G176773


Basic Information

Item Value
gene id G176773
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000037
NCBI id null
chromosome length 4612320
location 4180473 ~ 4189388 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU200784
TGATGCCTGTTCATTTCAAGGGATCATGACAAGGACCTTGTTTTCTTCTGTTGCCCTTAACACTTACAAAGCAAAACAACTATGTTATTAGACTCAAGTCACACATACCACGTCATTTAATTTGATAAATATCGTAACAGATTCAATTAAATCAAAGGCCATACTTCCTTTAATTATTGATGCAAATGCAATGCATTACATAAACAAGTCAATACCATTTACAATTTCCAGCTTGAAGTGCACAATAAATACAACATCCATATATCACAATAGGAAAATAGAGTATTTAATTCTGTACTTTATTGAATAGAGAGAATTTGTGGTGAATTTATTCATTCTAATTAAAAGTGTGGCCACACTCTCTCACGTCCTCAGGAATATGGGAAATCATTTAGCATACATGGGACAGAATTCAAAACTCTTTCACCTTTTATCAGATGTTATCATTACACTGGCTTGCACGTGCACATGCATTAATACAAAGCTCAAAGCAACATGATTTTCCAAAAAATTTAGCAAGCAAAACTGCAATATTTTCAGACATTTAAAGACTGCAGATAATGCATTTCCACTGGTATAGTGAATGCTTTGAGAAGCTGTCACGACCTCTCAGTGTTATCTGAGTGCATCTCCAGCATGGTTTAGTATTCCCACCACTGCTCTGAGCTCAGAGACCAAAGAATTGAAATTGTATAGTTCTAGTTAATCTAAATCTCTAGTTCATTCTACCAAATCATTTAACAACAATAAAAAAGAATGAGATAGAAAATATTTAATGATTTCATAATAGTATCCAAAGACTAGAGTGAAAAACAACAGTGTAGTGCTCAATCTACCTCACTGGACTTGCATCCTTTCATCGGCAGTGCAAATGTCCATCTTAAAAATGAAGGGAGAGAGCAAAATCAAGATTATATGAAACTAAACTAAGAAACTATATATTCGATCATGATACAAATATCAGAAAACCGAGTATATATATATATGATAGAACATCTTGGTTACATATGTAACCCTCGTTCCCTGAAAGAGGGGACAGAGATGTCACTTCGGTGACCGACGGATTGGGAATCTCACCAGAGAGACCAATCTACACTATATTGGCAAAAGTTTTGGGACGCCTGCCTTTACGTGCACATGAACTTTAATGACATCCCATTCTTAATCCATAGGGTTTAATATGGAGCTGGCCCACCCTTTGCAGCTATAACAGCCTCAACTCTTCTGGGAAGGCTTTCCCCAAGGTTTAGGTGTGTGTTAATAATAATCATTCTTCTAGAAGCGCATAGTGAGGTCAGGCAGTGATGTTGGCGAGAAGGCGTGGCTCACAGTCTCTGCTCTAATTCATCCCAAAGGAGTTCTATCGGGTTGAGGTCAGGACTCTGTGCAGGCCAGTCAAGTTCCTCCACACCAAACTTGCTCATCCATGTCTTTATGGACCTTGCCTTGTGCACTTGAGTGCAGTCATGTTGGAACAGAAAGGGGCCATCCCCAAACTGTTCCCACAAAGTTGGGAGCATGAAATTGTCCAAAATGTCTTGGTATGCTGAAGCATTAAGAGTTCCTTTCACTGGAACTAAGGGGCTAAGCCCAACCCCTGAAAAACAACCCTGCACCATAATCCCCCCTCCACCAATCTTTACACTTGGCACAATGCAGTCAGGCAAGTACCGTTCTCCTGGCAACCACCAAACCCAGACTCGTCCATCGGATTGCCAGACAGAGAAGCATAATTCGTCACTCCAGAGAACACGTCTCCACTGCTCTAGAGTCCAGTGGTGGCGTGCTTTACACCAGTGCATCTGACGCTTTGCATTGCACTTGGTGATGTAAGGCTTGGATGAAGCTGCTCGGCCATGGAAACCCATTCCATGAAGGTCTCTACGCACTGTTCTTGAGCTAATCTGGAAGCCACACGAAGTTTGGAGGTCTGTAGCTATTGACTCTGCAGAAAGTTGGCAACTTATGCGCACTGTGCGCCTCAGCATTCTCTGACCCCGCTCTGTGATTTTACGTGGCCTACCACTTCGTGGCTGAGTTGCTGTTGTTCCCAATTGCTTCCACTTTGTTATGATACCACTAACAGTTGACCGTGGAATATTTAGTAGTGAGGAAATTTCACGAATGGACTTATTGCACAGGTGGCAACCTATCACGGTACCACGCTTAAATTCACTGAGCTCCTGAGAGCGACCCATTCTTTCACAAATGTTTTTAGAAGCAGTCTGCATGCCTAGGTGCTAGATTTTATACACCTGTGGCCATGGAAGTGATTGGAACACCTGAATTCAATGATTTGGAGGGGTGTCCCAATACTTTTGTCAATATAGTGTACTTCGAGTGTAAACTAAACGAGCCAATGCACTTTGGCATGCGATATTTGCATCTGACTGCCACACCTTGCCGGGTGGGTATAAATAGGCAGCAGGTGCAGCGCATATCAGGTTTTCGCTGAGGATCTGAGCCAGTGACCCGGCGCCCCAGCAGTGGTACAGCAACTGTGGCACCTGGATGTGACATCTCCGTTCCCTCCTTCAGGGAAAGAGGGTTACATATGTAACCAAGACTTTCTCTTTCAGTTGGTCACGTTCAATGTCACGGCCGTGTCCGACGAATTGAGAATCCCTACCAAAGCGTCACAGGTGCTGCCCCTTCCAGCGCCCCGCGTAAGCCTGCTGAACCATCCTTGGAGATGGGACAGGGCTTATGCAGAGAGAGTCGATCACTGCTGTCTCATTAGTGAGACTTGGATAACACTAGGAAAGCGTAACCTTTCCATAGGATAAGGAACGCTGCAGAGGCCATATCCTACGATAGGGAGGTTCTAAGTGGAGTATAGACATATGGACTAACCTCGTAGGGCTGTACTGCATATTGAAGTCTCTAAGGTGGCTCTCACCCAATTTGGGAGGAGGCTACATGTGGCTCGAATGGGACTCTCTGAAGCGCTCTAAGCACCTGAGCTAAGTCCCAAGTCCCAAGAGGGTATGGAGGGAGGCCGAGGAGGATACAACCTTCTGCCCCCCCAAGGAACCTGATGACCAGGTCGTGCTTCCCTACCAACTTGCCTTCTATGGGGTTGTGATATGCAGAAATTGCAGCAACATATACTTTGAGGGTGGAGGGGTGCCCCTGAACTTGGGGGTATGCTGGGTGAACTGAATCATATAGCCGAGTCTGATGGTCTGAAGGAGCCAGCGAAATGGGCTGGAAAGCGCCAGCCAGGCTTGGACCAAGTTGGACCAAAGTAACCACAGACATACCCGTGGTGGGGCAGCAAGGTGGAATGCAGGGACCCGGCCCGGGGGGCTACGCGGCGGCCTGCAGCGGGGCCGGAGTGTGCAATGCAACACTTACCTGGTTACACAGTTGGGCAGAGGGTGTGAGAGAAGACTTGGTCATGCTCTCGAAATGCCCACTGCTGCCTGCTGGCAACAGAAGAGGAGGATGAGAGTGTTAAGGTTTTTCACCACCCACTGCTTTCCGTGCCCTCTTGGGACCCAGAAGACACGTGTTACCCTGCAAGGTGGAAGCAGTGCTCGGACACAATTGCATCACAACCGACCGCTCCCCCGGGGGGATCCACGTGTACCCCTTGGCCTCCGGGAAGAATGGGAATGAGAAACCAATCATCCAACCTCAGGGGCTCTCTCGGCGGCCCGGGCAAGCATAGCCATGAACTCTGTGTCAAACTTGGACAATGCTACCATTCCCGAAAGAGGCAACTCAGCCGAATCATCCCCAGAGAGAGTAGGCTCACACTCTGATGCACAAATCAACATCTGGTCATCGAGTGTAGCCCCGAAGGATACGACTGGTATACATCGATTAGACGGTCCAGTGCGTTCATTGGGCAGCTCTACTGGCTACAAAGCACAAGAGGGGTGAAGAGCCCTGGGAGGTTGATCACCCATGCAACTACCTGAAGTAGTCTTCGTCTGATTCCCTCCAGAATGAGAACTAGATCGAGGCAGGGGGACTGGAGTCTAGATATTAGATATTGGAGTCTACTGGAGTCTAACTCTGAGATGGTCATCTTCCTGCAGTGGGTACATGACTCATCCACGAAAGCCACCTCAGCATGCTTAATGCCCAGACACATGAGGCAGCGATCGTGACCATCCGATCACGACCACATCCAGAAACACACAGGTGGAATGTAATCTTAAAAAGACGCAACGTCACACCCGTGTAAGCTCTTTTAGGGAAATTGCTCTCTTTATTAGCGCTGAAGCGCACAGGGGGAAATGGCTGCAGCCACACTGGCAGGGATTTAGTGCAGCCTGCAGCGTGCTCACACTCTCATTGAAGATGCTCTCTCAACTGAAGGCTCTTTCTCGAGATCGTGACCACCGGTGCAGCGCCATCACACCAAAACTGAAGAGAAGAGGCTTCTTCACTGAAGAACTGGGCTCTTTTAGAAAACACTCTTTATAGATCAGAAGAGCATACAAACAAACCGCTCGACTCCAAAGCAAAAAGCTGATATGCATTGCACCTGCTGCCTATTTATACCCACGTGGCAAGGCGTGGCAGTCAGATGCAAATATTGCATGCCAATGTGCATTGGCTCATTTAGTTTACACTCGCAGTAGATTGGTCTCTCTGGCGAGATTTCCCAATTCGTTGGTCACCGACGTGAACGACTAAAAGGGAACTACTGCTGTACAGCGCAACATTTAAGTTGCATGTGCTATGAAAAAAAAATTGGTCTGTGTGATGAATAAATTTATCACAGTAGCTCCCGTATCACACAGTTTAGCATGTGAGACAGAGCAGCATATTTGAAGTGGGAATTTGTTTTGTGCTTGTGTGAGCTTAATCTAGGGCTGCACGATTGACTGAAATTAAACCAAAATCACAATTATTATTTAATTTAAACATACAGACCTGAGAATCATGGATGAGAATCAGACCTGAGAGAGTGTAATTCATGATAGCGTTTAACTGAGAGGCTGCTCACTGCAGAAATAATAAGTGGAGCTTGACGTTCAGCCACT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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU200784 True 8894 lncRNA 0.42 2 4180473 4189388

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000037_04175833_04178651 NA coding upstream 1822 4175833 ~ 4178651 (+)
CI01000037_04168194_04170478 NA coding upstream 9336 4168194 ~ 4171137 (+)
CI01000037_04080145_04081691 NA coding upstream 97667 4078481 ~ 4082806 (+)
CI01000037_04061560_04065802 NA coding upstream 114432 4061560 ~ 4066041 (+)
CI01000037_04050140_04050646 NA coding upstream 129590 4049165 ~ 4050883 (+)
CI01000037_04213179_04218057 NA coding downstream 23519 4212907 ~ 4218305 (+)
CI01000037_04240865_04265240 MAATS1 coding downstream 51235 4240623 ~ 4266261 (+)
CI01000037_04295697_04296550 NA coding downstream 106309 4295697 ~ 4297038 (+)
CI01000037_04505291_04507162 NA coding downstream 315322 4504710 ~ 4507166 (+)
CI01000037_04566454_04567634 NA coding downstream 377066 4566454 ~ 4568152 (+)
G176701 NA non-coding upstream 69023 4071869 ~ 4111450 (+)
G176723 NA non-coding upstream 80014 4099803 ~ 4100459 (+)
G176699 NA non-coding upstream 109617 4070632 ~ 4070856 (+)
G176697 NA non-coding upstream 111479 4068782 ~ 4068994 (+)
G176786 NA non-coding downstream 65700 4255088 ~ 4255537 (+)
G176768 NA non-coding downstream 91226 4280614 ~ 4281394 (+)
G176760 NA non-coding downstream 115711 4305099 ~ 4306561 (+)
G176804 NA non-coding downstream 190228 4379616 ~ 4380643 (+)
G176377 NA other upstream 1092505 2976862 ~ 3087968 (+)
G176346 NA other upstream 1340420 2839760 ~ 2840053 (+)
CI01000037_01965864_01966433 COA5, CB064 other upstream 2210082 1965603 ~ 1966435 (+)
G174949 NA other upstream 2566199 1613876 ~ 1614274 (+)

Expression


Co-expression Network