAAACCTGTTGTAGGAGACCTCCAAAACAAAATTAGGAACCCTTCAAATACCATAATAGGGGCACTTTAACCATCACCACCCCCCCTCTCTTCCCCCGCCTGCGCACAGCACCCCCAACCTAAAACATCTTCCCGCGCCCCTGAAAATCATTCATATTTGATTAACATAAGCAAGCCATATATCAAACAAAAGCTTTCATTCTCAAGATTATGGTTATGTAATTTATTTTGTTGACCTATTACAACAGGTCAAATGATTACCGAATGAATCACAACATACATCTTTGAGCTTTTGTAAGCAAACTAGGAGAAACATTGCATTTCAGCTGCGATTACCTTATCTCTGAGCTAAAAGAAGTCATGATACAGACTTTTACCTTAGGCTGTTTTGGTTCAAAATCAGTCCATTCTGTGAGTTTTGCTTGGTAAATAATCCACCATCTTGTCTCATGAATCCAGTAGCACAACCAGTTAGTTCGGCAAAAGTCGGTCAAAATCGTCAAAACACGTGATCGTGATTTGTGATTCGTGACGAATATGTGTGGAGGCGTGAATAATCCTGAATGATGCTGTGATTCACACCTGAGGAGACAATGACCCGCATAATGAGCCTTTCAGTCAGGTATGTGAGAGGGGACTACAAGAAATGTGGACAACATGAGGACAAAGTAGTTCATTTTGTAGTTTATTTAGAATATAGTTAACAATATAAATGAGAGTCAAAGGCACATTTTGAGTACACAGTTATATCTTTGAACAGGATTTATTTCCTGGTATAAGTGAACATCACTTACCTGGCATTCCAAGGTGTTTGGTGTTTCTATGCACTGGAGAGAAAGAAAAAAAAACCCTTTCCTGCTTCCAGTCAGTAATCTCACTATCATATTCATCCAGTCCAATGTGGGCCAATATCTGGTCACTATGATTCTCAAATCTGTGAGATAAAAGAACCATCTATGAGCTTGCTGATAACAGGATCATATCAACTATCCCAGGTGAAAAAAAAAGTACATTTCTATAATGTACTTAATATACTAAACATTCTTCTTTAGTACTTTAAGTACAAAAGTAGTGCACGAAAATAGAGCACTTTAAGTACATTATTGAAATGTACTTTTTTCACCTGGGATTGTATTAACATTAATATAATGTCCACTCTTAACAGAAAACATGATTTTTGTGATCTCATACATGCACGTATTATTGCACATCATGTGAAGAAAATGTTGTGTAGGCCTATTATATTTTAAATTATATACAGAACCGGTCAAAAGATTGGGCGCTATTACTATTTTTAATGTTTTTAAAAGAAGTCTCATGATCATCAAGCCTGCATTTATTTGATCAAAAATACAGAAAAAACAGCAATATTGTGAAATATTATTACAATTTAAAATAATGGTAAATATAATTTATTTCTGTGATGCAAAGCTGAATGTTCATCATTCTTTGCAAACAAAAGCTTCATTGATGTGGCACTAGGCTATTTCATAGTAAACACTTCATAATCTGTCCAAAACAGGTCAAAGAAATCTTGTCTGAACATTCATATTACCTCTATGACATTTTATGTATCATATTTGTAGGAGCCAAATTAGGAGTATAGCCCTTTAATAACATGCGGAAGTGAATATTAGTGACACCTGTTGATTGCGTCATGGGCTATGCTGGTGGTAGATAGAAGCATGTTATGCAGGAGCACAGTAATCAAAGACGCCAAGCCGATACAGTTTTTCAACGGTGGAAAGTTTAATAAAGCAACGCACTTTATTTGATTTGTTTGGAATACCATGGTATGCCTTTATATTTGTTTTGACATCGCATTGGATTTAATCACACGTCAATTATACGATGAATCAACAACAGCACTGCACAATTACACATCCCGTTCTGCAAATTTCTGCAAAACTTCAAGCAAATTTCAAGTATCGACAGCATGTACACTTTCCTCTTGTTATAACTCGTATGCTTGGAGTATAAGCATACTATATTATATATATATATATATATATATATATGTATATGTGTGCTTGGAAATGGCAGATAGTAGAAATTAGACATTAACGGATGCCATTATATTAGTTGAAAAGCTATCGAACGAGTTACCGGCATTTCCATGAAGAAAAATAAAGGATTGTCAAGCAGCTCTAATAAAGCATAAAAAAAAAAACACAAGGAAATCAACGCTGACGCAATTAACTAGTAAGCGGACTCTGATTGAGCCACTTCTTGAATCGTATGATACAGAGAAAGATGTGAAACGACAGTTTAGCCTGTTTGAAAAATTGATGAATGCCTTTGCTGCGTTGCATTAAACTGTGCAAGATGCTTTGCCTGTTGAAGAAAGAGAGAGTGATCACAAATATTGGTATTCACCAAGGTATAATGATTTTAAAGAATTTAAGAAAAGAGTTTGTGCATGGATATAAAGTGCTCCTGAAAAGGAAAGTCTTAAAGAATCTAGAATTGAACAGGATAACGTGTCTGCAAGATCAAAGAGTAGTAGTAAATCCACTGCTTCGTCTATAAGACGACAAGCTGAAGCTAAGAAAGCTGAGCCACTTGCAATTTCTTTTCTAATGCGGCTGCACGTGCAATTGGAAAGAGAAGAGCTGGAATTAAGAGCAAGAAAAGAGAAGTTAGCTATTGATACAGACATTGCTGTTTCTGAAGCTCAAATAAGAGCAATGGATTTGATGGACAATGGGCTGCAGCAACTTCCAGTTACAACTACTGAAGATAGAATGAATGAATATTTTGAATCTGCGCAGTTGGGTTCATCTGTGCTTAATGATGAAGCAGACGAAGATAGCTATGATGATGATGATGTGGAAGAAGAGGATGATGAGGAGGATAAATGCTTATTTGTGAAAGGTCAAGGAATTAAATCTAATATGACGCAAAAAAAGTACTGAAGTTGTAAATGTTCATGCAAAGACATCTGTTAGAGACACAATGCCGCCTCCAATGCGTAGACAAGAATCCACAGAGGAAAGATATCATGTAAAGGCATTACATTCTACAGGCATAGAGAAGGATCTTGTTAATGTTATGCAGTGTCAAAACAAAATAACAGAGATGTTAGTCAAAGAACAGAAATTAGCAGCCCTACCTTCAAGAGAGATTCCTGTATTTACAGGGGACCCACTAAACTACTTGACTTTTATTAGAACCTTTGAACACTGTATCGAAGATGGAACAAAGAACAATCGTGACAGACTGCTTTTTTAAGAGCAATTTACTAGTGGAAAGCCGCAAGATCTAGTAAA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Function


NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
CI01000036_02022324_02026053.mRNA False 3940 mRNA 0.39 4 2021947 2026235
TU198055 True 6076 TUCP 0.37 1 2025908 2031983

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
CI01000036_01850532_01860056 EHHADH coding downstream 161891 1850461 ~ 1860056 (-)
CI01000036_01839255_01848818 CUNH3ORF70 coding downstream 173129 1837149 ~ 1848818 (-)
CI01000036_01782319_01786637 NUP35 coding downstream 235310 1781961 ~ 1786637 (-)
CI01000036_01763171_01765280 NA coding downstream 256562 1762475 ~ 1765385 (-)
CI01000036_01611248_01620780 ZNF804A coding downstream 400558 1611119 ~ 1621389 (-)
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G174366 NA non-coding downstream 299418 1722151 ~ 1722529 (-)
G174365 NA non-coding downstream 311738 1709873 ~ 1710209 (-)
G174363 NA non-coding downstream 344989 1676588 ~ 1676958 (-)
G174320 NA non-coding downstream 355247 1664202 ~ 1666700 (-)
G174386 NA other downstream 11107 1864934 ~ 2010840 (-)
G174002 NA other downstream 746752 1274778 ~ 1275195 (-)
G173528 NA other downstream 1061570 959421 ~ 960377 (-)

Expression



Co-expression Network