G201722



Basic Information


Item Value
gene id G201722
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000047
NCBI id null
chromosome length 7523058
location 4947630 ~ 4961291 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence


>TU228924
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Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU228924 True 13627 lncRNA 0.35 2 4947630 4961291

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
CI01000047_04890965_04891981 NA coding upstream 55499 4890965 ~ 4892131 (+)
CI01000047_04845691_04876128 LMF1 coding upstream 71502 4845691 ~ 4876128 (+)
CI01000047_04826817_04834995 NA coding upstream 112414 4826817 ~ 4835216 (+)
CI01000047_04678392_04690824 NA coding upstream 256533 4677992 ~ 4691097 (+)
CI01000047_04663268_04663847 NA coding upstream 283634 4662315 ~ 4663996 (+)
CI01000047_05058628_05074146 NA coding downstream 97052 5058343 ~ 5074374 (+)
CI01000047_05080583_05091592 NA coding downstream 118043 5079334 ~ 5091965 (+)
CI01000047_05104311_05105437 RASD1 coding downstream 142910 5104201 ~ 5105897 (+)
CI01000047_05159134_05162486 NA coding downstream 195914 5157205 ~ 5162595 (+)
CI01000047_05185698_05212150 USP22 coding downstream 224407 5185698 ~ 5212224 (+)
G201799 NA non-coding upstream 34885 4911286 ~ 4912745 (+)
G201773 NA non-coding upstream 159067 4787934 ~ 4788563 (+)
G201698 NA non-coding upstream 214041 4732326 ~ 4733589 (+)
G201669 NA non-coding upstream 223543 4648379 ~ 4724087 (+)
G201684 NA non-coding upstream 262272 4684331 ~ 4685358 (+)
G201728 NA non-coding downstream 154 4961445 ~ 4965850 (+)
G201856 NA non-coding downstream 111396 5072687 ~ 5073157 (+)
G201847 NA non-coding downstream 136294 5097585 ~ 5097981 (+)
G201848 NA non-coding downstream 147233 5108524 ~ 5109175 (+)
G201863 NA non-coding downstream 148697 5109988 ~ 5110202 (+)
G201599 NA other upstream 465173 4415813 ~ 4482457 (+)
G201387 NA other upstream 1245770 3696516 ~ 3701860 (+)
G201186 NA other upstream 1859443 3018705 ~ 3088187 (+)
G200076 NA other upstream 2369633 2520596 ~ 2577997 (+)
G200003 NA other upstream 2628668 2316863 ~ 2318962 (+)
G202382 NA other downstream 1854426 6815717 ~ 6816118 (+)

Expression



Co-expression Network