RNA id: TCONS_00011680


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00011680
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.48
exon number 1
gene id XLOC_005918
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007124.7
NCBI id CM002897.2
chromosome length 52186027
location 20026967 ~ 20027084 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GGCCACAACCATATCACCCtacagcccaagactggttacttaaTTAAAGCCAAGCAGGGCAGAGCCTGTTAAGTacatggatgggagaccacatgggaaaactaggttgctattGGAG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000118963

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00011673 lncRNA upstream 871008 19151268 ~ 19155959 (+) False XLOC_005913
TCONS_00011672 lncRNA upstream 871008 19151268 ~ 19155959 (+) True XLOC_005913
TCONS_00013584 lncRNA upstream 1612563 18394547 ~ 18414404 (+) False XLOC_005901
TCONS_00011651 lncRNA upstream 1626045 18394547 ~ 18400922 (+) False XLOC_005901
TCONS_00011647 lncRNA upstream 1669458 18356424 ~ 18357509 (+) True XLOC_005900
TCONS_00013585 lncRNA downstream 357039 20384123 ~ 20517304 (+) True XLOC_005920
TCONS_00013586 lncRNA downstream 405969 20433053 ~ 20434490 (+) False XLOC_005921
TCONS_00013587 lncRNA downstream 406029 20433113 ~ 20434490 (+) True XLOC_005921
TCONS_00011683 lncRNA downstream 680462 20707546 ~ 20788495 (+) False XLOC_005923
TCONS_00013588 lncRNA downstream 680683 20707767 ~ 20803133 (+) False XLOC_005923
TCONS_00011677 mRNA upstream 148239 19871646 ~ 19878728 (+) True XLOC_005916
TCONS_00011676 mRNA upstream 699310 19322686 ~ 19327657 (+) True XLOC_005915
TCONS_00011674 mRNA upstream 709398 19283936 ~ 19317569 (+) False XLOC_005914
TCONS_00011669 mRNA upstream 1243482 18701906 ~ 18783485 (+) False XLOC_005911
TCONS_00011670 mRNA upstream 1297725 18701973 ~ 18729242 (+) True XLOC_005911
TCONS_00011682 mRNA downstream 497837 20524921 ~ 20534948 (+) True XLOC_005922
TCONS_00011685 mRNA downstream 1573862 21600946 ~ 21621856 (+) False XLOC_005926
TCONS_00011686 mRNA downstream 1574065 21601149 ~ 21621853 (+) False XLOC_005926
TCONS_00011688 mRNA downstream 1647361 21674445 ~ 21682873 (+) False XLOC_005927
TCONS_00011689 mRNA downstream 1647366 21674450 ~ 21682874 (+) False XLOC_005927
TCONS_00011675 other upstream 710197 19305824 ~ 19316770 (+) True XLOC_005914
TCONS_00011671 other upstream 1317604 18709249 ~ 18709363 (+) True XLOC_005912
TCONS_00011652 other upstream 1612563 18400901 ~ 18414404 (+) True XLOC_005901
TCONS_00011650 other upstream 1644562 18382289 ~ 18382405 (+) True XLOC_005902
TCONS_00011638 other upstream 1702502 18311512 ~ 18324465 (+) False XLOC_005899
TCONS_00011681 other downstream 221809 20248893 ~ 20249009 (+) True XLOC_005919
TCONS_00011687 other downstream 1582623 21609707 ~ 21621590 (+) True XLOC_005926
TCONS_00011702 other downstream 1847026 21874110 ~ 21885557 (+) True XLOC_005931
TCONS_00011703 other downstream 1861130 21888214 ~ 22095934 (+) False XLOC_005932
TCONS_00011706 other downstream 2023099 22050183 ~ 22050309 (+) True XLOC_005933