RNA id: TU25632


Basic Information

Item Value
RNA id TU25632
length 18881
RNA type TUCP
GC content 0.43
exon number 2
gene id G22716
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000003
NCBI id null
chromosome length 2831192
location 50512 ~ 69744 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome
species grasscarp
(Ctenopharyngodon idella)

Sequence

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Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU25646 lncRNA upstream 51936 121680 ~ 128260 (-) True G22728
TU25629 lncRNA upstream 83898 153642 ~ 188379 (-) True G22713
TU25649 lncRNA upstream 196610 266354 ~ 266732 (-) True G22731
TU25651 lncRNA upstream 197446 267190 ~ 267442 (-) True G22733
TU25652 lncRNA upstream 223260 293004 ~ 293209 (-) True G22734
CI01000003_00074301_00075497.mRNA mRNA upstream 4557 74301 ~ 75497 (-) True CI01000003_00074301_00075497
CI01000003_00076297_00077678.mRNA mRNA upstream 6526 76270 ~ 77800 (-) True CI01000003_00076297_00077678
CI01000003_00196906_00197323.mRNA mRNA upstream 127001 196745 ~ 197323 (-) True CI01000003_00196906_00197323
CI01000003_00228735_00265553.mRNA mRNA upstream 158924 228668 ~ 265553 (-) True CI01000003_00228735_00265553
CI01000003_00301515_00302754.mRNA mRNA upstream 231771 301515 ~ 302902 (-) True CI01000003_00301515_00302754

Expression Profile


Homologous

species RNA id representative length rna type GC content exon number chromosome id location
zebrafish (Danio rerio) TCONS_00064690 True 3271 lncRNA 0.39 2 NC_007117.7 50825233 ~ 50832346 (+)